Výzkum optimálních koktejlových probiotik pro dekolonizaci enterokoků rezistentních na vankomycin v lidském střevě

Enterokoky jsou jednou z komenzálních střevních flór u lidí a staly se důležitou patogenní bakterií oportunních infekcí. Enterokoky mohou způsobit závažnou infekci, když se u pacientů stanou imunokompromitované a následný vážný problém v léčbě, protože antibiotika poslední řady mohou být neúčinná. Výskyt vankomycin-rezistentních enterokoků (VRE) se v posledních letech po celém světě zvyšuje. VRE se staly globální hrozbou pro lidské zdraví a lékařskou péči kvůli možnému šíření genů rezistence na antibiotika. Probiotické bakterie dosud hrály různé důležité role v regulaci střevních funkcí a měly pozitivní vliv na diabetes, poruchy jaterních funkcí a psychiatrické poruchy. Nedávno několik probiotických studií ukázalo, že VRE by mohla být dekolonizována z lidského střeva. Zůstává však kontroverzní kvůli různým probiotickým kmenům, dávkám, trváním podávání a uspořádáním studií v těchto zprávách. Proto jsou zaručeny další in vitro studie a klinické studie pro ověření hypotézy, že VRE by mohla být dekolonizována probiotickými bakteriemi z lidského střeva.

V předběžné studii využívající potrubí pro analýzu mikrobiomu k rozboru dat NGS (sekvenování nové generace) ze společných kultur dvou kmenů VRE (Enterococcus faecium, Enterococcus faecalis) a deseti probiotických bakterií schválených TFDA (Taiwan Food and Drug Administration) potvrdili, že směs deseti probiotických bakterií významně potlačila bakteriální množství VRE během společných kultur in vitro. Výsledky poskytnou vzorec optimálních koktejlových probiotik, ve kterých by specifická kombinace vybraných probiotických bakterií mohla mít maximální účinek na potlačení růstu VRE.

Nejprve bude provedena in vitro společná kultivace VRE a optimální koktejlová probiotika vybraná potrubím Microbiome analysis pro validaci výsledků z předběžné studie. Poté budou připraveny kapsle odolné proti žaludečním kyselinám obsahující probiotický koktejl ověřený in vitro kokultivačním modelem v dávce 10^10 CFU (Colony Forming Unit).

Za druhé, v navrhované klinické studii budou vybráni účastníci ve věku mezi 20 a 90 lety, kteří budou po hospitalizaci přijati do Taipei Medical University Hospital s izolovanými enterokoky rezistentními na vankomycin (VRE) ze stolice. Kritéria vyloučení v této studii jsou jedinci: (1) s rutinním příjmem probiotik v každodenním životě nebo s probiotiky předepisovanými na klinice jeden týden před nebo v období klinického hodnocení; (2) předepisování s perorálním příjmem antibiotik v období klinického hodnocení; (3) se symptomem průjmu; (4) v těhotenství; (5) stavů s oslabenou imunitou nebo předepisování léků steroidního typu; (6) s diabetes mellitus; (7) kriticky nemocní pacienti.

Po stabilizaci stavu jejich základního onemocnění budou tito pacienti, kteří podepíší informovaný souhlas, náhodně rozděleni do dvou skupin, které budou dostávat koktejlová probiotika nebo placebo po dobu 3 týdnů ve dvojitě zaslepeném maskování. Vzorky stolice budou odebrány před a po 3týdenním podávání koktejlových probiotik nebo placeba. Po dokončení zařazení 80 pacientů v celkovém počtu budou dvojitě zaslepené kapsle neznačeny a minimálně 50 pacientů s 25 dokončenými párovými vzorky stolice v obou skupinách bude dále zpracováno pro izolaci genomové DNA a analýzu 16s rDNA (ribozomální DNA) NGS. Nakonec bude analyzováno množství VRE ve vzorcích stolice s číslem tvorby kolonií na selektivním médiu a změny střevní mikroflóry budou analyzovány prostřednictvím mikrobiomu stolice 16s rDNA NGS. Výsledky budou porovnány mezi skupinou s koktejlovými probiotiky a skupinou s placebem pro hodnocení VRE dekolonizačního účinku probiotik.