Invasiivisen keuhkoaspergilloosin varhainen diagnoosi
Toissijaiset Aspergillus-infektiot ovat lisääntyneet merkittävästi viimeisen vuosikymmenen aikana, ei pelkästään primaarisen yliherkkyyden ja onkologisiin sairauksiin ja niiden hoitoon perustuvan immuunipuutosten vuoksi, vaan pääasiassa vakavien hengitystieinfektioiden (H1N1, COVID-19, bakteeri-infektiot) lisääntymisen vuoksi. . Tämä ilmenee selvimmin kriittisesti sairailla potilailla, joiden henkeä uhkaa invasiivinen keuhkoaspergilloosi (IPA). Yli 90 % tapauksista on Aspergillus fumigatus -bakteerin aiheuttamia. Viime vuosikymmeninä IPA:n varhaiseen diagnosointiin on käytetty erilaisia biomarkkereita, joilla on hyvin tunnetut käyttörajat (Aspergillus DNA, galaktomannaani, 1,3-ß-D-glukaani). Kuitenkin kliininen tarve erottaa selvästi IPA:n puhkeaminen kolonisaatiosta on paljon merkittävämpi. Nykyiset biomarkkerit tarjoavat vain "todennäköisen IPA:n" tulkinnan, ja diagnoosi vahvistetaan harvoin. Alustavien tutkimustemme perusteella uusien pienimolekyylisten aineiden (sekundaaristen metaboliittien) käyttö yhdistettynä akuutin faasin proteiineihin (pentraksiini 3) mahdollistaa erittäin luotettavan välittömän IPA:n vahvistuksen. Kriittisesti sairaiden potilaiden kudosnäytteissä, bronkoalveolaarisessa huuhtelunesteessä, endotrakeaalisessa aspiraatissa, hengitystiivisteessä, seerumissa ja virtsassa pystymme tunnistamaan ja vahvistamaan IPA:n ajoissa käyttämällä erittäin herkkää massaspektrometriaa, joka havaitsee spesifisiä mikrobien sideroforeja korrelaatiossa merkittävästi lisääntyneen pitoisuuden kanssa. akuutin vaiheen isäntäproteiinia (pentraksiini 3) tuntien sisällä keuhkokudoksen tunkeutumisen alkamisesta. Prospektiivisen monikeskustutkimuksen avulla tutkijat arvioivat uusien biomarkkerien hyödyn ei-invasiivisessa IPA-vahvistuksessa, parantavat IPA-diagnostiikkaalgoritmia ja siirtävät havaitsemismenetelmän MALDI-TOF-spektrometreihin, joita käytetään laajalti kliinisissä laboratorioissa Tšekin tasavallassa. MALDI-TOF-massaspektrometriassa ionilähde on matriisiavusteinen laserdesorptio/ionisaatio (MALDI) ja massa-analysaattori on lentoajan (TOF) analysaattori.
Tutkimustulokset edistävät IPA-tapausten suurta selkeyttä, antifungaalisen hoidon tarkkaa käyttöönottoa ja parempaan kriittisesti sairaiden potilaiden eloonjäämisennustetta.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Tämä on prospektiivinen tutkimus kynnyslähtöisistä ja jatkuvista vastemuuttujista riippumattomista kontrolli- ja koeryhmistä. Viiden sairaalan tehohoitoyksiköissä on 63 vuodetta, ja ne tarjoavat 2292 potentiaalisesti sopivaa kriittisesti sairasta henkilöä vuosittain kolmen vuoden prospektiivisen tutkimuksen aikana.
Potilailta, joilla epäillään IPA:ta, kaiken tyyppiset näytteet otetaan kahdesti viikossa analysoitavaksi diagnoosipäivästä, kunnes saadaan vähintään kaksi peräkkäistä negatiivista tulosta tai potilas kotiutetaan teho-osastolta. Jos saatavilla, varastoituja näytteitä, jotka on otettu 14 - 1 päivää ennen diagnoosipäivää (pääasiassa galaktomannaaniseulonnassa käytetty seerumi ja BALF/ETA (bronkoalveolaarinen huuhteluneste/endotrakeaalinen aspiraatti), käytetään Pentraxin 3 (PTX3), Aspergillus qPCR ja HPLC-ESI-FTICR-analyysit. Tulokset raportoidaan kliinikoille vaihtelevin aikavälein keskuksen mukaan.
