Probiotici, microbioma respiratorio e intestinale e infezioni del tratto respiratorio nei bambini

Polmonite e diarrea sono le 2 cause più frequenti di malattie infettive nei bambini sotto i 5 anni in tutto il mondo, responsabili di 1,5 milioni di morti ogni anno. Nel 2013 corrispondevano rispettivamente al 15% e al 9% dei 6,3 milioni di decessi nei bambini sotto i 5 anni. Nel nostro Paese secondo il Ministero della Salute le infezioni respiratorie acute sono la prima causa di malattia a livello nazionale con 27.493.239 casi segnalati nel 2014 in cui la polmonite si colloca al 19° posto tra le prime 20 cause di malattia con 174.748 casi, di cui 51.893 casi (29 %) riguardano bambini di età inferiore a 5 anni e 21.404 casi (12%) in bambini di età inferiore a 1 anno; nel 2015 sono stati segnalati 148.140 casi di polmonite.

Si stima che fino all'80% dei casi di polmonite l'eziologia sia virale. È stato riportato che alcuni virus come l'adenovirus o il bocavirus possono persistere fino a 6 mesi dopo un'infezione acuta. Non è noto il momento in cui i virus entrano nel corpo e se sono commensali delle vie respiratorie o causano solo malattie e vengono eliminati dopo un'infezione acuta.

Le moderne tecniche hanno identificato diverse comunità di microbiota in persone sane e malate e comunità virali associate in una stretta interazione, che ha cambiato i concetti di patogenesi delle infezioni del tratto respiratorio. L'interazione dei virus respiratori, l'acquisizione e la colonizzazione da parte dei virus respiratori e il ruolo nella salute e nella malattia in questa nicchia che è il microbioma non è noto.

Il ruolo dei probiotici nella prevenzione delle malattie respiratorie e nel mantenimento dell'omeostasi nel microbiota è poco studiato, e ancor più la probabile relazione tra il microbiota, il viroma, i virus respiratori che potrebbero essere commensali o patogeni a livello respiratorio, il momento in cui i bambini possono essere colonizzati, e la loro regolazione con la somministrazione di probiotici.

Gli obiettivi dello studio sono determinare i cambiamenti nel microbiota intestinale e respiratorio, il viroma intestinale e respiratorio, i virus che possono essere commensali o causare malattie e il ruolo dei probiotici nella prevenzione delle malattie respiratorie durante il primo anno di vita.

Metodi Verrà condotto uno studio clinico prospettico, randomizzato, controllato, effettuando studi di metagenomica di base applicati alla clinica (medicina traslazionale). In questo studio i ricercatori hanno in programma di seguire una coorte di 120 bambini dai neonati a un anno di età. Dopo il consenso informato, i bambini saranno randomizzati in 2 gruppi, uno riceverà probiotici 4 volte a settimana per via orale e l'altro un placebo costituito da acqua sterile 4 volte a settimana. Il follow-up clinico verrà effettuato ogni 2 mesi, dove verranno raccolti lavaggi nasali e campioni di feci per determinare il microbioma intestinale e respiratorio e la metagenomica virale. Saranno condotti studi di reazione a catena della polimerasi multiplex per rilevare la presenza di virus respiratori e rilevare il momento in cui i bambini acquisiscono virus commensali o solo in caso di infezione respiratoria con manifestazioni di malattia. Le madri documenteranno e saranno invitate a venire per un consulto in caso di infezione respiratoria, in cui verranno prelevati campioni di lavaggi nasali per determinare il virus oi batteri che potrebbero causare l'infezione. Saranno utilizzate statistiche descrittive, bivariate e multivariate per determinare le associazioni tra il microbiota, la metagenomica virale, i virus respiratori e il rischio di presentare o meno un'infezione respiratoria nel gruppo che riceve i probiotici rispetto al placebo. Un p<0.05 sarà considerato statisticamente significativo.