Nowe biomarkery w raku trzustki z wykorzystaniem koncepcji EXPEL (PANEXPEL)

Biomarkery, które są łatwo wykrywalne w biopsjach płynowych, mają ogromne znaczenie w diagnostyce i przewidywaniu odpowiedzi terapeutycznej u wszystkich pacjentów z rakiem. Gruczolakorak przewodowy trzustki (PDAC) jest przykładem śmiertelnego nowotworu, który jest diagnozowany bardzo późno ze względu na brak czułych i wiarygodnych markerów [1]. Częstość występowania i śmiertelność z powodu PDAC podwoi się w ciągu najbliższych 15 lat, co jest zjawiskiem bez precedensu wśród wszystkich typów nowotworów [2]. Wtórna profilaktyka raka poprzez wczesną diagnozę PDAC będzie zatem niezbędnym elementem przygotowania do stawienia czoła ogromnemu obciążeniu opieki zdrowotnej.

Odkrycie biomarkerów diagnostycznych zależy zasadniczo od dostępności materiału pacjenta, najlepiej zebranego w różnych punktach czasowych postępu choroby (np. zmiana wczesna, przed leczeniem i po nawrocie). Niestety dostęp do świeżych biopsji ze zmian przednowotworowych do celów badawczych jest bardzo trudny. Są one potrzebne w całości do oceny histopatologicznej i diagnozy. Możliwość wykorzystania biopsji płynnych (np. surowica, mocz, ślina) przyniosły obietnicę obejścia tego problemu, otwierając dostęp do wielu różnych biomolekuł, takich jak krążące DNA i białka. Jednak po uwolnieniu z guza cząsteczki te ulegają kilkumiliardowemu rozcieńczeniu we krwi z cząsteczkami pochodzącymi ze zdrowych tkanek [3-4]. Utrudnia to odkrywanie de novo biomarkerów do diagnozowania i zrozumienia choroby.

Aby obejść te ograniczenia, badacze opracowali niedawno nowatorskie podejście do odkrywania biomarkerów, które jest nieniszczące iw pełni kompatybilne z profilowaniem OMICS, jak również rutynowymi procedurami klinicznymi (5). Ta ostatnia metoda – określana jako EXPEL – wydobywa płyn tkankowy, który jest najbogatszym źródłem rozpuszczalnych, nierozcieńczonych i niezanieczyszczonych biomarkerów. Metoda zapewnia w szczególności dostęp do białek, metabolitów, RNA, DNA i egzosomów, umożliwiając w ten sposób holistyczne odkrycie biomarkerów. Ze względu na swój nieniszczący charakter, EXPEL po raz pierwszy zapewnia zarówno klinicystom, jak i badaczom możliwość analizy identycznego materiału, nie mając praktycznie żadnych wad w swoich zadaniach. Badacze niedawno wykazali zdolność naszej metodologii do znajdowania nowych markerów w kontekście cennych próbek ludzkiego raka jelita grubego. Tym samym badacze są przekonani, że EXPEL może być z powodzeniem stosowany w raku trzustki. Ponadto, znając ważny udział zrębu w PDAC (zwykle 2/3 masy guza), oczekuje się, że sekretom raka trzustki będzie znacznie bogatszy w rozpuszczalne „czynniki komunikacyjne” wymieniane między komórkami nowotworowymi a tkanką gospodarza.

W praktyce klinicznej większość pacjentów poddaje się endoskopowemu USG z aspiracją/biopsją cienkoigłową guza trzustki w celu potwierdzenia rozpoznania PDAC. Igła jest płukana w płynie konserwującym Cytolyt® (metanol 30% i woda 50%) i wysyłana do patologa. Mikrobiopsję utrwala się w parafinie, a następnie analizuje, a płyn poddaje cytofiltracji w celu zatrzymania potencjalnych komórek nowotworowych. Pozostały płyn Cytolyt® jest systematycznie usuwany.

Niniejsze badanie opiera się na hipotezie, że ta ciecz, która wcześniej miała kontakt z tkanką nowotworową, może zawierać sekretom tkanki i umożliwiać kompleksową analizę OMICS PDAC (pomieszanie wszystkich etapów) przy użyciu procedury „zmodyfikowanej EXPEL”. Są to idealne warunki dla podejścia EXPEL, które oprócz znalezienia nowych biomarkerów rzuci również światło na złożoną sieć interakcji komórka nowotworowa - podścielisko.

W tym celu badacze zamierzają przeprowadzić analizę proteomiczną płynu konserwującego (Cytolyt) u pacjentów, u których w CHU de Montpellier w okresie od stycznia 2018 r.