Kontrolli- ja koeryhmien koon odotetaan olevan suunnilleen samat. Aiempien kokeellisten ja julkaistujen tietojen perusteella odotettu AUC-arvo on 0,8 tutkimuksen tehokkuutta rajoittavalle laboratorioanalyysille. Ptx3:lle ja qPCR Aspergillukselle näytteen koko 13 kussakin ryhmässä riittää havaitsemaan merkittävän eron olettaen, että teho on 80 % ja kaksipuolinen merkitsevyystaso 0,05. Toinen tutkimuksessa käytetty määritys vaatisi vain 7 koehenkilöä kussakin ryhmässä keskimääräisen eron 4303 ja arvioitujen keskihajonnan 2500 perusteella merkittävien erojen havaitsemiseksi olettaen, että teho on 80 %, kaksipuolinen merkitsevyystaso 0,05, ja t-testi. Kun asianmukaista kynnysarvoa sovelletaan jälkimmäiseen määritykseen, odotettu AUC-arvo on 0,99, jolloin vaadittava vähimmäismäärä koehenkilöitä on 3 jokaisessa tutkimusryhmässä. Tutkijat odottavat rekisteröivänsä enemmän koehenkilöitä (yhteensä 90), jotta ryhmien arvot voivat vaihdella. Kliinisten näytteiden tilastollinen analyysi suoritetaan R 4.0.2:ssa käyttäen standardikirjastoja tutkivaan data-analyysiin. Kuvaavat tilastot raportoidaan keskiarvon, mediaanin, keskihajonnan, keskiarvon keskivirheen ja variaatiokertoimen muodossa. Erot miesten suhteissa ja iässä arvioidaan käyttämällä Wilcoxonin rank-sum -testiä yhtäläiselle varianssille. Näytetiheyttä verrataan Fisherin tarkkaan testiin. Aineiston normaalijakauma (ikä ja sukupuoli) testataan Shapiro-Wilk-normaalisuustestillä. Jos tiedot eivät täytä normaalisuusvaatimusta, ei-parametrista Kruskal-Wallis-testiä seuraa post hoc -parikohtainen Wilcoxonin signed-rank testi datan lisäanalyysiä varten; kaikissa edellä mainituissa testeissä p < 0,05 katsotaan tilastollisesti merkitseväksi. R-kirjaston cutpointer arvioi optimaalisen raja-arvon, ja ROC-ominaisuudet, spesifisyys ja herkkyys määritetään. Maksimoi spline-, gam- ja häviöarviot mittareiden tarkkuudelle sekä herkkyyden ja spesifisyyden summalle, ja Youden-indeksimenetelmien ytimen arviota käytetään raja-arvoarvioihin. Väärin negatiiviset ja vääriä positiiviset luvut lasketaan kontrollina todennäköisen IPA:n ja ei-IPA:n perusteella.
Potilaat, joilla epäillään IPA:ta, jotka määritellään isäntätekijöiden, viittaavan kuvantamisen ja kliinisten oireiden perusteella Euroopan syöväntutkimus- ja hoitojärjestön / Mycoses Study Group Education and Research Consortiumin (EORTC/MSGERC) tarkistetun vuoden 2008 konsensusmääritelmien mukaisesti. Vuonna 2019 hänet rekrytoidaan viiteen sairaalakeskukseen Tšekin tasavallassa 1.6.2023–31.12.2025 (kohortti 1). Mykologiset ja kliiniset tutkimukset suoritetaan jokaisessa keskuksessa tavanomaisten menettelytapojen mukaisesti (kuvaus, mykologinen viljely, tunnistus mikroskopialla ja histopatologinen tutkimus). Kudosnäytteistä, BALF:sta ja/tai ETA:sta tunnistettujen hyfien molekyylidetektio suoritetaan käyttämällä Aspergillus-kvantitatiivista PCR:ää (qPCR). IPA-spesifinen akuutin vaiheen biomarkkerin PTX3 nousu analysoidaan BALF- ja/tai ETA- ja seerumin kaupallisissa PTX3-immunomäärityksissä. Spesifisten