Mahasyöpään liittyvien neoantigeenien laskennallinen ennustaminen ja kokeellinen validointi
tiistai 9. elokuuta 2022 päivittänyt: University Medical Center Ho Chi Minh City (UMC)
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on kehittää menetelmiä mahasyöpäpotilaiden neoantigeenien tunnistamiseksi.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ei vielä rekrytointia
Ehdot
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Mahasyöpä (GC) on neljänneksi yleisin syöpätyyppi ja yksi johtavista syöpäkuolemien syistä Vietnamissa.
Immunoterapian, jossa käytetään tarkistuspisteestäjiä (CPI) yhdessä tietyntyyppisten kemoterapian kanssa, on kliinisesti osoitettu tarjoavan eloonjäämisetuja potilaille, joilla on diagnosoitu edennyt mahasyöpä.
CPI:n kliiniset tulokset liittyvät kuitenkin syöpään liittyvien geenien koodaavien alueiden mutaatioista johtuvien neoantigeenien määrään ja laatuun.
Syöpäsolut voivat esitellä tällaiset neoantigeenit isännän adaptiiviselle immuunijärjestelmälle ja aktivoida kasvainten vastaisia vasteita.
Tästä syystä neoantigeenien tunnistamisella olisi merkitystä immunoterapeuttisten lähestymistapojen kannalta.
Tumor Neoantigen Selection Alliancen (TESLA) tuoreet julkaisemat tiedot osoittavat, että suuri osa (98 %) ennustetuista neoantigeeneistä ei ole immunogeenisiä ja tehottomia aktivoimaan kasvainten vastaisia vasteita.
Tässä tutkimuksessa pyrimme kehittämään kattavan putkilinjan, joka sisältää sekä laskennallisia ennustustyökaluja että kokeellisia validointimäärityksiä neoantigeenien tunnistamisen tarkkuuden parantamiseksi.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Odotettu)
50
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskeluyhteys
- Nimi: Long Vo Duy
- Puhelinnumero: +84.918133915
- Sähköposti: long.vd@umc.edu.vn
Opiskelupaikat
-
-
-
Ho Chi Minh City, Vietnam, 700000
- University Medical Center Ho Chi Minh City
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
15 vuotta - 18 vuotta (Lapsi, Aikuinen)
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei käytössä
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Kaikki
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Kaikki potilaat, joilla diagnosoitiin edennyt mahasyöpä ja joille tehtiin leikkausleikkaus
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- 15-vuotiaat ja sitä vanhemmat mies- tai naispotilaat
- Diagnoosi edennyt mahasyöpä (T2-4b/N0-3/M0-1 vaihe, American Joint Committee on Cancer TNM (AJCC TNM) -järjestelmän kahdeksannen painoksen mukaan)
- Hoito-naiivi
- Ei tunneta muiden samanaikaisten syöpien osalta
- Anna kirjallinen tietoinen suostumus
Poissulkemiskriteerit:
- Riittämättömät kasvainkudokset (alle 1 cm3)
- Tietoon perustuvaa suostumusta ei voi allekirjoittaa
- Kävi hoitoon
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Kohortti
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Mahasyöpäpotilaiden neoantigeenimaisema
Aikaikkuna: 3 kuukautta tutkimuksen alusta
|
Kasvain-DNA- ja RNA-sekvensointitietojen analyysi tarjoaa mahasyöpäpotilaiden mutaatiojakauman, joka voi aiheuttaa neoantigeenejä.
Näistä neoantigeenit, jotka ovat peräisin vietnamilaisten mahasyöpäpotilaiden hotspot-mutaatioista, tunnistetaan.
|
3 kuukautta tutkimuksen alusta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
HLA-I:n esittämien ennustettujen neoantigeenien suhde
Aikaikkuna: 6 kuukautta tutkimuksen alusta
|
Laskennallisia putkia käytetään ennustamaan neoantigeenien ja HLA-molekyylien pariutumista.
Myöhemmin näiden ennustettujen neoantigeenien suhde validoidaan yhteisimmunosaostuksella anti-HLA-vasta-aineiden kanssa ja massaspektrometrialla niiden sitoutumisen vastaaviin HLA-molekyyleihin.
|
6 kuukautta tutkimuksen alusta
|
|
Niiden ennustettujen neoantigeenien suhde, jotka ovat immunogeenisiä.
Aikaikkuna: 12 kuukautta tutkimuksen alusta
|
Immunomäärityksiä käytetään sellaisten neoantigeenien tunnistamiseen, jotka voivat aktivoida CD4- ja CD8-T-soluja tappamaan kasvainsoluja ja toimia oletettuina immunoterapian ehdokkaina.
|
12 kuukautta tutkimuksen alusta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Odotettu)
Maanantai 15. elokuuta 2022
Ensisijainen valmistuminen (Odotettu)
Sunnuntai 31. joulukuuta 2023
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Sunnuntai 31. joulukuuta 2023
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Tiistai 9. elokuuta 2022
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 9. elokuuta 2022
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Torstai 11. elokuuta 2022
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Torstai 11. elokuuta 2022
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 9. elokuuta 2022
Viimeksi vahvistettu
Maanantai 1. elokuuta 2022
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 62/GCN-HDDD
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Ei
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .