Fod-hud-mikrobiom og metabolomik af udhulet keratolyse (Foot-skin M&M)

Udhulet keratolyse er en hudinfektionssygdom, som kan forårsage en ubehagelig lugt, der kan påvirke selvtillid og interpersonelle forhold. Forskningsproblemet blev påbegyndt gennem et lokalsamfunds opsøgende program organiseret af Department of Dermatology Siriraj Hospital, Thailand. Ud fra mange års erfaringer har vores hudlægehold observeret, at keratolyse i huller var en almindelig sygdom blandt flådekadetter, som bar lukket fodtøj i lange timer, og det var mere udbredt efter en bootcamp, der strakte sig over måneder. Denne sygdom er kronisk uden effektiv standardbehandling og begrænset information om sygdommens patogenese. Derfor foreslår vi at udføre en undersøgelse af patogenesen af ​​pitted keratolyse og ildelugtende fødder gennem en longitudinel undersøgelse af fod-hud-mikrobiom og tilhørende flygtige metabolomiske profiler af fodlugt. Med den unikke befolkning, med ens aldersgruppe, daglige aktiviteter og kost, vil denne undersøgelse gøre det muligt at fokusere på sammenhængen mellem ændringer i mikrobiom i forhold til patogenesen af ​​pitted keratolyse og ildelugtende fødder, med færre cofounding faktorer.

Hudmikrobiomet er en gruppe af forskellige mikroorganismer, såsom bakterier, svampe og vira, der findes på huden. Menneskets hudmikrobiom kan variere med hensyn til alder, etnicitet, kost, klima og miljø. For nylig har der været adskillige undersøgelser, der fremhæver associeringen af ​​mikrober med patogenesen af ​​forskellige hudsygdomme, såsom atopisk dermatitis, acne vulgaris og psoriasis (referencer?). I dette projekt antager vi, at ændringen af ​​hudens mikrobiom samt ændringer i metabolitprofiler kan associeres med sygdommens mekanisme. Hudmikrobiomdataene, der genereres i denne undersøgelse, vil blive analyseret for mikrobielle profiler ved hjælp af QIIME2, en næste generations mikrobiom bioinformatikplatform og en grafisk softwarepakke, "Statistical Analysis of Taxonomic and Functional Profiles" (STAMP). Parallelt hermed vil vi anvende en højgennemløbsgaskromatografi-massespektrometri-baseret metabolomik til at detektere flygtige metabolitter til stede i fodlugt i forbindelse med det observerede fod-hud-mikrobiom. Denne metabolitinformation vil ikke kun give et yderligere aspekt af sygdommens patogenese, men kan også tilbyde en ny standardindikator for fodlugt, som kan bruges yderligere i klinisk praksis. Endelig vil hudmikrobiom og metabolomiske data blive analyseret ved hjælp af forskellige metoder til korrelationsanalyse samt integrativ analyse for at opnå en dybere forståelse af sygdomsmekanismen på molekylært niveau.

Resultaterne af dette projekt vil give indsigt i patogenesen af ​​pitted keratolyse. Den videnskabelige viden opnået fra undersøgelsen vil blive omsat til en mere effektiv behandling af sygdommen. Det menneskelige mikrobiom hos en sund befolkning og de sygdomsspecifikke mikrobiomdata vil lægge grunden til at udvikle en human mikrobiomdatabase for thailændere. Derudover vil projektets succes give mulighed for udvikling af avanceret instrumentel metodologi og en integrerende analysetilgang til at analysere multi-omics-data, som vil være store aktiver til at fremme multidisciplinær forskning.