Aspergillus sideroforien TafC, TafB, Fc ja sekundäärisen metaboliitin Gtx massaspektrometrinen tunnistus kudosbiopsioista (jos saatavilla), virtsasta, BC:stä (intuboitu potilas), BALF:sta ja/tai ETA:sta suoritetaan käyttämällä HPLC/ESI-FTICR ( co-PI 1). Kaikki muut tutkimukset ja hoidot, mukaan lukien aspergilloosin hoito, perustuvat kunkin yhteishakijaryhmän standardeihin kussakin keskuksessa määriteltyjen menettelyjen mukaisesti. Populaatiotiedot, kliiniset ja biologiset tiedot, taustalla olevat sairaudet, sairaushistoria, biologia, kuvantaminen, aika diagnoosiin ja hoitoon kerätään jokaisesta potilaasta ilmoittautumisen jälkeen ja tallennetaan kussakin keskuksessa käyttämällä online-Castor EDC:tä (Castor's Decentralized Clinical Trials Platform, www. .castoredc.com). Galaktomannaaniantigeenin, 1,3-β-D-glukaanin, PTX3:n ja Aspergillus qPCR -määrityksen rutiinimääritys suoritetaan yhteistyössä osallistuvan Ostravan kansanterveysinstituutin ja Ostravan yliopiston lääketieteellisen tiedekunnan määrittelemien menettelyjen mukaisesti. HPLC/ESI-FTICR-analyysin suorittaa Tšekin tasavallan tiedeakatemian mikrobiologian instituutti Prahassa. TafC-rikastuksen affiniteettipuhdistuskolonnilla suorittaa toinen hakija University Hospital Olomouc, ja MS-analyysit (HPLC/ESI-FTICR, ESI-FTICR ja MALDI-TOF) tekee yhteishakija Institute of Microbiology, Academy of Sciences. , Tšekin tasavalta Prahassa. Ensimmäisen histologisen tai positiivisen mykologisen näytteen näytteenottopäivä määritellään päiväksi 0 (D0). Potilaat luokitellaan kuukaudella 6 mahdollisiksi, todennäköisiksi tai todistetuiksi IPA:ksi 2019 EORTC/MSGERC-kriteerien mukaan.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Jiří Hynčica
- Puhelinnumero: 2587 0042059737
- Sähköposti: jiri.hyncica@fno.cz
Opiskelupaikat
-
-
Moravian-Silesian Region
-
Havířov, Moravian-Silesian Region, Tšekki, 736 01
- Rekrytointi
- Havířov Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Robert Bocek, MD
- Puhelinnumero: 1834 0042059649
- Sähköposti: robert.bocek@nemhav.cz
-
Päätutkija:
- Robert Bocek, MD
-
Krnov, Moravian-Silesian Region, Tšekki, 794 01
- Rekrytointi
- Krnov Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Zbyněk Vrba, MD
- Puhelinnumero: 0143 0042055469
- Sähköposti: vrba.zbynek@szzkrnov.cz
-
Päätutkija:
- Zbyněk Vrba, MD
-
Ostrava, Moravian-Silesian Region, Tšekki, 708 52
- Rekrytointi
- University Hospital Ostrava
-
Ottaa yhteyttä:
- Jiří Hynčica
- Puhelinnumero: 2587 0042059737
- Sähköposti: jiri.hyncica@fno.cz
-
Päätutkija:
- Jozef Škarda, Assoc.Prof.,MD,DVM,PhD
-
Ostrava, Moravian-Silesian Region, Tšekki, 702 00
- Rekrytointi
- Public Health Institute Ostrava
-
Ottaa yhteyttä:
- Radim Dobiáš, Mgr.,PhD
- Puhelinnumero: 0239 0042059620
- Sähköposti: radim.dobias@zuova.cz
-
Päätutkija:
- Radim Dobiáš, Mgr.,PhD
-
Ostrava, Moravian-Silesian Region, Tšekki, 703 00
- Rekrytointi
- University of Ostrava
-
Ottaa yhteyttä:
- Lenka Kramná, Mgr.,PhD
- Puhelinnumero: 1741 0042055346
- Sähköposti: lenka.kramna@osu.cz
-
