Richterin oireyhtymän genominen ja proteominen tutkimus (CGPSR) (CGPSR)
torstai 23. maaliskuuta 2023 päivittänyt: Central Hospital, Nancy, France
Richterin oireyhtymän genominen ja proteominen tutkimus
Biologinen tutkimus Richterin oireyhtymästä (RS), aggressiivisesta lymfoomasta, joka johtuu kroonisesta lymfosyyttileukemiasta (CLL). RS:llä on samat histologiset piirteet kuin primitiivinen diffuusi suuri B-solulymfooma (DLBCL), mutta siihen liittyy huono ennuste kemorefraktiivisuuden vuoksi.
Tämän tutkimuksen tavoitteena on ymmärtää kemoterapiaresistenssin biologisia tekijöitä Richterin oireyhtymässä.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Rekrytointi
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Ranskan kansallisen CLL-tutkimusryhmän (FILO / French Innovative Leukemia Organization) avulla tutkijat keräävät parhaillaan tuoreita pakastettuja solupellettejä CLL-vaiheessa ja imusolmukkeiden biopsioita Richter-vaiheessa. Tutkijat keräsivät myös imusolmukkeiden biopsiat DLBCL:stä vertailuryhmänä.
Tutkijat suorittavat genomisia ja proteomisia vertailevia tutkimuksia CLL:n ja Richterin sekä Richterin ja primitiivisen DLBCL:n välillä ymmärtääkseen klonaalisen evoluution ja Richterin oireyhtymän kemorefraktiivisuuden biologisia tekijöitä.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Odotettu)
170
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskeluyhteys
- Nimi: Julien Broseus, MD, PhD
- Puhelinnumero: + 33 (0)3 83 15 49 14
- Sähköposti: j.broseus@chru-nancy.fr
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Véronique Saunier
- Puhelinnumero: + 33 (0)3 83 15 54 58
- Sähköposti: v.saunier@chru-nancy.fr
Opiskelupaikat
-
-
-
Nancy, Ranska, 54035
- Rekrytointi
- CHRU de Nancy
-
Ottaa yhteyttä:
- Véronique SAUNIER
- Puhelinnumero: +33 (0)3 83 15 54 58
- Sähköposti: v.saunier@chru-nancy.fr
-
Päätutkija:
- Julien Broséus, MD, PhD
-
Alatutkija:
- Pierre Feugier, MD, PhD
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Joo
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Kaikki
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
- Kroonisen lymfosyyttisen leukemian (ryhmä 1) yhteydessä syntyneen diffuusin suuren B-solulymfooman diagnoosi.
- Diffuusi suurten B-solujen lymfooman de novo (ryhmä 2) diagnoosi.
- Diffuusi suurten B-solujen lymfooman diagnoosi, joka syntyy pienisoluisen lymfooman yhteydessä, lukuun ottamatta CLL:ää (ryhmä 3).
- Potilaat, jotka hyötyivät diagnostisesta imusolmukebiopsiasta, joka ei paljastanut mitään kasvainta (primitiivistä tai metastaattista) (ryhmä 4).
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Kroonisen lymfosyyttisen leukemian (ryhmä 1) yhteydessä syntyneen diffuusin suuren B-solulymfooman diagnoosi tai primitiivisen diffuusin suuren B-solulymfooman (ryhmä 2) diagnoosi tai pienisoluinen lymfooma, lukuun ottamatta CLL:ää (ryhmä 3), tai hyötyä diagnostisesta imusolmukebiopsiasta, joka ei paljastanut mitään kasvainta (primitiivistä tai metastaattista) (ryhmä 4).
- Potilaiden on hyödyttävä imusolmukebiopsiasta diagnoosin yhteydessä.
- Potilaiden tulee seurata FILOn (French Innovative Leukemia Organisation) jäsen
- Diffuusi suurten B-solujen lymfooman histologia tai Hodgkinin histologia.
- Sopivia kliinisiä tietoja saatavilla.
- Näytteiden on täytettävä seuraavat vaatimukset: RIN (RNA Integrity Number) > 5 et DIN (DNA Integrity Number) > 6.5.
Poissulkemiskriteerit:
• Näytteet, jotka eivät täytä sisällyttämiskriteerejä (riittämättömät kliiniset tiedot, analysointi mahdotonta riittämättömän näytteen laadun vuoksi).
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Kohortti
- Aikanäkymät: Takautuva
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Richterin oireyhtymä diagnoosin yhteydessä
potilaat, joilla on diagnosoitu Richterin oireyhtymä, joille diagnoosin yhteydessä on saatavilla sopiva imusolmukebiopsia.
|
Näytteiden retrospektiivinen biologinen tutkimus, mukaan lukien kasvain-DNA-tutkimus.
