Nouveaux biomarqueurs dans le cancer du pancréas grâce au concept EXPEL (PANEXPEL)

Les biomarqueurs qui sont facilement détectables dans les biopsies fluides sont de la plus haute importance pour le diagnostic et la prédiction de la réponse thérapeutique chez tous les patients atteints de cancer. L'adénocarcinome canalaire pancréatique (PDAC) est un exemple de malignité mortelle diagnostiquée très tardivement faute de marqueurs sensibles et fiables [1]. L'incidence et la mortalité du PDAC vont doubler dans les 15 prochaines années, ce qui est sans précédent parmi tous les types de cancer [2]. La prévention secondaire du cancer par le diagnostic précoce du PDAC sera donc un atout de préparation essentiel pour faire face à l'immense fardeau des soins de santé.

La découverte de biomarqueurs diagnostiques dépend essentiellement de la disponibilité du matériel patient idéalement collecté à différents moments de la progression de la maladie (par ex. lésion précoce, avant traitement et après récidive). Malheureusement, il est très difficile d'accéder à des biopsies fraîches de lésions pré-malignes à des fins de recherche. Ceux-ci sont nécessaires dans leur intégralité pour l'évaluation et le diagnostic histo-pathologiques. La possibilité d'utiliser des biopsies liquides (par ex. sérum, urine, salive) a apporté la promesse de contourner ce problème, ouvrant l'accès à de nombreuses biomolécules différentes telles que l'ADN circulant et les protéines. Cependant, lors de leur libération de la tumeur, ces molécules sont diluées jusqu'à plusieurs milliards de fois dans le sang avec des espèces moléculaires issues de tissus sains [3-4]. Cela entrave la découverte de novo de biomarqueurs pour diagnostiquer et comprendre la maladie.

Pour contourner ces limitations, les chercheurs ont récemment mis au point une nouvelle approche de découverte de biomarqueurs qui est non destructive et entièrement compatible avec le profilage OMICS ainsi qu'avec les procédures cliniques de routine (5). Cette dernière approche - appelée EXPEL - exploite le liquide tissulaire interstitiel qui est la source la plus riche de biomarqueurs solubles, non dilués et non contaminés. La méthode donne notamment accès aux protéines, métabolites, ARN, ADN et exosomes, permettant ainsi la découverte holistique de biomarqueurs. En raison de sa nature non destructive, EXPEL offre pour la première fois aux cliniciens et aux chercheurs la possibilité d'analyser du matériel identique, tout en n'ayant pratiquement aucun inconvénient dans leurs tâches respectives. Les chercheurs ont récemment montré la capacité de notre méthodologie à trouver de nouveaux marqueurs dans le contexte de précieux échantillons de cancer colorectal humain. Ainsi, les chercheurs sont convaincus qu'EXPEL peut être appliqué avec succès au cancer du pancréas. De plus, connaissant la proportion importante de stroma dans le PDAC (généralement 2/3 de la masse tumorale), le sécrétome du cancer du pancréas devrait être beaucoup plus riche en "facteurs de communication" solubles échangés entre les cellules cancéreuses et le tissu hôte.

En pratique clinique, la plupart des patients subissent une échographie endoscopique avec aspiration à l'aiguille fine/biopsie de la masse pancréatique pour confirmer le diagnostic de PDAC. L'aiguille est rincée dans un liquide de conservation Cytolyt® (Méthanol 30% et eau 50%) et envoyée aux pathologistes. Les microbiopsies sont fixées en paraffine puis analysées et le liquide est cytofiltré pour conserver d'éventuelles cellules tumorales. Le liquide restant de Cytolyt® est systématiquement jeté.

La présente étude repose sur l'hypothèse que ce liquide, préalablement en contact avec le tissu tumoral, pourrait contenir le sécrétome tissulaire et permettre une analyse OMICS complète du PDAC (tous stades confondus) en utilisant une procédure "EXPEL modifiée". Ce sont des conditions idéales pour l'approche EXPEL qui, en plus de trouver de nouveaux biomarqueurs, éclairera également le réseau complexe d'interactions entre les cellules cancéreuses et le stroma.

A cet effet, les investigateurs ont pour objectif de réaliser une analyse protéomique sur le liquide de conservation (Cytolyt) chez des patients ayant subi une échographie endoscopique avec ponction/biopsie à l'aiguille fine pour masse pancréatique suspecte au CHU de Montpellier entre janvier 2018 et janvier 2019.