Микробиом кожи стопы и метаболомика точечного кератолиза (Foot-skin M&M)

Ямочный кератолиз — это кожное инфекционное заболевание, которое может вызывать неприятный запах, который может повлиять на уверенность в себе и на межличностные отношения. Проблема исследования была инициирована в рамках программы по работе с населением, организованной отделением дерматологии больницы Siriraj, Таиланд. Основываясь на многолетнем опыте, наши группы дерматологов заметили, что ямочный кератолиз был распространенным заболеванием среди военно-морских кадетов, которые носили закрытую обувь в течение долгих часов, и он был более распространен после учебного лагеря, который длился несколько месяцев. Это хроническое заболевание без эффективного стандартного лечения и с ограниченной информацией о патогенезе заболевания. Поэтому мы предлагаем провести исследование патогенеза ямчатого кератолиза и неприятного запаха ног путем продольного изучения микробиома кожи стоп и связанных с ними летучих метаболических профилей запаха ног. С учетом уникальной популяции с аналогичным возрастным диапазоном, повседневной деятельностью и диетой это исследование позволит сосредоточиться на связи изменений микробиома в отношении патогенеза ямчатого кератолиза и неприятного запаха ног с меньшим количеством сопутствующих факторов.

Микробиом кожи представляет собой группу различных микроорганизмов, таких как бактерии, грибы и вирусы, обитающие на коже. Микробиом кожи человека может различаться в зависимости от возраста, этнической принадлежности, диеты, климата и окружающей среды. В последнее время были проведены многочисленные исследования, подчеркивающие связь микробов с патогенезом различных кожных заболеваний, таких как атопический дерматит, вульгарные угри и псориаз (ссылки?). В этом проекте мы предполагаем, что изменение микробиома кожи, а также изменения профилей метаболитов могут быть связаны с механизмом заболевания. Данные микробиома кожи, полученные в этом исследовании, будут проанализированы на микробные профили с использованием QIIME2, платформы биоинформатики микробиома следующего поколения, и графического программного пакета «Статистический анализ таксономических и функциональных профилей» (STAMP). Параллельно мы будем применять метаболомику на основе высокопроизводительной газовой хроматографии и масс-спектрометрии для обнаружения летучих метаболитов, присутствующих в запахе ног, в связи с наблюдаемым микробиомом кожи ног. Эта информация о метаболитах не только предоставит дополнительный аспект патогенеза заболевания, но также может предложить новый стандартный индикатор запаха ног, который можно будет в дальнейшем использовать в клинической практике. Наконец, микробиом кожи и метаболомные данные будут проанализированы с использованием различных методов корреляционного анализа, а также интегративного анализа, чтобы получить более глубокое понимание механизма заболевания на молекулярном уровне.

Результаты этого проекта дадут представление о патогенезе точечного кератолиза. Научные знания, полученные в результате исследования, будут преобразованы в более эффективное лечение болезни. Человеческий микробиом здорового населения и данные микробиома по конкретным заболеваниям заложат основу для разработки базы данных человеческого микробиома для тайцев. Кроме того, успех проекта позволит разработать продвинутую инструментальную методологию и интегративный подход к анализу мульти-омных данных, что станет большим преимуществом в продвижении междисциплинарных исследований.