Nové biomarkery u rakoviny slinivky pomocí EXPEL Concept (PANEXPEL)

Biomarkery, které jsou snadno detekovatelné v tekutých biopsiích, jsou nanejvýš důležité pro diagnostiku a predikci terapeutické odpovědi u všech pacientů s rakovinou. Pankreatický duktální adenokarcinom (PDAC) je příkladem smrtelné malignity, která je diagnostikována velmi pozdě kvůli nedostatku citlivých a spolehlivých markerů [1]. Incidence a mortalita PDAC se v příštích 15 letech zdvojnásobí, což je u všech typů rakoviny bezprecedentní [2]. Sekundární prevence rakoviny prostřednictvím včasné diagnostiky PDAC proto bude zásadním aktivem připravenosti na to, že bude možné čelit obrovské zdravotní zátěži.

Objev diagnostických biomarkerů v podstatě závisí na dostupnosti materiálu pacienta ideálně shromážděného v různých časových bodech během progrese onemocnění (např. časné léze, před léčbou a po recidivě). Bohužel je velmi obtížné získat čerstvé biopsie z premaligních lézí pro výzkumné účely. Ty jsou jako celek potřebné pro histopatologické hodnocení a diagnostiku. Schopnost používat tekuté biopsie (např. sérum, moč, sliny) přinesly příslib obejít tento problém a otevřít přístup k mnoha různým biomolekulám, jako je cirkulující DNA a proteiny. Po uvolnění z nádoru jsou však tyto molekuly zředěny až několik miliardkrát v krvi molekulárními druhy pocházejícími ze zdravých tkání [3–4]. To brání de novo objevu biomarkerů pro diagnostiku a pochopení onemocnění.

Aby se tato omezení obešli, výzkumníci nedávno vytvořili nový přístup k objevování biomarkerů, který je nedestruktivní a plně kompatibilní s profilováním OMICS i s rutinními klinickými postupy (5). Druhý přístup – nazvaný EXPEL – těží intersticiální tkáňový mok, který je nejbohatším zdrojem rozpustných, neředěných a nekontaminovaných biomarkerů. Metoda zejména umožňuje přístup k proteinům, metabolitům, RNA, DNA a exozomům, a umožňuje tak holistický objev biomarkerů. Vzhledem ke své nedestruktivní povaze poskytuje EXPEL poprvé jak lékařům, tak výzkumníkům příležitost analyzovat identický materiál, aniž by měl prakticky žádnou nevýhodu v příslušných úkolech. Výzkumníci nedávno prokázali schopnost naší metodologie najít nové markery v kontextu vzácných vzorků lidského kolorektálního karcinomu. Vyšetřovatelé jsou tedy přesvědčeni, že EXPEL lze úspěšně aplikovat na rakovinu slinivky břišní. Kromě toho, při znalosti důležitého podílu stromatu v PDAC (obvykle 2/3 nádorové hmoty), se očekává, že sekretom rakoviny pankreatu bude mnohem bohatší na rozpustné „komunikační faktory“ vyměňované mezi rakovinnými buňkami a hostitelskou tkání.

V klinické praxi většina pacientů podstupuje endoskopický ultrazvuk s aspirací tenkou jehlou/biopsií pankreatické hmoty k potvrzení diagnózy PDAC. Jehla se opláchne v konzervační kapalině Cytolyt® (methanol 30 % a voda 50 %) a odešle se patologům. Mikrobiopsie jsou fixovány v parafínu, poté analyzovány a kapalina je cytofiltrována, aby se uchovaly potenciální nádorové buňky. Zbytková kapalina Cytolyt® je systematicky likvidována.

Tato studie je založena na hypotéze, že tato kapalina, která byla dříve v kontaktu s nádorovou tkání, by mohla obsahovat tkáňový sekretom a umožnit komplexní OMICS analýzu PDAC (všechna stádia zmatená) pomocí „upraveného EXPEL“ postupu. To jsou ideální podmínky pro přístup EXPEL, který kromě hledání nových biomarkerů také osvětlí komplexní síť interakcí rakovinná buňka - stroma.

Za tímto účelem se vyšetřovatelé zaměřují na provedení proteomické analýzy konzervační kapaliny (Cytolyt) u pacientů, kteří podstoupili endoskopický ultrazvuk s aspirací/biopsií tenkou jehlou pro podezřelou pankreatickou masu na CHU de Montpellier mezi lednem 2018 a lednem 2019.