Badanie obserwacyjne analizujące status transkryptomu i mutacji raków tarczycy pochodzenia pęcherzykowego o różnym stopniu nowotworów złośliwych (TRAMT)

Rak tarczycy (TC) jest najczęstszym złośliwością hormonalną, z dobrze zróżnicowanym rakiem tarczycy (DTCS) -papilary (PTC) i pęcherzykowym (FTC), które są zgodne z większością przypadków. Podczas gdy DTC mają na ogół korzystne prognozy, podzbiór przechodzi do słabo zróżnicowanego lub anaplastycznego raka tarczycy (ATC), który jest bardzo agresywny. Klasyfikacja nowotworu opiera się na histopatologii, inwazyjności i charakterystyce molekularnej, z nowymi bytami, takimi jak guzy tarczycy o niepewnym potencjale złośliwym (TT-LUM) i nieinwazyjnym pęcherzykowym nowotworze tarczycy z brodawkowymi cechami jądrowymi (NIFTP).

Obecne standardowe zabiegi obejmują resekcję chirurgiczną, radioaktywną terapię jodu i wymianę hormonu tarczycy. Jednak niektórzy pacjenci rozwijają chorobę oporną na radioiodowo ze zwiększonym ryzykiem nawrotu i progresji. Zmiany molekularne na szlakach MAPK i PI3K odgrywają kluczową rolę w nowotworzeniu tarczycy, wpływając na odpowiedź terapeutyczną i rokowanie. Kluczowe jest identyfikacja nowych biomarkerów do wczesnego wykrywania i rozwarstwienia ryzyka. Pojawiające się dowody podkreślają rolę mikroRNA (miRNA) w progresji raka tarczycy, funkcjonując jako onkogeny lub supresory nowotworów.

To retrospektywne badanie kontroli przypadków ma na celu identyfikację nowych markerów molekularnych związanych z agresywnością raka tarczycy. Zarchiwizowane tkanki i próbki krwi (FFPE) i próbki krwi) zostaną przeanalizowane od pacjentów o różnym stopniu inwazyjności PTC i FTC. Próbki kontrolne będą histologicznie normalną tkanką tarczycy od tych samych pacjentów.

Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS), w tym RNA-Seq i MIRNA-Seq, zostanie zastosowane do wykrywania cząsteczek RNA o różnej ekspresji. Walidacja zostanie wykonana przy użyciu PCR w czasie rzeczywistym w niezależnej kohorcie. Wysokoprzepustowe sekwencjonowanie genomowe (Illumina Trusight Oncology 500) oceni mutacje, zmiany liczby kopii i obciążenie mutacji nowotworów w celu korelacji zmian genetycznych z nowotworami nowotworami. Warianty zostaną ustalone priorytetowo w oparciu o różnice częstotliwości w populacjach nowotworowych w porównaniu z populacjami nienowotworowymi i znaczeniem funkcjonalnym.

Badanie zapisuje pacjentów z rakiem tarczycy pochodzącego z komórek pęcherzykowych. Analiza mocy wskazuje, że 80 osób zapewnia> 80% mocy statystycznej do identyfikacji biomarkera. Statystyka opisowa, testy parametryczne/nieparametryczne oraz podejścia do uczenia maszynowego przeanalizują dane transkryptomiczne i genomowe. Krzywe charakterystyczne odbiornika (ROC) ocenią dokładność biomarkera diagnostycznego, podczas gdy regresja logistyczna będzie modelować powiązania między zmianami molekularnymi a ciężkością choroby.

Badanie to ma na celu odkrycie mechanizmów molekularnych napędzających postęp raka tarczycy i zidentyfikować biomarkery w celu lepszego rozwarstwienia ryzyka, wczesnej diagnozy i potencjalnego ukierunkowania terapeutycznego. Wyniki mogą zwiększyć spersonalizowane podejścia do leczenia w onkologii tarczycy.