Klinikopatologiska egenskaper hos NSCLC-patienter associerade med kromosom 2p (EML4-ALK) (ALK)

Studier av lungadenokarcinom. Det enda inklusionskriteriet var tillgången på vävnad för biomarkörstudier. För att identifiera ALK-omarrangemang utfördes studier av fluorescens in situ hybridisering (FISH) på 3 till 4 mm tjocka paraffinsnitt från NSCLC. Den kommersiellt märkta Vysis LSI ALK Dual Color (delad), sönderdelad omlagringssond (Abbott Molecular, Abbott Park, IL) användes för att detektera eventuella omarrangemang som involverade ALK-genen. Sonden hybridiserar till band 2p23, på vardera sidan av ALK-genens brytpunkt. Kriterier för sondsignaltolkning i minst 200 interfaskärnor var följande: 1) separerade gröna och orange signaler eller enstaka röda signaler identifierade celler med omarrangerade ALK; 2) överlappning av röda och gröna signaler (gulaktiga) indikerade celler i vilka ALK inte omarrangerades.

FISH-positiva prover för ALK-omarrangemang definierades som att de hade celler med ett klart separerat par av sondsignaler, eller med >15% av cellerna som hade förlust av den 5'(centromeriska) sonden. Den högre tröskeln för förlust är nödvändig eftersom delar av sonderna kan gå förlorade vid sektionering.

Syftet med vår studie är att utvärdera användbarheten av IHC med 5A4 och RT-qPCR vid detektion av ALK-omarrangemang i NSCLC jämfört med den nuvarande metoden FISH. Vidare rapporterar vi om demografi och klinisk patologiska egenskaper hos ALK-omarrangerad NSCLC i en latinamerikansk befolkning.

Kliniska detaljer om dessa patienter inkluderades i en databas. Ytterligare resultat kommer att analyseras med programmet SPSS17