Microbioma de la piel del pie y metabolómica de la queratólisis picada (Foot-skin M&M)

La queratólisis picada es una enfermedad infecciosa de la piel que puede causar un olor desagradable que puede afectar la confianza en uno mismo y las relaciones interpersonales. El problema de investigación se inició a través de un programa de extensión comunitaria organizado por el Departamento de Dermatología del Hospital Siriraj, Tailandia. A partir de muchos años de experiencia, nuestros equipos de dermatólogos observaron que la queratólisis con hoyuelos era una enfermedad común entre los cadetes navales que usaban calzado cerrado durante muchas horas, y era más frecuente después de un campo de entrenamiento que duró meses. Esta enfermedad es crónica sin un tratamiento estándar eficaz y con información limitada sobre la patogenia de la enfermedad. Por lo tanto, proponemos realizar un estudio sobre la patogenia de la queratólisis con hoyuelos y los pies malolientes a través de un estudio longitudinal del microbioma de la piel del pie y los perfiles metabolómicos volátiles asociados del olor del pie. Con la población única, con un rango de edad, actividades diarias y dieta similares, este estudio permitirá centrarse en la asociación de cambios en el microbioma en relación con la patogenia de la queratólisis con hoyuelos y los pies malolientes, con menos factores cofundadores.

El microbioma de la piel es un grupo de varios microorganismos, como bacterias, hongos y virus, que residen en la piel. El microbioma de la piel humana puede diferir con respecto a la edad, el origen étnico, la dieta, el clima y el medio ambiente. Recientemente, se han realizado numerosos estudios que destacan la asociación de microbios con la patogenia de diversas enfermedades de la piel, como la dermatitis atópica, el acné vulgar y la psoriasis (¿referencias?). En este proyecto, planteamos la hipótesis de que la alteración del microbioma de la piel, así como los cambios en los perfiles de metabolitos, pueden estar asociados con el mecanismo de la enfermedad. Los datos del microbioma de la piel generados en este estudio se analizarán en busca de perfiles microbianos utilizando QIIME2, una plataforma bioinformática de microbiomas de próxima generación, y un paquete de software gráfico, "Análisis estadístico de perfiles taxonómicos y funcionales" (STAMP). Paralelamente, aplicaremos una metabolómica basada en espectrometría de masas de cromatografía de gases de alto rendimiento para detectar metabolitos volátiles presentes en el olor de los pies en asociación con el microbioma de la piel del pie observado. Esta información de metabolitos no solo proporcionará un aspecto adicional de la patogenia de la enfermedad, sino que también podría ofrecer un nuevo indicador estándar del olor de los pies que se puede utilizar más en la práctica clínica. Finalmente, los datos del microbioma y la metabolómica de la piel se analizarán utilizando varios métodos de análisis de correlación, así como análisis integradores para obtener una comprensión más profunda del mecanismo de la enfermedad a nivel molecular.

Los resultados de este proyecto proporcionarán información sobre la patogenia de la queratólisis con hoyos. El conocimiento científico obtenido del estudio se traducirá en un tratamiento más eficaz de la enfermedad. El microbioma humano de la población sana y los datos de microbiomas específicos de enfermedades sentarán las bases para desarrollar una base de datos de microbiomas humanos para los tailandeses. Además, el éxito del proyecto permitirá el desarrollo de una metodología instrumental avanzada y un enfoque de análisis integrador para analizar datos multiómicos, que serán grandes activos para avanzar en la investigación multidisciplinaria.