Jalka-ihon mikrobiomi ja kuoppaisen keratolyysin metabolomia (Foot-skin M&M)

Pitted keratolysis on ihon tartuntatauti, joka voi aiheuttaa epämiellyttävää hajua, joka voi vaikuttaa itseluottamukseen ja ihmissuhteisiin. Tutkimusongelma käynnistettiin Thaimaan Siriraj-sairaalan ihotautiosaston järjestämän yhteisön tiedotusohjelman kautta. Monien vuosien kokemuksen perusteella ihotautilääkäritiimimme havaitsivat, että kuoppakeratolyysi oli yleinen sairaus merivoimien kadettien keskuudessa, jotka käyttivät suljettuja jalkineita pitkiä tunteja, ja se oli yleisempää kuukausia kestäneen harjoitusleirin jälkeen. Tämä sairaus on krooninen ilman tehokasta standardihoitoa ja rajallisesti tietoa taudin patogeneesistä. Siksi ehdotamme tutkimuksen suorittamista kuoppaisen keratolyysin ja pahanhajuisten jalkojen patogeneesistä pitkittäistutkimuksella jalka-ihon mikrobiomista ja siihen liittyvistä jalkojen hajun haihtuvista metabolomista profiileista. Ainutlaatuisella väestöllä, jolla on samanlainen ikäjakauma, päivittäiset toiminnot ja ruokavalio, tämä tutkimus antaa mahdollisuuden keskittyä mikrobiomin muutosten yhteyteen kuoppaisen keratolyysin ja pahanhajuisten jalkojen patogeneesiin, ja siinä on vähemmän taustatekijöitä.

Ihon mikrobiomi on ryhmä erilaisia ​​​​mikro-organismeja, kuten bakteereita, sieniä ja viruksia, jotka asuvat iholla. Ihmisen ihon mikrobiomi voi vaihdella iän, etnisyyden, ruokavalion, ilmaston ja ympäristön suhteen. Viime aikoina on tehty lukuisia tutkimuksia, joissa on korostettu mikrobien yhteyttä eri ihosairauksien, kuten atooppisen dermatiitin, akne vulgariksen ja psoriaasin, patogeneesiin (viitteet?). Tässä projektissa oletamme, että ihon mikrobiomin ja metaboliittiprofiilien muutokset voivat liittyä sairauden mekanismiin. Tässä tutkimuksessa saadut ihon mikrobiomitiedot analysoidaan mikrobiprofiilien varalta käyttämällä QIIME2:ta, seuraavan sukupolven mikrobiomibioinformatiikka-alustaa, ja graafista ohjelmistopakettia "Taksonomisten ja toiminnallisten profiilien tilastollinen analyysi" (STAMP). Samanaikaisesti käytämme korkean suorituskyvyn kaasukromatografiaa massaspektrometriaan perustuvaa metabolomiikkaa havaitsemaan jalkojen hajussa esiintyviä haihtuvia metaboliitteja havaitun jalka-ihon mikrobiomin yhteydessä. Nämä aineenvaihduntatuotetiedot eivät ainoastaan ​​tarjoa lisänäkökulmaa taudin patogeneesiin, vaan voivat myös tarjota uuden standardin indikaattorin jalkojen hajusta, jota voidaan käyttää edelleen kliinisessä käytännössä. Lopuksi analysoidaan ihon mikrobiomi- ja metabolomiatietoja käyttämällä erilaisia ​​korrelaatioanalyysimenetelmiä sekä integratiivista analyysiä, jotta saadaan syvempää ymmärrystä sairauden mekanismista molekyylitasolla.

Tämän projektin tulokset antavat oivalluksia kuoppakeratolyysin patogeneesiin. Tutkimuksesta saatu tieteellinen tieto muunnetaan tehokkaammaksi taudin hoidoksi. Terveen väestön ihmisen mikrobiomi ja sairauskohtaiset mikrobiomitiedot luovat pohjan ihmisen mikrobiomitietokannan kehittämiselle thaimaalaisia ​​varten. Lisäksi hankkeen onnistuminen mahdollistaa edistyneen instrumentaalisen metodologian ja integroivan analyysimenetelmän kehittämisen multi-omiikkadatan analysointiin, mikä on suuri voimavara monitieteisen tutkimuksen edistämisessä.