Klinikopatologiske egenskaber hos NSCLC-patienter forbundet med kromosom 2p (EML4-ALK) (ALK)

Lungeadenokarcinomundersøgelser. Det eneste inklusionskriterium var tilgængeligheden af ​​væv til biomarkørundersøgelser. For at identificere ALK-omlejringer blev fluorescens in situ hybridisering (FISH) undersøgelser udført på 3 til 4 mm tykke paraffinsnit fra NSCLC'er. Den kommercielt mærkede Vysis LSI ALK Dual Color (opdelt), adskilt omlejringsprobe (Abbott Molecular, Abbott Park, IL) blev brugt til at detektere enhver omlejring, der involverede ALK-genet. Proben hybridiserer til bånd 2p23 på hver side af ALK-genets brudpunkt. Kriterier for probesignalfortolkning i mindst 200 interfasekerner var som følger: 1) adskilte grønne og orange signaler eller enkelte røde signaler identificerede celler med omarrangeret ALK; 2) overlapning af røde og grønne signaler (gullige) indikerede celler, hvor ALK ikke var omarrangeret.

FISH-positive prøver til ALK-omlejring blev defineret som havende celler med et klart adskilt par probesignaler eller med >15% af cellerne med tab af den 5'(centromeriske) probe. Den højere tærskel for tab er nødvendig, fordi dele af sonder kan gå tabt under sektionering.

Formålet med vores undersøgelse er at evaluere nytten af ​​IHC med 5A4 og RT-qPCR i påvisningen af ​​ALK-omlejringer i NSCLC sammenlignet med den nuværende valgte metode, FISH. Yderligere rapporterer vi om de demografiske og klinikopatologiske træk ved ALK-omarrangeret NSCLC i en latinamerikansk befolkning.

Kliniske detaljer om disse patienter blev inkluderet i en database. Yderligere resultater vil blive analyseret med programmet SPSS17