Пробиотики, респираторный и кишечный микробиом и инфекции дыхательных путей у детей

Пневмония и диарея являются двумя наиболее частыми причинами инфекционных заболеваний у детей в возрасте до 5 лет во всем мире, от которых ежегодно умирает 1,5 миллиона человек. В 2013 г. они соответствовали 15% и 9% соответственно из 6,3 млн случаев смерти детей в возрасте до 5 лет. В нашей стране, по данным Министерства здравоохранения, острые респираторные инфекции являются ведущей причиной заболеваний по всей стране: в 2014 г. зарегистрировано 27 493 239 случаев, из которых пневмония занимает 19-е место в 20 основных причинах заболеваний с 174 748 случаями, из которых 51 893 случая (29 случаев). %) — у детей до 5 лет, а 21 404 случая (12%) — у детей до 1 года; в 2015 г. было зарегистрировано 148 140 случаев пневмонии.

Подсчитано, что до 80% случаев пневмонии имеют вирусную этиологию. Сообщалось, что некоторые вирусы, такие как аденовирус или бокавирус, могут сохраняться до 6 месяцев после острой инфекции. Время проникновения вирусов в организм и являются ли они комменсалами дыхательных путей или только вызывают заболевание и элиминируются после острой инфекции, неизвестно.

Современные методы выявили разнообразные сообщества микробиоты у здоровых и больных людей, а также вирусные сообщества, связанные в тесном взаимодействии, что изменило представления о патогенезе инфекций дыхательных путей. Взаимодействие респираторных вирусов, приобретение и колонизация респираторными вирусами и роль в здоровье и заболевании в этой нише, которая является микробиомом, неизвестны.

Роль пробиотиков в профилактике респираторных заболеваний и в поддержании гомеостаза в микробиоте мало изучена, и тем более возможная связь между микробиотой, виромой, респираторными вирусами, которые могут быть комменсалами или патогенами на респираторном уровне, время, когда дети могут быть колонизированы, и их регулирование введением пробиотиков.

Целью исследования является определение изменений кишечной и респираторной микробиоты, кишечной и респираторной виромы, вирусов, которые могут быть комменсалами или вызывать заболевания, и роли пробиотиков в профилактике респираторных заболеваний в течение первого года жизни.

Методы Будет проведено проспективное рандомизированное контролируемое клиническое исследование, в ходе которого базовые метагеномные исследования будут применяться в клинике (трансляционная медицина). В этом исследовании исследователи планируют наблюдать за когортой из 120 детей от новорожденных до годовалого возраста. После информированного согласия дети будут рандомизированы на 2 группы: одна будет получать пробиотики 4 раза в неделю перорально, а другая — плацебо, состоящее из стерильной воды 4 раза в неделю. Клиническое наблюдение будет проводиться каждые 2 месяца, при этом будут собираться смывы из носа и образцы кала для определения кишечного и респираторного микробиома и метагеномики вируса. Будут проведены мультиплексные исследования с полимеразной цепной реакцией для выявления наличия респираторных вирусов и определения времени заражения детей вирусами, которые являются комменсальными или только в случае респираторной инфекции с проявлениями болезни. Матери будут документировать, и их попросят прийти на консультацию в случае респираторной инфекции, при которой будут взяты образцы смывов из носа для определения вируса или бактерий, которые могут вызывать инфекцию. Описательная, двумерная и многомерная статистика будет использоваться для определения связи между микробиотой, вирусной метагеномикой, респираторными вирусами и риском наличия или отсутствия респираторной инфекции в группе, получающей пробиотики, по сравнению с плацебо. Значение p<0,05 будет считаться статистически значимым.