Новые биомаркеры рака поджелудочной железы с использованием концепции EXPEL (PANEXPEL)

Биомаркеры, которые легко обнаруживаются при биопсии жидкости, имеют огромное значение для диагностики и прогнозирования терапевтического ответа у всех онкологических больных. Аденокарцинома протоков поджелудочной железы (PDAC) является примером смертельной злокачественной опухоли, которая диагностируется очень поздно из-за отсутствия чувствительных и надежных маркеров [1]. Заболеваемость и смертность от PDAC удвоятся в ближайшие 15 лет, что беспрецедентно среди всех типов рака [2]. Таким образом, вторичная профилактика рака посредством ранней диагностики PDAC станет важным средством обеспечения готовности к столкновению с огромным бременем здравоохранения.

Обнаружение диагностических биомаркеров в значительной степени зависит от наличия материала пациента, в идеале собранного в разные моменты времени в ходе прогрессирования заболевания (например, раннее поражение, до лечения и после рецидива). К сожалению, получить свежую биопсию из предраковых поражений для исследовательских целей очень сложно. Все они необходимы для гистопатологической оценки и диагностики. Возможность использования жидкой биопсии (например, сыворотка, моча, слюна) обещали обойти эту проблему, открыв доступ ко многим различным биомолекулам, таким как циркулирующая ДНК и белки. Однако при выходе из опухоли эти молекулы разбавляются в крови до нескольких миллиардов раз молекулярными видами, происходящими из здоровых тканей [3-4]. Это препятствует открытию биомаркеров de novo для диагностики и понимания болезни.

Чтобы обойти эти ограничения, исследователи недавно разработали новый подход к обнаружению биомаркеров, который является неразрушающим и полностью совместимым с профилированием OMICS, а также с рутинными клиническими процедурами (5). Последний подход, называемый EXPEL, исследует интерстициальную тканевую жидкость, которая является самым богатым источником растворимых, неразбавленных и незагрязненных биомаркеров. Этот метод, в частности, дает доступ к белкам, метаболитам, РНК, ДНК и экзосомам, что позволяет обнаруживать целостные биомаркеры. Благодаря своему неразрушающему характеру EXPEL впервые предоставляет как клиницистам, так и исследователям возможность анализировать идентичный материал, практически не испытывая при этом неудобств при выполнении соответствующих задач. Исследователи недавно продемонстрировали способность нашей методологии находить новые маркеры в контексте ценных образцов колоректального рака человека. Таким образом, исследователи убеждены, что EXPEL можно успешно применять при раке поджелудочной железы. Кроме того, зная важную долю стромы в PDAC (обычно 2/3 массы опухоли), ожидается, что секретом рака поджелудочной железы будет намного богаче растворимыми «коммуникационными факторами», которыми обмениваются раковые клетки и ткань хозяина.

В клинической практике большинству пациентов проводят эндоскопическое ультразвуковое исследование с тонкоигольной аспирацией/биопсией массы поджелудочной железы для подтверждения диагноза PDAC. Иглу промывают консервирующей жидкостью Cytolyt® (30% метанола и 50% воды) и отправляют патологоанатомам. Микробиопсии фиксируют в парафине, затем анализируют, а жидкость подвергают цитофильтрации, чтобы сохранить потенциальные опухолевые клетки. Остаток жидкости Cytolyt® систематически выбрасывается.

Настоящее исследование основано на гипотезе о том, что эта жидкость, ранее находившаяся в контакте с опухолевой тканью, может содержать тканевый секретом и позволить провести всесторонний анализ OMICS PDAC (все этапы смешаны) с использованием «модифицированной процедуры EXPEL». Это идеальные условия для подхода EXPEL, который в дополнение к поиску новых биомаркеров также прольет свет на сложную сеть взаимодействий раковых клеток и стромы.

С этой целью исследователи намерены провести протеомный анализ жидкости для консервации (Cytolyt) у пациентов, которым в период с января 2018 по январь 2019 года было проведено эндоскопическое ультразвуковое исследование с тонкоигольной аспирационной биопсией по поводу подозрительной массы поджелудочной железы в CHU de Montpellier.