Observasjonsstudie som analyserer transkriptom og mutasjonsstatus for skjoldbruskkjertelkarsinomer av follikulær opprinnelse med forskjellige grader av malignitet (TRAMT)

Skjoldbruskkreft (TC) er den vanligste endokrine maligniteten, med godt differensierte skjoldbruskkjertelkarsinomer (DTC) -papillary (PTC) og follikulær (FTC) -komprigende de fleste tilfeller. Mens DTC -er generelt har gunstige prognoser, utvikler en undergruppe seg til dårlig differensiert eller anaplastisk skjoldbruskkjertelkarsinom (ATC), noe som er svært aggressivt. Tumorklassifisering er basert på histopatologi, invasivitet og molekylære egenskaper, med nye enheter som skjoldbrusk-svulster av usikre ondartet potensial (TT-OPP) og ikke-invasive follikulære skjoldbruskkjertelen neoplasma med papillærlignende kjernefunksjoner (NIFTP) foredling av diagnostikk.

Gjeldende standardbehandlinger inkluderer kirurgisk reseksjon, radioaktiv jodbehandling og erstatning av skjoldbruskhormon. Imidlertid utvikler noen pasienter radiojod-ildfast sykdom med økt risiko for tilbakefall og progresjon. Molekylære endringer i MAPK- og PI3K -traséene spiller kritiske roller i skjoldbrusk -tumorigenese, og påvirker terapeutisk respons og prognose. Å identifisere nye biomarkører for tidlig oppdagelse og risikostratifisering er avgjørende. Fremvoksende bevis fremhever rollen som mikroRNAs (miRNA) i progresjon av skjoldbruskkjertelen kreft, og fungerer som onkogener eller tumorundertrykkere.

Denne retrospektive casekontrollstudien tar sikte på å identifisere nye molekylære markører knyttet til aggressivitet i skjoldbruskkjertelen. Arkiverte formalinfikserte parafininnstilte (FFPE) vev og blodprøver vil bli analysert fra pasienter med ulik grad av PTC og FTC invasivitet. Kontrollprøver vil være histologisk normalt skjoldbruskvev fra de samme pasientene.

Neste generasjons sekvensering (NGS), inkludert RNA-seq og miRNA-seq, vil bli brukt for å oppdage differensielt uttrykte RNA-molekyler. Validering vil bli utført ved bruk av sanntids PCR i en uavhengig årskull. Genomisk sekvensering med høy gjennomstrømning (Illumina Trussight Oncology 500) vil vurdere mutasjoner, kopieringsvariasjoner og tumormutasjonsbyrde for å korrelere genetiske endringer med malignitet. Varianter vil bli prioritert basert på frekvensforskjeller i tumor kontra ikke-tumorpopulasjoner og funksjonell relevans.

Studien vil registrere pasienter med follikulært celle-avledet skjoldbruskkjertelkarsinom. En kraftanalyse indikerer at 80 forsøkspersoner gir> 80% statistisk kraft for identifikasjon av biomarkør. Beskrivende statistikk, parametriske/ikke-parametriske tester og maskinlæringstilnærminger vil analysere transkriptomiske og genomiske data. Mottakerens driftskarakteristikk (ROC) kurver vil vurdere diagnostisk biomarkørnøyaktighet, mens logistisk regresjon vil modellere assosiasjoner mellom molekylære endringer og alvorlighetsgraden av sykdommer.

Denne studien tar sikte på å avdekke molekylære mekanismer som driver progresjon av skjoldbruskkjertelkreft og identifisere biomarkører for forbedret risikostratifisering, tidlig diagnose og potensiell terapeutisk målretting. Funn kan forbedre personaliserte behandlingsmetoder i skjoldbruskkjertel onkologi.