Kasvaimen transkriptomisen profiilin karakterisointi.
Kasvaimen proteomisten profiilien karakterisointi.
|
|
Primitiivinen diffuusi suuri B-solulymfooma
potilaat, joilla on diagnosoitu primitiivinen suuri B-solulymfooma, joille diagnoosin yhteydessä on saatavilla sopiva imusolmukebiopsia.
|
Näytteiden retrospektiivinen biologinen tutkimus, mukaan lukien kasvain-DNA-tutkimus.
Kasvaimen transkriptomisen profiilin karakterisointi.
Kasvaimen proteomisten profiilien karakterisointi.
|
|
Muu sekundaarinen diffuusi suuri B-solulymfooma
potilaat, joilla on diagnosoitu toissijainen suurten B-solujen lymfooma (eri kuin Richterin oireyhtymä), joille diagnoosin yhteydessä on saatavilla sopiva imusolmukebiopsia.
|
Näytteiden retrospektiivinen biologinen tutkimus, mukaan lukien kasvain-DNA-tutkimus.
Kasvaimen transkriptomisen profiilin karakterisointi.
Kasvaimen proteomisten profiilien karakterisointi.
|
|
Kontrolliryhmä, jossa ei ole imusolmukkeiden kasvainta
potilaat, joille on tehty diagnostinen imusolmukebiopsia, joka ei päätellyt kasvaimen imusolmukkeiden osallisuutta.
|
Näytteiden retrospektiivinen biologinen tutkimus, mukaan lukien kasvain-DNA-tutkimus.
Kasvaimen transkriptomisen profiilin karakterisointi.
Kasvaimen proteomisten profiilien karakterisointi.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Koko exome-sekvensointidata seuraavan sukupolven sekvensointimenetelmällä
Aikaikkuna: 3 vuotta
|
Richterin oireyhtymän näytteistä saatujen DNA-sekvenssien ja primitiivisten DLBCL-näytteiden DNA-sekvenssien vertailu Richterin oireyhtymälle spesifisten mutaatioiden tunnistamiseksi. Jokaisen sijainnin tulos on "mutatoitu" tai "mutatoitumaton". |
3 vuotta
|
|
RNA-sekvensointitiedot seuraavan sukupolven sekvensointimenetelmällä
Aikaikkuna: 3 vuotta
|
Geeniekspression mittaus kaikille geeneille. Näiden ilmentymistasojen vertailu Richter-näytteiden, primitiivisten DLBCL-näytteiden ja normaaleiden imusolmukkeiden välillä geenien joukon tunnistamiseksi, joiden ilmentymistasot ovat erilaiset Richter-näytteissä verrattuna primitiivisiin DLBCL- ja normaaleihin imusolmukkeisiin. Geenien ilmentyminen on määrällinen arvo. Tämä geenisarja muodostaa Richterin oireyhtymän erityisen "transkriptomisen allekirjoituksen". |
3 vuotta
|
|
Proteominen analyysi massaspektrometrialla
Aikaikkuna: 3 vuotta
|
Massaspektrometria mahdollistaa näytteen 5 000 eniten ilmentyvän proteiinin identifioinnin ja ekspressiotason mittaamisen. Tutkijat haluavat verrata proteiinien ilmentymistasoja Richter-näytteiden, primitiivisten DLBCL-näytteiden ja normaalien imusolmukkeiden välillä tunnistaakseen joukon proteiineja, jotka ilmentyvät voimakkaasti Richter-näytteissä (mutta ei primitiivisissä DLBCL- tai normaaleissa imusolmukkeissa). Tämä proteiinisarja muodostaa Richterin spesifisen "proteomisen allekirjoituksen". Proteiinin ilmentyminen on kvantitatiivinen arvo, joka ilmaistaan solussa olevien kopioiden absoluuttisena lukumääränä. |
3 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Julien Broseus, MD, PhD, Central Hospital, Nancy, France
- Opintojohtaja: Pierre Feugier, MD, PhD, Central Hospital, Nancy, France
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- Rossi D, Spina V, Forconi F, Capello D, Fangazio M, Rasi S, Martini M, Gattei V, Ramponi A, Larocca LM, Bertoni F, Gaidano G. Molecular history of Richter syndrome: origin from a cell already present at the time of chronic lymphocytic leukemia diagnosis. Int J Cancer. 2012 Jun 15;130(12):3006-10. doi: 10.1002/ijc.26322. Epub 2011 Aug 25.
