El estudio ENIGMA: microbiota intestinal de la enfermedad inflamatoria intestinal del este

La incidencia de enfermedades inflamatorias del intestino (EII), incluida la enfermedad de Crohn (CD) y la colitis ulcerosa (CU), está aumentando en el mundo en desarrollo. Nuestro reciente estudio basado en la población de Asia-Pacífico en 8 países asiáticos y Australia ha demostrado que Hong Kong y China tienen una de las incidencias más altas de enfermedades en Asia, mientras que Australia tiene la misma incidencia más alta de estas enfermedades en el mundo. La incidencia de EII en Hong Kong y China se ha triplicado en la última década.

Las poblaciones asiáticas tienen predisposiciones genéticas a desarrollar EII diferentes a las occidentales, pero estas anomalías genéticas no son obligatorias para el desarrollo de EII, jugando un papel patogénico mucho más importante los factores ambientales. Estos factores incluyen viajes con exposición a una nueva población en la infancia, la dieta, el uso de antibióticos durante la infancia, el nivel socioeconómico y una educación rural versus urbana, cada uno de los cuales por sí solo o en combinación, es probable que afecte el microbioma.

Evidencia convincente sugiere que los microbios intestinales desempeñan un papel fundamental en la patogénesis de la enfermedad, mientras que los factores geográficos, dietéticos y étnicos afectan la composición microbiana. Además de los amplios cambios en el perfil microbiano de la EII, se han identificado una serie de cambios específicos, como una disminución de las especies productoras de butirato Roseburia hominis y Faecalibacterium Prausnitzii. Aunque la microbiota intestinal comensal está perturbada ecológica y funcionalmente en la EII, existe una heterogeneidad inexplicable entre los subtipos de EII y los pacientes individuales. En pacientes con EC sin tratamiento previo de inicio reciente, se ha notificado un enriquecimiento de Enterobacteriaceae y una depleción de Clades IV y XIVa Clostridia durante la inflamación asociada a la enfermedad. Estudios metagenómicos y análisis de micromatrices en poblaciones occidentales y datos asiáticos limitados han demostrado una reducción de Firmicutes, como F. ​​prausnitzii en la enfermedad de Crohn (EC), y un aumento de Escherichia coli y Fusobacterium. Se desconoce si los cambios en los patógenos putativos y/u organismos protectores identificados en las poblaciones occidentales, como E. coli y F. prausnitzii, respectivamente, están presentes en pacientes con EII en Asia. También falta información sobre el grado de variación genética entre las bacterias asignadas a estos grupos taxonómicos de diferentes regiones étnicas y geográficas. La mayor parte del trabajo publicado sobre estas bacterias y su papel patógeno o protector potencial en la EC se ha realizado con aislamientos recuperados de sujetos europeos y norteamericanos. Por estas razones, los investigadores creen que es necesario establecer con firmeza si los cambios microbianos descritos anteriormente también se encuentran en pacientes de otras partes del mundo, incluidos los países asiáticos con una alta incidencia de enfermedades y una incidencia creciente de enfermedades.

El estudio Post-Operative Crohn's Endoscopic Recurrence (POCER) se llevó a cabo en 17 hospitales de Australia y Nueva Zelanda y reclutó a 174 pacientes que luego fueron monitoreados durante 18 meses después de la operación. Los análisis de microbiota realizados en un subconjunto de la cohorte de pacientes del estudio POCER mostraron que F. prausnitzii, previamente identificado como capaz de producir propiedades antiinflamatorias, posible organismo clave en la prevención de la EC activa, disminuyó en abundancia en la EC activa, en pacientes en la cirugía. que posteriormente recurrieron, y en pacientes en el momento de la recurrencia. La mayoría de los estudios publicados que examinan las propiedades antiinflamatorias de F. prausnitzii se han realizado con una sola cepa de origen europeo. A pesar de la promesa asociada con las propiedades antiinflamatorias producidas por F. prausnitzii, queda por determinar si esta bacteria protege contra la inflamación o si disminuye después del inicio de la inflamación.

En resumen, actualmente no está claro si los cambios en los patógenos putativos y los organismos protectores presentes en las poblaciones occidentales con EII se observan consistentemente en pacientes con EC en Asia. Tampoco se sabe si las capacidades funcionales de estas bacterias difieren entre regiones étnicas y/o geográficas.

Además de las características de estas dos familias bacterianas, es probable que el entorno microbiano que interactúa con estos organismos desempeñe un papel fundamental en su expresión y función. Esto se examinará en detalle utilizando técnicas de secuenciación amplias.

Los análisis microbianos se realizarán en el contexto de un examen detallado de los factores de riesgo ambientales para el desarrollo de EC, en los mismos pacientes.