Päätutkija:
- Lenka Kramná, Mgr.,PhD
-
Ostrava, Moravian-Silesian Region, Tšekki, 728 80
- Rekrytointi
- Municipal Hospital Ostrava
-
Ottaa yhteyttä:
- Štefan Kis Pisti, MD
- Puhelinnumero: 2656 0042059619
- Sähköposti: aro@mnof.cz
-
Päätutkija:
- Štefan Kis Pisti, MD
-
-
Olomouc Region
-
Olomouc, Olomouc Region, Tšekki, 779 00
- Rekrytointi
- University Hospital Olomouc
-
Ottaa yhteyttä:
- Milan Raška, prof.,MD,PhD
- Puhelinnumero: 2751 0042058563
- Sähköposti: milan.raska@upol.cz
-
Päätutkija:
- Milan Raška, prof.,MD,PhD
-
Alatutkija:
- Vladimír Havlíček, prof.,Ing.,PhD
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- hengitystiheys ≥ 30 hengitystä/min
- PaO2/FiO2-suhde ≤ 250
- multilobar-infiltraatteja
- hämmennys/häiriö
- uremia (veren ureatyppipitoisuus ≥ 20 mg/dl)
- leukosytoosi (valkosolujen määrä > 12000/ml) tai
- leukopenia (valkosolujen määrä < 4 x 109/l)
- trombosytopenia (verihiutaleiden määrä < 100 x 109/l)
- hypertermia (ytimen lämpötila > 38 °C)
- hypotermia (ytimen lämpötila < 36 °C)
- hypotensio, joka vaatii aggressiivista nesteen elvyttämistä
- invasiivinen mekaaninen ventilaatio ja septinen sokki, jotka vaativat vasopressoreita
- Bronkoalveolaarinen huuhteluneste (BALF) ja/tai endotrakeaalinen aspiraatti (ETA)
Poissulkemiskriteerit:
- potilaat, joille PTX3:a, Aspergillus qPCR:ää ja HPLC-FTICR:ää ei tehty tai ne tehtiin sienilääkehoidon aloittamisen jälkeen
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
IPA-epäily ilmoittautumisen yhteydessä
Tähän opintoryhmään sisällytetään tutkimuskohteet, jotka epäilevät IPA:ta ilmoittautumisen yhteydessä.
|
Varhaisen invasiivisen aspergilloositestin seuraavan sukupolven parannus on tarkoitettu uusien mahdollisten aspergilloosin biomarkkerien soveltuvuuden määrittämiseen.
|
|
Todennäköinen tai todistettu IPA ilmoittautumisen yhteydessä
Tähän tutkimusryhmään sisällytetään tutkimuskohteet, joilla on todennäköinen tai todistettu IPA ilmoittautumisen yhteydessä.
|
Varhaisen invasiivisen aspergilloositestin seuraavan sukupolven parannus on tarkoitettu uusien mahdollisten aspergilloosin biomarkkerien soveltuvuuden määrittämiseen.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
IPA:n pitoisuus massaspektrometriassa
Aikaikkuna: 31 kuukautta
|
IPA tunnistetaan ja analysoidaan ajoissa kriittisesti sairaiden potilaiden kudosnäytteistä (keuhkoalveolaarinen huuhteluneste, endotrakeaalinen aspiraatti, hengityskondensaatti, seerumi ja virtsa) käyttämällä erittäin herkkää massaspektrometriaa, joka havaitsee spesifisiä mikrobisia sideroforeja korrelaatiossa merkittävästi lisääntyneen akuutin pitoisuuden kanssa. vaiheen isäntäproteiini (pentraksiini 3) muutaman tunnin sisällä keuhkokudoksen invaasion alkamisesta.
Tutkimustulokset edistävät IPA-tapausten suurta selkeyttä, antifungaalisen hoidon tarkkaa käyttöönottoa ja parempaa ennustetta kriittisesti sairaiden potilaiden eloonjäämisestä prospektiivisessa tutkimuksessa, joka koskee kynnyspohjaista ja jatkuvaa vastemuuttujaa riippumattomista kontrolli- ja koeryhmistä. .
|
31 kuukautta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Jozef Škarda, Assoc.Prof.,MD,DVM,PhD, University Hospital Ostrava
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- De Pauw B, Walsh TJ, Donnelly JP, Stevens DA, Edwards JE, Calandra T, Pappas PG, Maertens J, Lortholary O, Kauffman CA, Denning DW, Patterson TF, Maschmeyer G, Bille J, Dismukes WE, Herbrecht R, Hope WW, Kibbler CC, Kullberg BJ, Marr KA, Munoz P, Odds FC, Perfect JR, Restrepo A, Ruhnke M, Segal BH, Sobel JD, Sorrell TC, Viscoli C, Wingard JR, Zaoutis T, Bennett JE; European Organization for Research and Treatment of Cancer/Invasive Fungal Infections Cooperative Group; National Institute of Allergy and Infectious Diseases Mycoses Study Group (EORTC/MSG) Consensus Group. Revised definitions of invasive fungal disease from the European Organization for Research and Treatment of Cancer/Invasive Fungal Infections Cooperative Group and the National Institute of Allergy and Infectious Diseases Mycoses Study Group (EORTC/MSG) Consensus Group. Clin Infect Dis. 2008 Jun 15;46(12):1813-21. doi: 10.1086/588660.
- Alanio A, Delliere S, Fodil S, Bretagne S, Megarbane B. Prevalence of putative invasive pulmonary aspergillosis in critically ill patients with COVID-19. Lancet Respir Med. 2020 Jun;8(6):e48-e49. doi: 10.1016/S2213-2600(20)30237-X. Epub 2020 May 20. No abstract available.
- Bossuyt PM, Reitsma JB, Bruns DE, Gatsonis CA, Glasziou PP, Irwig L, Lijmer JG, Moher D, Rennie D, de Vet HC, Kressel HY, Rifai N, Golub RM, Altman DG, Hooft L, Korevaar DA, Cohen JF; STARD Group. STARD 2015: an updated list of essential items for reporting diagnostic accuracy studies. BMJ. 2015 Oct 28;351:h5527. doi: 10.1136/bmj.h5527.
- Latge JP, Chamilos G. Aspergillus fumigatus and Aspergillosis in 2019. Clin Microbiol Rev. 2019 Nov 13;33(1):e00140-18. doi: 10.1128/CMR.00140-18. Print 2019 Dec 18.
- Dobias R, Jaworska P, Tomaskova H, Kanova M, Lyskova P, Vrba Z, Holub C, Svobodova L, Hamal P, Raska M. Diagnostic value of serum galactomannan, (1,3)-beta-d-glucan, and Aspergillus fumigatus-specific IgA and IgG assays for invasive pulmonary aspergillosis in non-neutropenic patients. Mycoses. 2018 Aug;61(8):576-586. doi: 10.1111/myc.12765. Epub 2018 Jun 11.
- Koehler P, Bassetti M, Chakrabarti A, Chen SCA, Colombo AL, Hoenigl M, Klimko N, Lass-Florl C, Oladele RO, Vinh DC, Zhu LP, Boll B, Bruggemann R, Gangneux JP, Perfect JR, Patterson TF, Persigehl T, Meis JF, Ostrosky-Zeichner L, White PL, Verweij PE, Cornely OA; European Confederation of Medical Mycology; International Society for Human Animal Mycology; Asia Fungal Working Group; INFOCUS LATAM/ISHAM Working Group; ISHAM Pan Africa Mycology Working Group; European Society for Clinical Microbiology; Infectious Diseases Fungal Infection Study Group; ESCMID Study Group for Infections in Critically Ill Patients; Interregional Association of Clinical Microbiology and Antimicrobial Chemotherapy; Medical Mycology Society of Nigeria; Medical Mycology Society of China Medicine Education Association; Infectious Diseases Working Party of the German Society for Haematology and Medical Oncology; Association of Medical Microbiology; Infectious Disease Canada. Defining and managing COVID-19-associated pulmonary aspergillosis: the 2020 ECMM/ISHAM consensus criteria for research and clinical guidance. Lancet Infect Dis. 2021 Jun;21(6):e149-e162. doi: 10.1016/S1473-3099(20)30847-1. Epub 2020 Dec 14.
- Pfister J, Summer D, Petrik M, Khoylou M, Lichius A, Kaeopookum P, Kochinke L, Orasch T, Haas H, Decristoforo C. Hybrid Imaging of Aspergillus fumigatus Pulmonary Infection with Fluorescent, 68Ga-Labelled Siderophores. Biomolecules. 2020 Jan 22;10(2):168. doi: 10.3390/biom10020168.