- Ferreira PG, Jares P, Rico D, Gomez-Lopez G, Martinez-Trillos A, Villamor N, Ecker S, Gonzalez-Perez A, Knowles DG, Monlong J, Johnson R, Quesada V, Djebali S, Papasaikas P, Lopez-Guerra M, Colomer D, Royo C, Cazorla M, Pinyol M, Clot G, Aymerich M, Rozman M, Kulis M, Tamborero D, Gouin A, Blanc J, Gut M, Gut I, Puente XS, Pisano DG, Martin-Subero JI, Lopez-Bigas N, Lopez-Guillermo A, Valencia A, Lopez-Otin C, Campo E, Guigo R. Transcriptome characterization by RNA sequencing identifies a major molecular and clinical subdivision in chronic lymphocytic leukemia. Genome Res. 2014 Feb;24(2):212-26. doi: 10.1101/gr.152132.112. Epub 2013 Nov 21.
- Rossi D, Cerri M, Capello D, Deambrogi C, Rossi FM, Zucchetto A, De Paoli L, Cresta S, Rasi S, Spina V, Franceschetti S, Lunghi M, Vendramin C, Bomben R, Ramponi A, Monga G, Conconi A, Magnani C, Gattei V, Gaidano G. Biological and clinical risk factors of chronic lymphocytic leukaemia transformation to Richter syndrome. Br J Haematol. 2008 Jun;142(2):202-15. doi: 10.1111/j.1365-2141.2008.07166.x. Epub 2008 May 19.
- Parikh SA, Rabe KG, Call TG, Zent CS, Habermann TM, Ding W, Leis JF, Schwager SM, Hanson CA, Macon WR, Kay NE, Slager SL, Shanafelt TD. Diffuse large B-cell lymphoma (Richter syndrome) in patients with chronic lymphocytic leukaemia (CLL): a cohort study of newly diagnosed patients. Br J Haematol. 2013 Sep;162(6):774-82. doi: 10.1111/bjh.12458. Epub 2013 Jul 11.
- Rossi D, Spina V, Deambrogi C, Rasi S, Laurenti L, Stamatopoulos K, Arcaini L, Lucioni M, Rocque GB, Xu-Monette ZY, Visco C, Chang J, Chigrinova E, Forconi F, Marasca R, Besson C, Papadaki T, Paulli M, Larocca LM, Pileri SA, Gattei V, Bertoni F, Foa R, Young KH, Gaidano G. The genetics of Richter syndrome reveals disease heterogeneity and predicts survival after transformation. Blood. 2011 Mar 24;117(12):3391-401. doi: 10.1182/blood-2010-09-302174. Epub 2011 Jan 25.
- Fangazio M, De Paoli L, Rossi D, Gaidano G. Predictive markers and driving factors behind Richter syndrome development. Expert Rev Anticancer Ther. 2011 Mar;11(3):433-42. doi: 10.1586/era.10.237.
- Rossi D, Rasi S, Spina V, Fangazio M, Monti S, Greco M, Ciardullo C, Fama R, Cresta S, Bruscaggin A, Laurenti L, Martini M, Musto P, Forconi F, Marasca R, Larocca LM, Foa R, Gaidano G. Different impact of NOTCH1 and SF3B1 mutations on the risk of chronic lymphocytic leukemia transformation to Richter syndrome. Br J Haematol. 2012 Aug;158(3):426-9. doi: 10.1111/j.1365-2141.2012.09155.x. Epub 2012 May 10. No abstract available.
- Fabbri G, Rasi S, Rossi D, Trifonov V, Khiabanian H, Ma J, Grunn A, Fangazio M, Capello D, Monti S, Cresta S, Gargiulo E, Forconi F, Guarini A, Arcaini L, Paulli M, Laurenti L, Larocca LM, Marasca R, Gattei V, Oscier D, Bertoni F, Mullighan CG, Foa R, Pasqualucci L, Rabadan R, Dalla-Favera R, Gaidano G. Analysis of the chronic lymphocytic leukemia coding genome: role of NOTCH1 mutational activation. J Exp Med. 2011 Jul 4;208(7):1389-401. doi: 10.1084/jem.20110921. Epub 2011 Jun 13.
- Chigrinova E, Rinaldi A, Kwee I, Rossi D, Rancoita PM, Strefford JC, Oscier D, Stamatopoulos K, Papadaki T, Berger F, Young KH, Murray F, Rosenquist R, Greiner TC, Chan WC, Orlandi EM, Lucioni M, Marasca R, Inghirami G, Ladetto M, Forconi F, Cogliatti S, Votavova H, Swerdlow SH, Stilgenbauer S, Piris MA, Matolcsy A, Spagnolo D, Nikitin E, Zamo A, Gattei V, Bhagat G, Ott G, Zucca E, Gaidano G, Bertoni F. Two main genetic pathways lead to the transformation of chronic lymphocytic leukemia to Richter syndrome. Blood. 2013 Oct 10;122(15):2673-82. doi: 10.1182/blood-2013-03-489518. Epub 2013 Sep 4.
