Исследование ENIGMA: кишечная микробиота восточных воспалительных заболеваний кишечника

Заболеваемость воспалительными заболеваниями кишечника (ВЗК), включая болезнь Крона (БК) и язвенный колит (ЯК), увеличивается в развивающихся странах. Наше недавнее исследование населения Азиатско-Тихоокеанского региона в 8 азиатских странах и Австралии показало, что Гонконг и Китай имеют одни из самых высоких показателей заболеваемости в Азии, в то время как Австралия имеет такой же самый высокий уровень заболеваемости этими заболеваниями в мире. Заболеваемость ВЗК в Гонконге и Китае выросла в три раза за последнее десятилетие.

Азиатские популяции имеют генетическую предрасположенность к развитию ВЗК, отличную от западной, но эти генетические аномалии не являются обязательными для развития ВЗК, при этом факторы окружающей среды играют гораздо более важную патогенетическую роль. Эти факторы включают в себя поездки с контактом с новым населением в детстве, диету, использование антибиотиков в детстве, социально-экономический статус и воспитание в сельской местности по сравнению с городским, каждый из которых по отдельности или в сочетании может влиять на микробиом.

Убедительные данные свидетельствуют о том, что кишечные микробы играют решающую роль в патогенезе заболевания, в то время как географические, диетические и этнические факторы влияют на микробный состав. В дополнение к широким изменениям в микробном профиле при ВЗК был выявлен ряд специфических изменений, таких как снижение количества видов, продуцирующих бутират, Roseburia hominis и Faecalibacterium Prausnitzii. Хотя комменсальная микробиота кишечника экологически и функционально нарушена при ВЗК, существует необъяснимая гетерогенность среди подтипов ВЗК и отдельных пациентов. У пациентов с болезнью Крона, ранее не получавших лечения, сообщалось об увеличении количества Enterobacteriaceae и истощении Clades IV и XIVa Clostridia во время воспаления, связанного с заболеванием. Метагеномные исследования и анализ микрочипов в западных популяциях и ограниченные азиатские данные продемонстрировали снижение количества Firmicutes, таких как F. prausnitzii, при болезни Крона (БК) и увеличение количества Escherichia coli и Fusobacterium. Неизвестно, присутствуют ли изменения в предполагаемых патогенах и/или защитных организмах, выявленных в западных популяциях, таких как E. coli и F. prausnitzii соответственно, у пациентов с ВЗК в Азии. Отсутствуют также сведения о степени генетической изменчивости между бактериями, относящимися к этим таксономическим группам, из разных этнических и географических регионов. Большая часть опубликованных работ по этим бактериям и их потенциальной патогенной или защитной роли при БК была проведена с изолятами, полученными от субъектов из Европы и Северной Америки. По этим причинам исследователи считают, что необходимо точно установить, встречаются ли описанные выше микробные изменения у пациентов из других частей мира, включая азиатские страны с высокой заболеваемостью и растущей заболеваемостью.

Исследование послеоперационного эндоскопического рецидива болезни Крона (POCER) было проведено в 17 больницах Австралии и Новой Зеландии, в нем приняли участие 174 пациента, за которыми затем наблюдали в течение 18 месяцев после операции. Анализы микробиоты, проведенные на подмножестве когорты пациентов исследования POCER, показали, что F. prausnitzii, ранее идентифицированная как способная производить противовоспалительные свойства, возможно, ключевой организм в предотвращении активного CD, была снижена в изобилии при активном CD у пациентов во время операции. которые впоследствии рецидивировали, и у больных в момент рецидива. Большинство опубликованных исследований по изучению противовоспалительных свойств F. prausnitzii были проведены с одним штаммом европейского происхождения. Несмотря на обещание, связанное с противовоспалительными свойствами, производимыми F. prausnitzii, еще предстоит определить, защищает ли эта бактерия от воспаления или уменьшается после начала воспаления.

Таким образом, в настоящее время неясно, постоянно ли изменения в предполагаемых патогенах и защитных организмах, присутствующих в западных популяциях ВЗК, наблюдаются у пациентов с болезнью Крона в Азии. Также неизвестно, различаются ли функциональные возможности этих бактерий в разных этнических и/или географических регионах.

В дополнение к характеристикам этих двух бактериальных семейств, микробная среда, взаимодействующая с этими организмами, вероятно, играет решающую роль в их экспрессии и функционировании. Это будет подробно рассмотрено с использованием широких методов секвенирования.

Микробные анализы будут проводиться в контексте детального изучения факторов риска окружающей среды для развития целиакии у тех же пациентов.