- Henneberg S, Hasenberg A, Maurer A, Neumann F, Bornemann L, Gonzalez-Menendez I, Kraus A, Hasenberg M, Thornton CR, Pichler BJ, Gunzer M, Beziere N. Antibody-guided in vivo imaging of Aspergillus fumigatus lung infections during antifungal azole treatment. Nat Commun. 2021 Mar 17;12(1):1707. doi: 10.1038/s41467-021-21965-z.
- Meersseman W, Lagrou K, Maertens J, Wilmer A, Hermans G, Vanderschueren S, Spriet I, Verbeken E, Van Wijngaerden E. Galactomannan in bronchoalveolar lavage fluid: a tool for diagnosing aspergillosis in intensive care unit patients. Am J Respir Crit Care Med. 2008 Jan 1;177(1):27-34. doi: 10.1164/rccm.200704-606OC. Epub 2007 Sep 20.
- Cao XJ, Li YP, Xie LM, Zhang HL, Qin YS, Guo XG. Diagnostic Accuracy of Bronchoalveolar Lavage Fluid Galactomannan for Invasive Aspergillosis. Biomed Res Int. 2020 Nov 30;2020:5434589. doi: 10.1155/2020/5434589. eCollection 2020.
- Khan A, Singh P, Srivastava A. Synthesis, nature and utility of universal iron chelator - Siderophore: A review. Microbiol Res. 2018 Jul-Aug;212-213:103-111. doi: 10.1016/j.micres.2017.10.012. Epub 2017 Nov 2.
- Schrettl M, Bignell E, Kragl C, Sabiha Y, Loss O, Eisendle M, Wallner A, Arst HN Jr, Haynes K, Haas H. Distinct roles for intra- and extracellular siderophores during Aspergillus fumigatus infection. PLoS Pathog. 2007 Sep 28;3(9):1195-207. doi: 10.1371/journal.ppat.0030128.
- Skriba A, Pluhacek T, Palyzova A, Novy Z, Lemr K, Hajduch M, Petrik M, Havlicek V. Early and Non-invasive Diagnosis of Aspergillosis Revealed by Infection Kinetics Monitored in a Rat Model. Front Microbiol. 2018 Oct 8;9:2356. doi: 10.3389/fmicb.2018.02356. eCollection 2018.
- Luptakova D, Pluhacek T, Petrik M, Novak J, Palyzova A, Sokolova L, Skriba A, Sediva B, Lemr K, Havlicek V. Non-invasive and invasive diagnoses of aspergillosis in a rat model by mass spectrometry. Sci Rep. 2017 Nov 28;7(1):16523. doi: 10.1038/s41598-017-16648-z.
- Pluhacek T, Lemr K, Ghosh D, Milde D, Novak J, Havlicek V. Characterization of microbial siderophores by mass spectrometry. Mass Spectrom Rev. 2016 Jan-Feb;35(1):35-47. doi: 10.1002/mas.21461. Epub 2015 May 15.
- Kamei K, Watanabe A. Aspergillus mycotoxins and their effect on the host. Med Mycol. 2005 May;43 Suppl 1:S95-9. doi: 10.1080/13693780500051547.
- Raffa N, Keller NP. A call to arms: Mustering secondary metabolites for success and survival of an opportunistic pathogen. PLoS Pathog. 2019 Apr 4;15(4):e1007606. doi: 10.1371/journal.ppat.1007606. eCollection 2019 Apr. No abstract available.
- Vidal-Garcia M, Sanchez-Chueca P, Domingo MP, Ballester C, Roc L, Ferrer I, Revillo MJ, Pardo J, Galvez EM, Rezusta A. Disseminated aspergillosis in an immunocompetent patient with detectable bis(methylthio)gliotoxin and negative galactomannan. Rev Iberoam Micol. 2017 Jan-Mar;34(1):49-52. doi: 10.1016/j.riam.2016.05.007. Epub 2016 Dec 9.
- Lehrnbecher T, Hassler A, Groll AH, Bochennek K. Diagnostic Approaches for Invasive Aspergillosis-Specific Considerations in the Pediatric Population. Front Microbiol. 2018 Mar 26;9:518. doi: 10.3389/fmicb.2018.00518. eCollection 2018.
- Moura S, Cerqueira L, Almeida A. Invasive pulmonary aspergillosis: current diagnostic methodologies and a new molecular approach. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2018 Aug;37(8):1393-1403. doi: 10.1007/s10096-018-3251-5. Epub 2018 May 13.
