Probiotika, respirační a střevní mikrobiom a infekce dýchacích cest u dětí

Pneumonie a průjem jsou celosvětově 2 nejčastějšími příčinami infekčních onemocnění u dětí do 5 let věku, které jsou zodpovědné za 1,5 milionu úmrtí ročně. V roce 2013 odpovídaly 15 % a 9 % z 6,3 milionů úmrtí u dětí do 5 let. Akutní respirační infekce jsou u nás podle Ministerstva zdravotnictví celorepublikově hlavní příčinou onemocnění s 27 493 239 případy hlášenými v roce 2014, z nichž pneumonie se řadí na 19. místo v 20 nejčastějších příčinách onemocnění se 174 748 případy, z toho 51 893 případů (29 %) jsou u dětí do 5 let a 21 404 případů (12 %) u dětí do 1 roku; v roce 2015 bylo hlášeno 148 140 případů zápalu plic.

Odhaduje se, že až v 80 % případů pneumonie je etiologie virová. Bylo hlášeno, že některé viry, jako je adenovirus nebo bocavirus, mohou přetrvávat až 6 měsíců po akutní infekci. Není známo, za jakou dobu se viry dostanou do těla a zda se jedná o komenzály dýchacího traktu nebo pouze způsobují onemocnění a jsou eliminovány po akutní infekci.

Moderní techniky identifikovaly různorodá společenství mikroflóry u zdravých i nemocných lidí a virová společenství spojená v úzké interakci, což změnilo pojetí patogeneze infekcí dýchacích cest. Interakce respiračních virů, získávání a kolonizace respiračními viry a role ve zdraví a nemoci v tomto výklenku, kterým je mikrobiom, nejsou známy.

Úloha probiotik v prevenci respiračních onemocnění a při udržování homeostázy v mikrobiotě je málo prozkoumána a ještě více pravděpodobný vztah mezi mikrobiotou, viromem, respiračními viry, které by mohly být komenzály nebo patogeny na respirační úrovni, doba, kdy mohou být děti kolonizovány, a jejich regulace podáváním probiotik.

Cílem studie je zjistit změny střevní a respirační mikrobioty, střevní a respirační virom, viry, které mohou být komenzální nebo způsobovat onemocnění a roli probiotik v prevenci respiračních onemocnění během prvního roku života.

Metody Bude provedena prospektivní, randomizovaná, kontrolovaná klinická studie se základními metagenomickými studiemi aplikovanými na kliniku (translační medicína). V této studii vyšetřovatelé plánují sledovat kohortu 120 dětí od novorozenců do jednoho roku věku. Po informovaném souhlasu budou děti náhodně rozděleny do 2 skupin, jedna bude dostávat probiotika 4x týdně perorálně a druhá placebo sestávající ze sterilní vody 4x týdně. Klinické sledování bude prováděno každé 2 měsíce, kde budou odebírány vzorky nosních výplachů a stolice pro stanovení střevního a respiračního mikrobiomu a virové metagenomiky. Budou provedeny multiplexní studie polymerázové řetězové reakce za účelem zjištění přítomnosti respiračních virů a zjištění doby, kdy děti získají viry komenzální nebo pouze v případě respirační infekce s projevy onemocnění. Maminky zdokumentují a budou požádány, aby se dostavily na konzultaci v případě infekce dýchacích cest, kde budou odebrány vzorky nosních výplachů k určení viru nebo bakterií, které by mohly infekci způsobit. Deskriptivní, dvourozměrné a vícerozměrné statistiky budou použity ke stanovení souvislostí mezi mikrobiotou, virovou metagenomikou, respiračními viry a rizikem přítomnosti či nepřítomnosti respirační infekce ve skupině užívající probiotika ve srovnání s placebem. Hodnota p < 0,05 bude považována za statisticky významnou.