- Scandurra M, Rossi D, Deambrogi C, Rancoita PM, Chigrinova E, Mian M, Cerri M, Rasi S, Sozzi E, Forconi F, Ponzoni M, Moreno SM, Piris MA, Inghirami G, Zucca E, Gattei V, Rinaldi A, Kwee I, Gaidano G, Bertoni F. Genomic profiling of Richter's syndrome: recurrent lesions and differences with de novo diffuse large B-cell lymphomas. Hematol Oncol. 2010 Jun;28(2):62-7. doi: 10.1002/hon.932.
- Fabbri G, Khiabanian H, Holmes AB, Wang J, Messina M, Mullighan CG, Pasqualucci L, Rabadan R, Dalla-Favera R. Genetic lesions associated with chronic lymphocytic leukemia transformation to Richter syndrome. J Exp Med. 2013 Oct 21;210(11):2273-88. doi: 10.1084/jem.20131448. Epub 2013 Oct 14.
- Alizadeh AA, Eisen MB, Davis RE, Ma C, Lossos IS, Rosenwald A, Boldrick JC, Sabet H, Tran T, Yu X, Powell JI, Yang L, Marti GE, Moore T, Hudson J Jr, Lu L, Lewis DB, Tibshirani R, Sherlock G, Chan WC, Greiner TC, Weisenburger DD, Armitage JO, Warnke R, Levy R, Wilson W, Grever MR, Byrd JC, Botstein D, Brown PO, Staudt LM. Distinct types of diffuse large B-cell lymphoma identified by gene expression profiling. Nature. 2000 Feb 3;403(6769):503-11. doi: 10.1038/35000501.
- Moulin C, Guillemin F, Remen T, Bouclet F, Hergalant S, Quinquenel A, Dartigeas C, Tausch E, Lazarian G, Blanchet O, Lomazzi S, Chapiro E, Schneider C, Nguyen-Khac F, Davi F, Hunault M, Tomowiak C, Roos-Weil D, Siebert R, Thieblemont C, Cymbalista F, Laribi K, Bene MC, Stilgenbauer S, Guieze R, Feugier P, Broseus J. Clinical, biological, and molecular genetic features of Richter syndrome and prognostic significance: A study of the French Innovative Leukemia Organization. Am J Hematol. 2021 Sep 1;96(9):E311-E314. doi: 10.1002/ajh.26239. Epub 2021 Jun 2. No abstract available.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Keskiviikko 6. syyskuuta 2017
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Sunnuntai 31. joulukuuta 2023
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Torstai 5. syyskuuta 2024
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Torstai 19. heinäkuuta 2018
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Torstai 2. elokuuta 2018
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Keskiviikko 8. elokuuta 2018
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Perjantai 24. maaliskuuta 2023
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Torstai 23. maaliskuuta 2023
Viimeksi vahvistettu
Keskiviikko 1. maaliskuuta 2023
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 2017-A01978-45
- PSS2017/CGPSR-BROSÉUS/VS (Muu tunniste: CHRU Nancy)
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
EI
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Koko eksomin sekvensointi.
-
Hospices Civils de LyonTuntematon
-
Good Samaritan Hospital Medical Center, New YorkTuntematonMetastaattinen aivosyöpäYhdysvallat
-
Imperial College London Diabetes CentreTuntematonMendelin häiriöt | Geneettinen häiriö | Uusi mutaatio | Perinnöllinen häiriö | De Novo -mutaatio | Perinnöllinen sairaus | Yhden geenin viatYhdistyneet Arabiemiirikunnat
-
ReprogeneticsReproductive Medicine Lab, LLCTuntematon
-
Charles (Chuck) RaisonPeruutettu
-
Lawson Health Research InstituteOntario Institute for Cancer ResearchValmisMetastaasi primaarisen syövän aivoihinKanada
-
Peking Union Medical CollegeTuntematonNaisen rintojen kasvain | Mutaatio | TerapeutiikkaKiina
-
University of MiamiHyperVibe Pty LtdPeruutettuKehon koostumus, hyödyllinen | Fyysinen kuntoYhdysvallat
-
University Hospital, Strasbourg, FranceValmisPrimaarinen immuunikato (PID) yleinen muuttuva immuunivajaus (CVID)Ranska
-
University of California, Los AngelesLopetettuTerveydenhuollon käyttö | Nuorten vangitseminenYhdysvallat