- Reichenberger F, Habicht JM, Gratwohl A, Tamm M. Diagnosis and treatment of invasive pulmonary aspergillosis in neutropenic patients. Eur Respir J. 2002 Apr;19(4):743-55. doi: 10.1183/09031936.02.00256102.
- Hoenigl M, Orasch T, Faserl K, Prattes J, Loeffler J, Springer J, Gsaller F, Reischies F, Duettmann W, Raggam RB, Lindner H, Haas H. Triacetylfusarinine C: A urine biomarker for diagnosis of invasive aspergillosis. J Infect. 2019 Feb;78(2):150-157. doi: 10.1016/j.jinf.2018.09.006. Epub 2018 Sep 26.
- Orasch T, Prattes J, Faserl K, Eigl S, Duttmann W, Lindner H, Haas H, Hoenigl M. Bronchoalveolar lavage triacetylfusarinine C (TAFC) determination for diagnosis of invasive pulmonary aspergillosis in patients with hematological malignancies. J Infect. 2017 Oct;75(4):370-373. doi: 10.1016/j.jinf.2017.05.014. Epub 2017 May 31. No abstract available.
- Dobias R, Skriba A, Pluhacek T, Petrik M, Palyzova A, Kanova M, Cubova E, Houst J, Novak J, Stevens DA, Mitulovic G, Krejci E, Hubacek P, Havlicek V. Noninvasive Combined Diagnosis and Monitoring of Aspergillus and Pseudomonas Infections: Proof of Concept. J Fungi (Basel). 2021 Sep 6;7(9):730. doi: 10.3390/jof7090730.
- Kabbani D, Bhaskaran A, Singer LG, Bhimji A, Rotstein C, Keshavjee S, Liles WC, Husain S. Pentraxin 3 levels in bronchoalveolar lavage fluid of lung transplant recipients with invasive aspergillosis. J Heart Lung Transplant. 2017 Sep;36(9):973-979. doi: 10.1016/j.healun.2017.04.007. Epub 2017 Apr 19.
- Almeida MA, Almeida-Silva F, Guimaraes AJ, Almeida-Paes R, Zancope-Oliveira RM. The occurrence of histoplasmosis in Brazil: A systematic review. Int J Infect Dis. 2019 Sep;86:147-156. doi: 10.1016/j.ijid.2019.07.009. Epub 2019 Jul 19.
- Oide S, Berthiller F, Wiesenberger G, Adam G, Turgeon BG. Individual and combined roles of malonichrome, ferricrocin, and TAFC siderophores in Fusarium graminearum pathogenic and sexual development. Front Microbiol. 2015 Jan 12;5:759. doi: 10.3389/fmicb.2014.00759. eCollection 2014.
- Cilloniz C, Torres A, Niederman MS. Management of pneumonia in critically ill patients. BMJ. 2021 Dec 6;375:e065871. doi: 10.1136/bmj-2021-065871.
- Donnelly JP, Chen SC, Kauffman CA, Steinbach WJ, Baddley JW, Verweij PE, Clancy CJ, Wingard JR, Lockhart SR, Groll AH, Sorrell TC, Bassetti M, Akan H, Alexander BD, Andes D, Azoulay E, Bialek R, Bradsher RW, Bretagne S, Calandra T, Caliendo AM, Castagnola E, Cruciani M, Cuenca-Estrella M, Decker CF, Desai SR, Fisher B, Harrison T, Heussel CP, Jensen HE, Kibbler CC, Kontoyiannis DP, Kullberg BJ, Lagrou K, Lamoth F, Lehrnbecher T, Loeffler J, Lortholary O, Maertens J, Marchetti O, Marr KA, Masur H, Meis JF, Morrisey CO, Nucci M, Ostrosky-Zeichner L, Pagano L, Patterson TF, Perfect JR, Racil Z, Roilides E, Ruhnke M, Prokop CS, Shoham S, Slavin MA, Stevens DA, Thompson GR, Vazquez JA, Viscoli C, Walsh TJ, Warris A, Wheat LJ, White PL, Zaoutis TE, Pappas PG. Revision and Update of the Consensus Definitions of Invasive Fungal Disease From the European Organization for Research and Treatment of Cancer and the Mycoses Study Group Education and Research Consortium. Clin Infect Dis. 2020 Sep 12;71(6):1367-1376. doi: 10.1093/cid/ciz1008.
