Genomisk og proteomisk undersøgelse af Richters syndrom (CGPSR) (CGPSR)
23. marts 2023 opdateret af: Central Hospital, Nancy, France
Genomisk og proteomisk undersøgelse af Richters syndrom
Biologisk undersøgelse af Richter Syndrom (RS), et aggressivt lymfom, der opstår fra kronisk lymfatisk leukæmi (CLL). RS har det samme histologiske aspekt som primitivt diffust stort B-celle lymfom (DLBCL), men er forbundet med en dårlig prognose på grund af kemoreraktoritet.
Denne undersøgelse har til formål at forstå de biologiske determinanter for kemoterapiresistens i Richters syndrom.
Studieoversigt
Status
Rekruttering
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Med hjælp fra den franske nationale forskningsgruppe om CLL (FILO / French Innovative Leukemia Organisation) indsamler efterforskerne i øjeblikket friske frosne cellepelleter på CLL-stadiet og lymfeknudebiopsier på Richter-stadiet. Forskerne indsamlede også lymfeknudebiopsier fra DLBCL som referencegruppe.
Forskerne vil udføre genomiske og proteomiske komparative undersøgelser mellem CLL og Richter, såvel som mellem Richter og primitiv DLBCL, for at forstå de biologiske determinanter for klonal evolution og kemoreraktoritet af Richter Syndrom.
Undersøgelsestype
Observationel
Tilmelding (Forventet)
170
Kontakter og lokationer
Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.
Studiekontakt
- Navn: Julien Broseus, MD, PhD
- Telefonnummer: + 33 (0)3 83 15 49 14
- E-mail: j.broseus@chru-nancy.fr
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Véronique Saunier
- Telefonnummer: + 33 (0)3 83 15 54 58
- E-mail: v.saunier@chru-nancy.fr
Studiesteder
-
-
-
Nancy, Frankrig, 54035
- Rekruttering
- CHRU de Nancy
-
Kontakt:
- Véronique SAUNIER
- Telefonnummer: +33 (0)3 83 15 54 58
- E-mail: v.saunier@chru-nancy.fr
-
Ledende efterforsker:
- Julien Broséus, MD, PhD
-
Underforsker:
- Pierre Feugier, MD, PhD
-
-
Deltagelseskriterier
Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Ja
Køn, der er berettiget til at studere
Alle
Prøveudtagningsmetode
Ikke-sandsynlighedsprøve
Studiebefolkning
- Diagnose af diffust stort B-cellet lymfom, der opstår i forbindelse med en kronisk lymfatisk leukæmi (gruppe 1).
- Diagnose af diffust stort B-cellet lymfom de novo (gruppe 2).
- Diagnose af diffust stort B-cellet lymfom, der opstår i en sammenhæng med småcellet lymfom, ekskl. CLL (gruppe 3).
- Patienter, der havde gavn af en diagnostisk lymfeknudebiopsi, der ikke afslørede nogen tumorinvolvering (primitiv eller metastatisk) (gruppe 4).
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Diagnose af et diffust stort B-cellet lymfom, der opstår i forbindelse med en kronisk lymfatisk leukæmi (gruppe 1) eller diagnose af et primitivt diffust stort B-cellet lymfom (gruppe 2), eller diagnose af et diffust stort B-cellet lymfom, der opstår i en kontekst af småcellet lymfom, ekskluderende CLL (gruppe 3), eller drage fordel af en diagnostisk lymfeknudebiopsi, der ikke afslørede nogen tumorinvolvering (primitiv eller metastatisk) (gruppe 4).
- Patienter skal have gavn af en lymfeknudebiopsi ved diagnose.
- Patienter skal følges af et FILO-medlem (French Innovative Leukemia Organisation).
- Histologi af diffust storcellet B-celle lymfom eller Hodgkin histologi.
- Egnede kliniske data tilgængelige.
- Prøver skal opfylde følgende krav:RIN (RNA-integritetsnummer) > 5 og DIN (DNA-integritetsnummer) > 6.5.
Ekskluderingskriterier:
• Prøver, der ikke opfylder inklusionskriterierne (utilstrækkelige kliniske data, analyse umulig på grund af utilstrækkelig prøvekvalitet).
