Probiootit, hengitysteiden ja suoliston mikrobiomi ja hengitystieinfektiot lapsilla

Keuhkokuume ja ripuli ovat kaksi yleisintä alle 5-vuotiaiden lasten tartuntatautien aiheuttajaa maailmanlaajuisesti, ja ne aiheuttavat vuosittain 1,5 miljoonaa kuolemaa. Vuonna 2013 ne vastasivat 15 % ja 9 % 6,3 miljoonasta alle 5-vuotiaiden lasten kuolemasta. Terveysministeriön mukaan maassamme akuutit hengitystieinfektiot ovat yleisin tautien aiheuttaja valtakunnallisesti 27 493 239 tapauksella vuonna 2014, jolloin keuhkokuume on 19. sijalla 20 suurimman taudinsyyn joukossa 174 748 tapauksella, joista 51 893 tapausta (29 %) on alle 5-vuotiailla lapsilla ja 21 404 tapausta (12 %) alle 1-vuotiailla lapsilla; Vuonna 2015 ilmoitettiin 148 140 keuhkokuumetapausta.

On arvioitu, että jopa 80 prosentissa keuhkokuumetapauksista etiologia on virus. On raportoitu, että jotkut virukset, kuten adenovirus tai bocavirus, voivat säilyä jopa 6 kuukautta akuutin infektion jälkeen. Ei tiedetä, milloin virukset saapuvat elimistöön ja ovatko ne hengitysteiden kommensaaleja vai aiheuttavatko ne vain sairauksia ja poistuvatko ne akuutin infektion jälkeen.

Nykyaikaiset tekniikat ovat tunnistaneet erilaisia ​​mikrobiotayhteisöjä terveissä ja sairaissa ihmisissä sekä virusyhteisöjä, jotka liittyvät läheiseen vuorovaikutukseen, mikä on muuttanut käsityksiä hengitystieinfektioiden patogeneesistä. Hengitystievirusten vuorovaikutusta, hengitystievirusten hankkimista ja kolonisaatiota sekä roolia terveydessä ja sairauksissa tässä mikrobiomissa olevassa kapeassa ei tunneta.

Probioottien roolia hengityselinten sairauksien ehkäisyssä ja homeostaasin ylläpitämisessä mikrobiotassa on tutkittu vähän, ja vielä enemmän todennäköistä suhdetta mikrobiotan, viroman, hengitystievirusten välillä, jotka voisivat olla komensaaleja tai patogeenejä hengitystasolla, aika, jolloin lapsia voidaan kolonisoida, ja niiden säätely probioottien antamisella.

Tutkimuksen tavoitteena on selvittää suoliston ja hengitysteiden mikrobiotassa tapahtuvia muutoksia, suolisto- ja hengityselinten viroomaa, kommensaaleja tai sairauksia aiheuttavia viruksia sekä probioottien roolia hengityselinsairauksien ehkäisyssä ensimmäisen elinvuoden aikana.

Menetelmät Prospektiivinen, satunnaistettu, kontrolloitu kliininen tutkimus toteutetaan soveltamalla metagenomiikan perustutkimuksia klinikalle (translaatiolääketiede). Tässä tutkimuksessa tutkijat aikovat seurata 120 lapsen kohorttia vastasyntyneistä yhden vuoden ikään. Tietoisen suostumuksen jälkeen lapset satunnaistetaan kahteen ryhmään, joista toinen saa probiootteja 4 kertaa viikossa suun kautta ja toinen steriilistä vedestä koostuvaa lumelääkettä 4 kertaa viikossa. Kliininen seuranta tehdään 2 kuukauden välein, jolloin nenän huuhteluvedet ja ulostenäytteet kerätään suoliston ja hengitysteiden mikrobiomin ja viruksen metagenomian määrittämiseksi. Multiplex-polymeraasiketjureaktiotutkimuksilla pyritään havaitsemaan hengitystievirusten esiintyminen ja havaitsemaan aika, jolloin lapset saavat viruksia, jotka ovat kommensaalisia tai vain hengitystieinfektion ilmenemismuodon yhteydessä. Äidit dokumentoivat ja heitä pyydetään tulemaan neuvolaan hengitystietulehduksen sattuessa, jossa otetaan näytteitä nenän huuhteluvedestä infektion mahdollisesti aiheuttavan viruksen tai bakteerin määrittämiseksi. Kuvaavia, kaksimuuttujia ja monimuuttujatilastoja käytetään määrittämään mikrobiotan, virusmetagenomiikan, hengitystievirusten ja hengitystieinfektion riskin välillä probiootteja saavassa ryhmässä lumelääkkeeseen verrattuna. P < 0,05 katsotaan tilastollisesti merkitseväksi.