Lo studio ENIGMA: Microbiota intestinale della malattia infiammatoria intestinale orientale

L'incidenza delle malattie infiammatorie intestinali, (IBD) tra cui la malattia di Crohn (MC) e la colite ulcerosa (CU), è in aumento nei paesi in via di sviluppo. Il nostro recente studio basato sulla popolazione dell'Asia-Pacifico in 8 paesi asiatici e in Australia ha dimostrato che Hong Kong e la Cina hanno tra le più alte incidenze di malattie in Asia, mentre l'Australia ha la stessa più alta incidenza di queste malattie nel mondo. L'incidenza di IBD a Hong Kong e in Cina è triplicata nell'ultimo decennio.

Le popolazioni asiatiche hanno predisposizioni genetiche a sviluppare IBD diverse da quelle occidentali, ma queste anomalie genetiche non sono obbligatorie per lo sviluppo di IBD, con fattori ambientali che giocano un ruolo patogenetico molto più importante. Questi fattori includono il viaggio con l'esposizione a una nuova popolazione durante l'infanzia, la dieta, l'uso di antibiotici durante l'infanzia, lo stato socioeconomico e un'educazione rurale rispetto a quella urbana, ognuno dei quali, da solo o in combinazione, può influenzare il microbioma.

Prove convincenti suggeriscono che i microbi intestinali svolgono un ruolo fondamentale nella patogenesi della malattia, mentre i fattori geografici, dietetici ed etnici influiscono sulla composizione microbica. Oltre ad ampi cambiamenti nel profilo microbico nell'IBD, sono stati identificati numerosi cambiamenti specifici, come una diminuzione delle specie produttrici di butirrato Roseburia hominis e Faecalibacterium Prausnitzii. Sebbene il microbiota intestinale commensale sia ecologicamente e funzionalmente perturbato nell'IBD, esiste un'eterogeneità inspiegabile tra i sottotipi di IBD e i singoli pazienti. Nei pazienti naïve al trattamento con CD di nuova insorgenza, sono stati segnalati arricchimento per le Enterobacteriaceae e deplezione dei Clades IV e XIVa Clostridia durante l'infiammazione associata alla malattia. Studi metagenomici e analisi di microarray nelle popolazioni occidentali e dati asiatici limitati hanno dimostrato una riduzione di Firmicutes, come F. prausnitzii nella malattia di Crohn (CD), e un aumento di Escherichia coli e Fusobacterium. Non è noto se i cambiamenti nei patogeni putativi e/o negli organismi protettivi identificati nelle popolazioni occidentali, come E. coli e F. prausnitzii, rispettivamente, siano presenti nei pazienti con IBD in Asia. Mancano inoltre informazioni sul grado di variazione genetica tra i batteri assegnati a questi gruppi tassonomici provenienti da diverse regioni etniche e geografiche. La maggior parte del lavoro pubblicato su questi batteri e sul loro potenziale ruolo patogeno o protettivo nella CD è stata intrapresa con isolati recuperati da soggetti europei e nordamericani. Per questi motivi, i ricercatori ritengono che sia necessario stabilire con fermezza se i cambiamenti microbici sopra descritti si riscontrano anche in pazienti di altre parti del mondo, compresi i paesi asiatici con un'elevata incidenza di malattia e un aumento dell'incidenza di malattia.

Lo studio POCER (Post-Operative Crohn's Endoscopic Recurrence) è stato condotto in 17 ospedali in Australia e Nuova Zelanda e ha reclutato 174 pazienti che sono stati poi monitorati per 18 mesi dopo l'intervento. Le analisi del microbiota intraprese su un sottoinsieme della coorte di pazienti dello studio POCER hanno mostrato che F. prausnitzii, precedentemente identificato come in grado di produrre proprietà antinfiammatorie, possibile organismo chiave nella prevenzione della MC attiva, era diminuito in abbondanza nella MC attiva, nei pazienti presso l'ambulatorio che successivamente si sono ripresentati e nei pazienti al momento della recidiva. La maggior parte degli studi pubblicati che esaminano le proprietà antinfiammatorie di F. prausnitzii sono stati intrapresi con un singolo ceppo di origine europea. Nonostante la promessa associata alle proprietà antinfiammatorie prodotte da F. prausnitzii, resta da stabilire se questo batterio sia protettivo contro l'infiammazione o diminuisca dopo l'inizio dell'infiammazione.

In sintesi, al momento non è chiaro se i cambiamenti nei patogeni putativi e negli organismi protettivi presenti nelle popolazioni IBD occidentali siano osservati in modo coerente con i pazienti con CD in Asia. Né è noto se le capacità funzionali di questi batteri differiscano tra le regioni etniche e/o geografiche.

Oltre alle caratteristiche di queste due famiglie batteriche, è probabile che l'ambiente microbico che si interfaccia con questi organismi svolga un ruolo critico nella loro espressione e funzione. Questo sarà esaminato in dettaglio utilizzando ampie tecniche di sequenziamento.

Le analisi microbiche saranno intraprese nel contesto di un esame approfondito dei fattori di rischio ambientale per lo sviluppo di CD, negli stessi pazienti.