Follikulaarisen alkuperän kilpirauhasen karsinoomien transkripti- ja mutaatiotilaa analysoimalla havainnollista tutkimusta, jolla on erilaiset pahanlaatuisuuden asteet (TRAMT)

Kilpirauhassyöpä (TC) on yleisin endokriininen pahanlaatuisuus, ja sillä on hyvin erilainen kilpirauhasen karsinoomat (DTCS) -pillaarinen (PTC) ja follikulaarinen (FTC), joka sisältää suurimman osan tapauksista. Vaikka DTC: llä on yleensä suotuisia ennusteita, alajoukko etenee huonosti erilaistuneeseen tai anaplastiseen kilpirauhasen karsinoomaan (ATC), joka on erittäin aggressiivinen. Kasvaimen luokittelu perustuu histopatologiaan, invasiivisuuteen ja molekyyliominaisuuksiin, ja uusilla kokonaisuuksilla, kuten kilpirauhasen kasvaimilla, joilla on epävarma pahanlaatuinen potentiaali (TT-UP) ja ei-invasiiviset follikulaariset kilpirauhasen kasvaimet papillaarimaisten ydinominaisuuksien (NIFTP) puhdistamisella.

Nykyisiin standardihoidoihin kuuluvat kirurginen resektio, radioaktiivinen jodihoito ja kilpirauhashormonikorvaus. Joillakin potilailla kehittyy kuitenkin radiojodiinilähtötauti lisääntyneellä toistumis- ja etenemisriskillä. MOLEKULINEN MUUTTAMISSA MAPK- ja PI3K -reiteillä on kriittisiä rooleja kilpirauhasen tuumorigeneesissä, mikä vaikuttaa terapeuttiseen vasteeseen ja ennusteeseen. Uusien biomarkkereiden tunnistaminen varhaisessa havaitsemisessa ja riskien stratifioinnissa on ratkaisevan tärkeää. Epämuotoinen näyttö korostaa mikroRNA: ien (miRNA: ien) roolia kilpirauhassyövän etenemisessä, toimittaen onkogeeneinä tai tuumorin suppressoreina.

Tämän retrospektiivisen tapauksen hallintatutkimuksen tavoitteena on tunnistaa uudet kilpirauhassyövän aggressiivisuuteen liittyvät molekyylimarkkerit. Arkistoidut formaliiniin kiinnitetyt parafiiniin upotetut (FFPE) kudos- ja verinäytteet analysoidaan potilailta, joilla on vaihtelevat PTC- ja FTC-invasiiviset asteet. Kontrollinäytteet ovat histologisesti normaaleja kilpirauhasen kudoksia samoista potilaista.

Seuraavan sukupolven sekvensointia (NGS), mukaan lukien RNA-Seq ja miRNA-seq, käytetään havaitsemaan erilaisia ​​ekspressoituja RNA-molekyylejä. Validointi suoritetaan reaaliaikaisella PCR: llä riippumattomassa kohortissa. Korkean suorituskyvyn genominen sekvensointi (Illumina Trusight Oncology 500) arvioi mutaatioita, kopioiden lukumäärän variaatioita ja tuumorimutaatiotaakkaa korreloidakseen geneettisiä muutoksia pahanlaatuisuuden kanssa. Muunnelmat priorisoidaan kasvaimen vs. ei-tuumorin populaatioiden ja toiminnallisen merkityksen taajuuserojen perusteella.

Tutkimuksessa ilmoitetaan potilaat, joilla on follikulaarisoluista peräisin oleva kilpirauhasen karsinooma. Tehoanalyysi osoittaa, että 80 henkilöä tarjoaa> 80% tilastollisen tehon biomarkkereiden tunnistamiselle. Kuvailevat tilastot, parametriset/ei-parametriset testit ja koneoppimislähestymistavat analysoivat transkriptomaattista ja genomista tietoa. Vastaanottimen toimintaominaisuuksien (ROC) käyrät arvioivat diagnostisen biomarkkereiden tarkkuuden, kun taas logistinen regressio mallintaa assosiaatioita molekyylimuutosten ja sairauden vakavuuden välillä.

Tämän tutkimuksen tavoitteena on paljastaa kilpirauhassyövän etenemistä edistävät molekyylimekanismit ja tunnistaa biomarkkerit riskien stratifikaation, varhaisen diagnoosin ja mahdollisen terapeuttisen kohdistamisen parantamiseksi. Tulokset voivat parantaa henkilökohtaisia ​​hoitomenetelmiä kilpirauhasen onkologiassa.