Observační studie Analýza transkriptomu a mutačního stavu karcinomů štítné žlázy folikulárního původu s různými stupni malignity (TRAMT)

Rakovina štítné žlázy (TC) je nejčastější endokrinní malignitou, s dobře diferencovanými karcinomy štítné žlázy (DTCS) -papilární (PTC) a folikulární (FTC)-většinou případů. Zatímco DTC mají obecně příznivé prognózy, podskupina postupuje k špatně diferencovanému nebo anaplastickému karcinomu štítné žlázy (ATC), což je vysoce agresivní. Klasifikace nádoru je založena na histopatologii, invazivitě a molekulárních charakteristikách, s novými entitami, jako jsou nádory štítné žlázy nejistého maligního potenciálu (TT-EUM) a neinvazivní folikulární novotrikum štítné žlázy s papilárními jadernými rysy (NIFTP), diagnostickým kritérii.

Současná standardní ošetření zahrnuje chirurgickou resekci, radioaktivní jódovou terapii a náhradu hormonů štítné žlázy. Někteří pacienti se však vyvíjejí onemocnění refrakterní radioidin se zvýšeným rizikem recidivy a progrese. Molekulární změny v cestách MAPK a PI3K hrají kritickou roli v tumorigenezi štítné žlázy, což ovlivňuje terapeutickou odpověď a prognózu. Je zásadní identifikace nových biomarkerů pro včasnou detekci a stratifikaci rizika. Vznikající důkazy zdůrazňují roli mikroRNA (miRNA) v progresi rakoviny štítné žlázy, fungující jako onkogeny nebo nádorové supresory.

Cílem této retrospektivní studie případové kontroly je identifikovat nové molekulární markery spojené s agresivitou rakoviny štítné žlázy. Archivované formalinové fixované tkáně paraffin-zabudované (FFPE) a vzorky krve budou analyzovány od pacientů s různým stupněm invazivity PTC a FTC. Kontrolní vzorky budou histologicky normální tkáň štítné žlázy od stejných pacientů.

Sekvenování nové generace (NGS), včetně RNA-seq a miRNA-seq, bude použito k detekci odlišně exprimovaných molekul RNA. Validace bude provedena pomocí PCR v reálném čase v nezávislé kohortě. Vysoce výkonné genomické sekvenování (Illumina Trusight Oncology 500) vyhodnotí mutace, změny počtu kopií a mutační zátěž nádoru, aby korelovaly genetické změny s malignitou. Varianty budou upřednostňovány na základě frekvenčních rozdílů v populacích nádoru vs. non-tumor a funkční relevance.

Studie zaregistruje pacienty do karcinomu štítné žlázy odvozených od folikulárních buněk. Analýza výkonu ukazuje, že 80 subjektů poskytuje> 80% statistickou sílu pro identifikaci biomarkerů. Popisné statistiky, parametrické/neparametrické testy a přístupy strojového učení budou analyzovat transkriptomická a genomická data. Křivky provozní charakteristiky přijímače (ROC) posoudí přesnost diagnostické biomarkeru, zatímco logistická regrese bude modelovat souvislosti mezi molekulárními změnami a závažností onemocnění.

Cílem této studie je odhalit molekulární mechanismy, které řídí progresi rakoviny štítné žlázy a identifikovat biomarkery pro zlepšenou stratifikaci rizika, včasnou diagnózu a potenciální terapeutické cílení. Zjištění mohou zlepšit přístupy personalizované léčby v onkologii štítné žlázy.