- Dobias R, Jaworska P, Skopelidou V, Strakos J, Visnovska D, Kanova M, Skriba A, Lyskova P, Bartek T, Janickova I, Kozel R, Cwikova L, Vrba Z, Navratil M, Martinek J, Coufalova P, Krejci E, Ulmann V, Raska M, Stevens DA, Havlicek V. Distinguishing Invasive from Chronic Pulmonary Infections: Host Pentraxin 3 and Fungal Siderophores in Bronchoalveolar Lavage Fluids. J Fungi (Basel). 2022 Nov 12;8(11):1194. doi: 10.3390/jof8111194.
- Springer J, Held J, Mengoli C, Schlegel PG, Gamon F, Trager J, Kurzai O, Einsele H, Loeffler J, Eyrich M. Diagnostic Performance of (1-->3)-beta-D-Glucan Alone and in Combination with Aspergillus PCR and Galactomannan in Serum of Pediatric Patients after Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation. J Fungi (Basel). 2021 Mar 22;7(3):238. doi: 10.3390/jof7030238.
- Springer J, Loeffler J, Heinz W, Schlossnagel H, Lehmann M, Morton O, Rogers TR, Schmitt C, Frosch M, Einsele H, Kurzai O. Pathogen-specific DNA enrichment does not increase sensitivity of PCR for diagnosis of invasive aspergillosis in neutropenic patients. J Clin Microbiol. 2011 Apr;49(4):1267-73. doi: 10.1128/JCM.01679-10. Epub 2010 Dec 29.
- Springer J, White PL, Hamilton S, Michel D, Barnes RA, Einsele H, Loffler J. Comparison of Performance Characteristics of Aspergillus PCR in Testing a Range of Blood-Based Samples in Accordance with International Methodological Recommendations. J Clin Microbiol. 2016 Mar;54(3):705-11. doi: 10.1128/JCM.02814-15. Epub 2016 Jan 6.
- Morton CO, White PL, Barnes RA, Klingspor L, Cuenca-Estrella M, Lagrou K, Bretagne S, Melchers W, Mengoli C, Caliendo AM, Cogliati M, Debets-Ossenkopp Y, Gorton R, Hagen F, Halliday C, Hamal P, Harvey-Wood K, Jaton K, Johnson G, Kidd S, Lengerova M, Lass-Florl C, Linton C, Millon L, Morrissey CO, Paholcsek M, Talento AF, Ruhnke M, Willinger B, Donnelly JP, Loeffler J; EAPCRI. Determining the analytical specificity of PCR-based assays for the diagnosis of IA: What is Aspergillus? Med Mycol. 2017 Jun 1;55(4):402-413. doi: 10.1093/mmy/myw093.
- White PL, Linton CJ, Perry MD, Johnson EM, Barnes RA. The evolution and evaluation of a whole blood polymerase chain reaction assay for the detection of invasive aspergillosis in hematology patients in a routine clinical setting. Clin Infect Dis. 2006 Feb 15;42(4):479-86. doi: 10.1086/499949. Epub 2006 Jan 17.
- Lyon GM, Abdul-Ali D, Loeffler J, White PL, Wickes B, Herrera ML, Alexander BD, Baden LR, Clancy C, Denning D, Nguyen MH, Sugrue M, Wheat LJ, Wingard JR, Donnelly JP, Barnes R, Patterson TF, Caliendo AM; AsTeC, IAAM, EAPCRI Investigators. Development and evaluation of a calibrator material for nucleic acid-based assays for diagnosing aspergillosis. J Clin Microbiol. 2013 Jul;51(7):2403-5. doi: 10.1128/JCM.00744-13. Epub 2013 Apr 24.
- Thiele C, Hirschfeld G. Confidence intervals and sample size planning for optimal cutpoints. PLoS One. 2023 Jan 3;18(1):e0279693. doi: 10.1371/journal.pone.0279693. eCollection 2023.
- Patil RH, Luptakova D, Havlicek V. Infection metallomics for critical care in the post-COVID era. Mass Spectrom Rev. 2023 Jul-Aug;42(4):1221-1243. doi: 10.1002/mas.21755. Epub 2021 Dec 2.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- EDILA
- NU23-05-00095 (Muu apuraha/rahoitusnumero: AZV, Ministry of Health of the Czech Republic)
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .