Caractéristiques clinicopathologiques des patients atteints de NSCLC associés au chromosome 2p (EML4-ALK) (ALK)

Études sur l'adénocarcinome pulmonaire. Le seul critère d'inclusion était la disponibilité de tissus pour les études de biomarqueurs. Pour identifier les réarrangements d'ALK, des études d'hybridation in situ en fluorescence (FISH) ont été réalisées sur des coupes de paraffine de 3 à 4 mm d'épaisseur provenant de NSCLC. La sonde de réarrangement Vysis LSI ALK Dual Color (séparée), étiquetée commercialement (Abbott Molecular, Abbott Park, IL) a été utilisée pour détecter tout réarrangement impliquant le gène ALK. La sonde s'hybride à la bande 2p23, de part et d'autre du point de cassure du gène ALK. Les critères d'interprétation du signal de la sonde dans au moins 200 noyaux en interphase étaient les suivants : 1) des signaux verts et orange séparés ou des signaux rouges uniques ont identifié des cellules avec ALK réarrangé ; 2) le chevauchement des signaux rouges et verts (jaunâtres) indiquait des cellules dans lesquelles ALK n'était pas réarrangé.

Les échantillons FISH positifs pour le réarrangement ALK ont été définis comme ayant des cellules avec une paire de signaux de sonde clairement séparés, ou avec > 15 % de cellules ayant une perte de la sonde 5´(centromérique). Le seuil de perte plus élevé est nécessaire car des parties de sondes peuvent être perdues lors de la coupe.

Le but de notre étude est d'évaluer l'utilité de l'IHC avec 5A4 et RT-qPCR dans la détection des réarrangements ALK dans le NSCLC par rapport à la méthode actuelle de choix, FISH. En outre, nous rapportons les données démographiques et les caractéristiques clinicopathologiques du NSCLC réarrangé par ALK dans une population latino-américaine.

Les détails cliniques de ces patients ont été inclus dans une base de données. D'autres résultats seront analysés avec le programme SPSS17