Обсервационное исследование, анализирующее транскриптом и мутационный статус карциномы щитовидной железы фолликулярного происхождения с различными степенями злокачественных новообразований (TRAMT)

Рак щитовидной железы (TC) является наиболее распространенным эндокринным злокачественным новообразованием, с хорошо дифференцированными карциномами щитовидной железы (DTCS) -Papillary (PTC) и фолликулярными (FTC), составляющими большинство случаев. В то время как DTC обычно имеют благоприятные прогнозы, подмножество развивается до плохо дифференцированной или анапластической карциномы щитовидной железы (ATC), которая очень агрессивна. Классификация опухолей основана на гистопатологии, инвазивности и молекулярных характеристиках, с новыми объектами, такими как опухоли щитовидной железы неопределенного злокачественного потенциала (TT-ump) и неинвазивных фолликулярных новообразования щитовидной железы с папиллярными ядерными особенностями (NIFTP), усовершенствовающие диагностические критерии.

Современные стандартные методы лечения включают хирургическую резекцию, радиоактивную йод -терапию и замену гормонов щитовидной железы. Тем не менее, у некоторых пациентов развивается радиоидом-резистентное заболевание с повышенным риском рецидива и прогрессирования. Молекулярные изменения в путях MAPK и PI3K играют критическую роль в онкогенезе щитовидной железы, влияя на терапевтический ответ и прогноз. Выявление новых биомаркеров для раннего обнаружения и стратификации риска имеет решающее значение. Новые данные подчеркивают роль микроРНК (miRNAs) в прогрессировании рака щитовидной железы, функционируя как онкогены или опухолевые супрессоры.

Это ретроспективное исследование случай-контроль направлено на выявление новых молекулярных маркеров, связанных с агрессивностью рака щитовидной железы. Архивированный формалин, фиксированная парафином (FFPE) ткани и образцы крови, будут проанализированы у пациентов с различной степенью инвазивности PTC и FTC. Контрольные образцы будут гистологически нормальной тканью щитовидной железы от тех же пациентов.

Секвенирование следующего поколения (NGS), включая RNA-Seq и miRNA-seq, будет использоваться для выявления дифференциально экспрессируемых молекул РНК. Проверка будет выполнена с использованием ПЦР в реальном времени в независимой когорте. Высокопроизводительное геномное секвенирование (Illumina Trusight Oncology 500) будет оценивать мутации, вариации числа копий и бремя мутации опухоли для корреляции генетических изменений со злокачественностью. Варианты будут приоритетными на основе частоты различий в опухоли по сравнению с населением, не являющимися топухами, и функциональной значимости.

Исследование будет включать пациентов с фолликулярным карциномой щитовидной железы. Анализ мощности указывает на то, что 80 субъектов обеспечивают> 80% статистической мощности для идентификации биомаркеров. Описательная статистика, параметрические/непараметрические тесты и подходы машинного обучения будут анализировать транскриптомные и геномные данные. Кривые рабочей характеристики приемника (ROC) будут оценивать точность диагностического биомаркера, в то время как логистическая регрессия будет моделировать связи между молекулярными изменениями и тяжестью заболевания.

Это исследование направлено на то, чтобы раскрыть молекулярные механизмы, способствующие прогрессированию рака щитовидной железы и выявлению биомаркеров для улучшения стратификации риска, ранней диагностики и потенциального терапевтического нацеливания. Результаты могут улучшить персонализированные подходы к лечению в онкологии щитовидной железы.