Az optimális koktélos probiotikumok vizsgálata a vankomicin-rezisztens enterococcusok dekolonizációjához emberi bélben

Az enterococcusok az egyik kommenzális bélflóra az emberekben, és az opportunista fertőzések fontos patogén baktériumává váltak. Az enterococcusok súlyos fertőzést okozhatnak, ha a betegek immunhiányossá válnak, és ezt követően komoly problémákat okozhatnak az orvosi terápiában, mivel az utolsó vonalbeli antibiotikumok hatástalanok lehetnek. A vancomycin-rezisztens enterococcusok (VRE) előfordulása világszerte növekszik az elmúlt években. A VRE globális veszélyt jelent az emberi egészségre és az orvosi ellátásra az antibiotikum-rezisztencia gének lehetséges terjedése miatt. Eddig a probiotikus baktériumok számos fontos szerepet játszottak a bélműködés szabályozásában, és pozitív hatást gyakoroltak a cukorbetegségre, a májfunkció károsodására és a pszichiátriai rendellenességekre. A közelmúltban néhány probiotikus vizsgálat kimutatta, hogy a VRE dekolonizálható az emberi bélből. Ez azonban továbbra is ellentmondásos a különböző probiotikus törzsek, dózisok, a beadás időtartama és a vizsgálati tervek miatt ezekben a jelentésekben. Ezért további in vitro vizsgálatok és klinikai vizsgálatok indokoltak annak a hipotézisnek az igazolására, hogy a VRE-t probiotikus baktériumok dekolonizálhatják az emberi bélből.

Az előzetes vizsgálatban Microbiome elemzési csővezeték segítségével két VRE törzs (Enterococcus faecium, Enterococcus faecalis) és tíz TFDA (Tajvani Élelmiszer- és Gyógyszerügyi Hatóság) által jóváhagyott probiotikus baktérium együtttenyészetéből származó NGS (következő generációs szekvenálás) adatait boncolták ki. megerősítették, hogy a tíz probiotikus baktérium keveréke szignifikánsan csökkentette a VRE baktériumok mennyiségét az in vitro ko-kultúrák során. Az eredmények az optimális koktélozott probiotikumok képletét biztosítják, amelyben a kiválasztott probiotikus baktériumok specifikus kombinációja maximális hatást fejthet ki a VRE növekedésének visszaszorítására.

Először is, a VRE és a Microbiome analízis során kiválasztott optimális koktélozott probiotikumok in vitro együtttenyésztését végezzük el az előzetes vizsgálat eredményeinek validálására. Az in vitro kotenyésztési modellel validált probiotikus koktélt tartalmazó gyomorsav-rezisztens kapszulákat ezután 10^10 CFU (Colony Forming Unit) dózisban készítik el.

Másodszor, a javasolt klinikai vizsgálatban 20 és 90 év közötti résztvevőket választanak ki, és a tajpeji Orvosi Egyetemi Kórházba helyezik be, ahol a székletből izolált vancomycin-rezisztens enterococcusok (VRE) találhatók a kórházi kezelés után. Ebben a vizsgálatban a kizárási kritériumok a következők: (1) a mindennapi életben rutinszerűen probiotikumot szednek, vagy a klinikán egy héttel a klinikai vizsgálat előtt vagy alatt probiotikumot írnak fel nekik; (2) orális antibiotikum felvétel mellett írják fel a klinikai vizsgálat időszakában; (3) hasmenés tünettel; (4) terhesség alatt; (5) immunhiányos állapotok, vagy szteroid típusú gyógyszerekkel együtt felírva; (6) diabetes mellitusban; (7) kritikus állapotú betegek.

Amikor alapbetegségük állapota stabilizálódik, a beleegyező nyilatkozatot aláíró betegeket véletlenszerűen két csoportba osztják, akik 3 hétig koktélozott probiotikumot vagy placebót kapnak kettős vak maszkban. A székletmintákat a koktélos probiotikumok vagy placebo 3 hetes beadása előtt és után veszik. Az összesen 80 beteg felvételének befejezése után a kettős vak kapszulákat jelölik, és legalább 50, mindkét csoportban 25 kitöltött páros székletmintával rendelkező beteget további feldolgozásnak vetnek alá a genomiális DNS izolálása és a 16s rDNS (riboszomális DNS) NGS elemzése céljából. Végül a székletmintákban lévő VRE mennyiségét a kolóniaképződés számával elemzik szelektív táptalajon, és a bélmikrobióta változásait a széklet mikrobióma 16s rDNS NGS segítségével elemzik. Az eredményeket a koktélozott probiotikumok csoportja és a placebo csoport között összehasonlítják a probiotikumok VRE dekolonizációs hatásának értékelése érdekében.