Studieplan
Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kohorte
- Tidsperspektiver: Tilbagevirkende kraft
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Richters syndrom ved diagnose
patienter diagnosticeret med Richter Syndrom, for hvem en passende lymfeknudebiopsi er tilgængelig ved diagnosen.
|
Retrospektiv biologisk udforskning af prøverne, herunder tumor-DNA-udforskning.
Karakterisering af tumor transkriptomisk profil.
Karakterisering af tumorproteomiske profiler.
|
|
Primitivt diffust stort B-cellet lymfom
patienter diagnosticeret med et primitivt stort B-cellet lymfom, for hvem en passende lymfeknudebiopsi er tilgængelig ved diagnosen.
|
Retrospektiv biologisk udforskning af prøverne, herunder tumor-DNA-udforskning.
Karakterisering af tumor transkriptomisk profil.
Karakterisering af tumorproteomiske profiler.
|
|
Andet sekundært diffust stort B-cellet lymfom
patienter diagnosticeret med et sekundært stort B-cellet lymfom (forskelligt fra Richter Syndrom), for hvem en passende lymfeknudebiopsi er tilgængelig ved diagnosen.
|
Retrospektiv biologisk udforskning af prøverne, herunder tumor-DNA-udforskning.
Karakterisering af tumor transkriptomisk profil.
Karakterisering af tumorproteomiske profiler.
|
|
Kontrolgruppe uden tumorinvolvering af lymfeknuder
patienter, for hvem der er udført en diagnostisk lymfeknudebiopsi, som ikke konkluderede med involvering af tumorlymfeknuder.
|
Retrospektiv biologisk udforskning af prøverne, herunder tumor-DNA-udforskning.
Karakterisering af tumor transkriptomisk profil.
Karakterisering af tumorproteomiske profiler.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Hele exome-sekventeringsdata ved hjælp af næste generations sekventeringsmetode
Tidsramme: 3 år
|
Sammenligning mellem DNA-sekvenserne fra Richter syndrom-prøver og DNA-sekvenser fra primitive DLBCL-prøver for at identificere et sæt mutationer, der er specifikke for Richter syndrom. For hver position er resultatet "muteret" eller "umuteret". |
3 år
|
|
RNA-sekventeringsdata ved hjælp af næste generations sekventeringsmetode
Tidsramme: 3 år
|
Måling af genekspression for alle gener. Sammenligning af disse ekspressionsniveauer mellem Richter-prøver, primitive DLBCL-prøver og normale lymfeknuder for at identificere et sæt gener, hvis ekspressionsniveauer er forskellige i Richter-prøver sammenlignet med primitive DLBCL og normale lymfeknuder. Genekspression er en kvatitativ værdi. Dette sæt gener danner en specifik "transkriptomisk signatur" af Richters syndrom. |
3 år
|
|
Proteomisk analyse ved hjælp af massespektrometri
Tidsramme: 3 år
|
Massespektrometri tillader identifikation og måling af ekspressionsniveauet af de 5.000 mest udtrykte proteiner i en prøve. Efterforskerne ønsker at sammenligne proteinekspressionsniveauerne mellem Richter-prøver, primitive DLBCL-prøver og normale lymfeknuder for at identificere et sæt proteiner, der er højt udtrykt i Richter-prøver (men ikke i primitive DLBCL eller normale lymfeknuder). Dette sæt af proteiner danner en specifik "proteomisk signatur" af Richter. Proteinekspression er en kvatitativ værdi udtrykt som et absolut antal kopier i en celle. |
3 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.
Sponsor
Samarbejdspartnere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Julien Broseus, MD, PhD, Central Hospital, Nancy, France
- Studieleder: Pierre Feugier, MD, PhD, Central Hospital, Nancy, France
Publikationer og nyttige links
Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.
Generelle publikationer
- Rossi D, Spina V, Forconi F, Capello D, Fangazio M, Rasi S, Martini M, Gattei V, Ramponi A, Larocca LM, Bertoni F, Gaidano G. Molecular history of Richter syndrome: origin from a cell already present at the time of chronic lymphocytic leukemia diagnosis. Int J Cancer. 2012 Jun 15;130(12):3006-10. doi: 10.1002/ijc.26322. Epub 2011 Aug 25.
- Ferreira PG, Jares P, Rico D, Gomez-Lopez G, Martinez-Trillos A, Villamor N, Ecker S, Gonzalez-Perez A, Knowles DG, Monlong J, Johnson R, Quesada V, Djebali S, Papasaikas P, Lopez-Guerra M, Colomer D, Royo C, Cazorla M, Pinyol M, Clot G, Aymerich M, Rozman M, Kulis M, Tamborero D, Gouin A, Blanc J, Gut M, Gut I, Puente XS, Pisano DG, Martin-Subero JI, Lopez-Bigas N, Lopez-Guillermo A, Valencia A, Lopez-Otin C, Campo E, Guigo R. Transcriptome characterization by RNA sequencing identifies a major molecular and clinical subdivision in chronic lymphocytic leukemia. Genome Res. 2014 Feb;24(2):212-26. doi: 10.1101/gr.152132.112. Epub 2013 Nov 21.
- Rossi D, Cerri M, Capello D, Deambrogi C, Rossi FM, Zucchetto A, De Paoli L, Cresta S, Rasi S, Spina V, Franceschetti S, Lunghi M, Vendramin C, Bomben R, Ramponi A, Monga G, Conconi A, Magnani C, Gattei V, Gaidano G. Biological and clinical risk factors of chronic lymphocytic leukaemia transformation to Richter syndrome. Br J Haematol. 2008 Jun;142(2):202-15. doi: 10.1111/j.1365-2141.2008.07166.x. Epub 2008 May 19.
- Parikh SA, Rabe KG, Call TG, Zent CS, Habermann TM, Ding W, Leis JF, Schwager SM, Hanson CA, Macon WR, Kay NE, Slager SL, Shanafelt TD. Diffuse large B-cell lymphoma (Richter syndrome) in patients with chronic lymphocytic leukaemia (CLL): a cohort study of newly diagnosed patients. Br J Haematol. 2013 Sep;162(6):774-82. doi: 10.1111/bjh.12458. Epub 2013 Jul 11.
- Rossi D, Spina V, Deambrogi C, Rasi S, Laurenti L, Stamatopoulos K, Arcaini L, Lucioni M, Rocque GB, Xu-Monette ZY, Visco C, Chang J, Chigrinova E, Forconi F, Marasca R, Besson C, Papadaki T, Paulli M, Larocca LM, Pileri SA, Gattei V, Bertoni F, Foa R, Young KH, Gaidano G. The genetics of Richter syndrome reveals disease heterogeneity and predicts survival after transformation. Blood. 2011 Mar 24;117(12):3391-401. doi: 10.1182/blood-2010-09-302174. Epub 2011 Jan 25.
- Fangazio M, De Paoli L, Rossi D, Gaidano G. Predictive markers and driving factors behind Richter syndrome development. Expert Rev Anticancer Ther. 2011 Mar;11(3):433-42. doi: 10.1586/era.10.237.
- Rossi D, Rasi S, Spina V, Fangazio M, Monti S, Greco M, Ciardullo C, Fama R, Cresta S, Bruscaggin A, Laurenti L, Martini M, Musto P, Forconi F, Marasca R, Larocca LM, Foa R, Gaidano G. Different impact of NOTCH1 and SF3B1 mutations on the risk of chronic lymphocytic leukemia transformation to Richter syndrome. Br J Haematol. 2012 Aug;158(3):426-9. doi: 10.1111/j.1365-2141.2012.09155.x. Epub 2012 May 10. No abstract available.
- Fabbri G, Rasi S, Rossi D, Trifonov V, Khiabanian H, Ma J, Grunn A, Fangazio M, Capello D, Monti S, Cresta S, Gargiulo E, Forconi F, Guarini A, Arcaini L, Paulli M, Laurenti L, Larocca LM, Marasca R, Gattei V, Oscier D, Bertoni F, Mullighan CG, Foa R, Pasqualucci L, Rabadan R, Dalla-Favera R, Gaidano G. Analysis of the chronic lymphocytic leukemia coding genome: role of NOTCH1 mutational activation. J Exp Med. 2011 Jul 4;208(7):1389-401. doi: 10.1084/jem.20110921. Epub 2011 Jun 13.
- Chigrinova E, Rinaldi A, Kwee I, Rossi D, Rancoita PM, Strefford JC, Oscier D, Stamatopoulos K, Papadaki T, Berger F, Young KH, Murray F, Rosenquist R, Greiner TC, Chan WC, Orlandi EM, Lucioni M, Marasca R, Inghirami G, Ladetto M, Forconi F, Cogliatti S, Votavova H, Swerdlow SH, Stilgenbauer S, Piris MA, Matolcsy A, Spagnolo D, Nikitin E, Zamo A, Gattei V, Bhagat G, Ott G, Zucca E, Gaidano G, Bertoni F. Two main genetic pathways lead to the transformation of chronic lymphocytic leukemia to Richter syndrome. Blood. 2013 Oct 10;122(15):2673-82. doi: 10.1182/blood-2013-03-489518. Epub 2013 Sep 4.
- Scandurra M, Rossi D, Deambrogi C, Rancoita PM, Chigrinova E, Mian M, Cerri M, Rasi S, Sozzi E, Forconi F, Ponzoni M, Moreno SM, Piris MA, Inghirami G, Zucca E, Gattei V, Rinaldi A, Kwee I, Gaidano G, Bertoni F. Genomic profiling of Richter's syndrome: recurrent lesions and differences with de novo diffuse large B-cell lymphomas. Hematol Oncol. 2010 Jun;28(2):62-7. doi: 10.1002/hon.932.
- Fabbri G, Khiabanian H, Holmes AB, Wang J, Messina M, Mullighan CG, Pasqualucci L, Rabadan R, Dalla-Favera R. Genetic lesions associated with chronic lymphocytic leukemia transformation to Richter syndrome. J Exp Med. 2013 Oct 21;210(11):2273-88. doi: 10.1084/jem.20131448. Epub 2013 Oct 14.
- Alizadeh AA, Eisen MB, Davis RE, Ma C, Lossos IS, Rosenwald A, Boldrick JC, Sabet H, Tran T, Yu X, Powell JI, Yang L, Marti GE, Moore T, Hudson J Jr, Lu L, Lewis DB, Tibshirani R, Sherlock G, Chan WC, Greiner TC, Weisenburger DD, Armitage JO, Warnke R, Levy R, Wilson W, Grever MR, Byrd JC, Botstein D, Brown PO, Staudt LM. Distinct types of diffuse large B-cell lymphoma identified by gene expression profiling. Nature. 2000 Feb 3;403(6769):503-11. doi: 10.1038/35000501.
- Moulin C, Guillemin F, Remen T, Bouclet F, Hergalant S, Quinquenel A, Dartigeas C, Tausch E, Lazarian G, Blanchet O, Lomazzi S, Chapiro E, Schneider C, Nguyen-Khac F, Davi F, Hunault M, Tomowiak C, Roos-Weil D, Siebert R, Thieblemont C, Cymbalista F, Laribi K, Bene MC, Stilgenbauer S, Guieze R, Feugier P, Broseus J. Clinical, biological, and molecular genetic features of Richter syndrome and prognostic significance: A study of the French Innovative Leukemia Organization. Am J Hematol. 2021 Sep 1;96(9):E311-E314. doi: 10.1002/ajh.26239. Epub 2021 Jun 2. No abstract available.
Datoer for undersøgelser
Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
6. september 2017
Primær færdiggørelse (Forventet)
31. december 2023
Studieafslutning (Forventet)
5. september 2024
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
19. juli 2018
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
2. august 2018
Først opslået (Faktiske)
8. august 2018
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
24. marts 2023
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
23. marts 2023
Sidst verificeret
1. marts 2023
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 2017-A01978-45
- PSS2017/CGPSR-BROSÉUS/VS (Anden identifikator: CHRU Nancy)
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
INGEN
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Ingen
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Ingen
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .