Microbioma della pelle del piede e metabolomica della cheratolisi snocciolata (Foot-skin M&M)

La cheratolisi snocciolata è una malattia infettiva della pelle che può causare un odore sgradevole che può influenzare la fiducia in se stessi e le relazioni interpersonali. Il problema della ricerca è stato avviato attraverso un programma di sensibilizzazione della comunità organizzato dal Dipartimento di Dermatologia dell'ospedale Siriraj, in Thailandia. Da molti anni di esperienza, i nostri team di dermatologi hanno osservato che la cheratolisi snocciolata era una malattia comune tra i cadetti della marina che indossavano calzature chiuse per lunghe ore, ed era più diffusa dopo un campo di addestramento che durava da mesi. Questa malattia è cronica senza un trattamento standard efficiente e informazioni limitate sulla patogenesi della malattia. Pertanto, proponiamo di condurre uno studio sulla patogenesi della cheratolisi butterata e dei piedi maleodoranti attraverso uno studio longitudinale del microbioma della pelle del piede e dei profili metabolomici volatili associati dell'odore del piede. Con la popolazione unica, con fascia di età, attività quotidiane e dieta simili, questo studio consentirà di concentrarsi sull'associazione dei cambiamenti nel microbioma in relazione alla patogenesi della cheratolisi butterata e dei piedi maleodoranti, con meno fattori cofondanti.

Il microbioma cutaneo è un gruppo di vari microrganismi, come batteri, funghi e virus, che risiedono sulla pelle. Il microbioma della pelle umana può differire rispetto a età, etnia, dieta, clima e ambiente. Recentemente, sono stati condotti numerosi studi che hanno evidenziato l'associazione dei microbi con la patogenesi di varie malattie della pelle, come la dermatite atopica, l'acne vulgaris e la psoriasi (riferimenti?). In questo progetto, ipotizziamo che l'alterazione del microbioma cutaneo così come i cambiamenti nei profili dei metaboliti possano essere associati al meccanismo della malattia. I dati del microbioma cutaneo generati in questo studio saranno analizzati per i profili microbici utilizzando QIIME2, una piattaforma di bioinformatica del microbioma di nuova generazione e un pacchetto software grafico, "Analisi statistica dei profili tassonomici e funzionali" (STAMP). Parallelamente, applicheremo una metabolomica basata sulla spettrometria di massa della gascromatografia ad alto rendimento per rilevare i metaboliti volatili presenti nell'odore del piede in associazione con il microbioma della pelle del piede osservato. Queste informazioni sui metaboliti non solo forniranno un ulteriore aspetto della patogenesi della malattia, ma potrebbero anche offrire un nuovo indicatore standard dell'odore del piede che può essere ulteriormente utilizzato nella pratica clinica. Infine, il microbioma cutaneo ei dati metabolomici saranno analizzati utilizzando vari metodi di analisi di correlazione e analisi integrativa per ottenere una comprensione più profonda del meccanismo della malattia a livello molecolare.

I risultati di questo progetto forniranno approfondimenti sulla patogenesi della cheratolisi snocciolata. Le conoscenze scientifiche acquisite dallo studio saranno tradotte in un trattamento più efficace della malattia. Il microbioma umano della popolazione sana e i dati del microbioma specifici della malattia getteranno le basi per sviluppare un database del microbioma umano per i thailandesi. Inoltre, il successo del progetto consentirà lo sviluppo di una metodologia strumentale avanzata e un approccio di analisi integrativa per analizzare i dati multi-omici, che costituiranno una grande risorsa per l'avanzamento della ricerca multidisciplinare.