L'étude LAVA (Lateral Flow Antigen Validation and Applicability) pour le COVID-19 (LAVA)

Au cours de la pandémie de COVID-19 en cours, le dépistage du COVID-19 chez les enfants est devenu un domaine de besoin substantiel et d'examen minutieux. La méthode de référence actuelle pour la détection du SRAS-CoV-2 est la réaction en chaîne par polymérase de la transcriptase inverse en temps réel (RT-PCR), réalisée sur un échantillon du système respiratoire. Ce test de diagnostic identifie les fragments d'ARN viral spécifiques du SRAS-CoV-2 et les amplifie. Il peut détecter même des niveaux relativement faibles d'ARN chez les personnes qui ont contracté le virus mais qui n'ont pas encore développé de charge virale élevée ou de symptômes. Il peut également détecter l'ARN après l'élimination du virus vivant, mais il reste des fragments d'ARN du virus. Ce test a une sensibilité et une spécificité analytiques élevées. Cependant, l'obtention d'un échantillon adéquat est plus difficile chez les enfants car le test est inconfortable et pas toujours bien toléré. Cela signifie que la sensibilité diagnostique est d'environ 80 %(1). Néanmoins, la RT-PCR reste actuellement la méthode de détection la plus précise du SARS-CoV-2. Cependant, les problèmes logistiques liés à la RT-PCR signifient que la disponibilité et la convivialité du test sont réduites. Cela est dû à une combinaison de facteurs, notamment la capacité du site de test, la capacité de traitement et le temps nécessaire pour traiter et rapporter les résultats par les laboratoires centralisés. Le résultat net est que la sensibilité et la spécificité élevées de la PCR sont compensées par le délai de notification des résultats. Dans les hôpitaux de soins aigus, ces retards peuvent entraîner une mauvaise circulation des patients dans les zones cliniques, une utilisation excessive des équipements de protection individuelle (EPI) ou une reconnaissance tardive de la transmission nosocomiale. Ainsi, les tests rapides sont particulièrement importants pour identifier les individus hautement infectieux, par exemple les personnes qui sont sur le point de subir une procédure générant des aérosols à haut risque, d'entrer dans une salle d'urgence bondée ou d'enquêter rapidement sur des épidémies localisées.

Des méthodes et modalités de test alternatives ont donc été explorées, notamment l'utilisation de prélèvements nasaux antérieurs pour détecter le SARS-CoV-2. La RT-PCR salivaire est également à l'étude (2, 3) mais est affectée par certaines des limites de la réalisation de la RT-PCR sur n'importe quel échantillon, comme décrit ci-dessus. Une méthode alternative de détection du SARS-CoV-2 est l'utilisation de tests antigéniques utilisant un test à flux latéral (LFA)(4). Les tests de diagnostic de détection d'antigène sont conçus pour détecter directement les protéines du SRAS-CoV-2 produites par la réplication du virus dans les sécrétions respiratoires. La plupart des tests de diagnostic rapide d'antigène utilisent une méthode d'immunodétection en sandwich utilisant un format de test à flux latéral simple à utiliser similaire à un test de grossesse. Les tests de détection d'antigènes présentent plusieurs avantages par rapport à la RT-PCR ; 1) il peut être réalisé sur un frottis nasal antérieur - prélèvement beaucoup plus acceptable chez l'enfant -, 2) les résultats peuvent être exploités rapidement à l'aide d'un kit commercial au chevet du patient, avec un résultat disponible dans les 30 minutes suivant l'intervention échantillon prélevé, et 3) il est moins coûteux d'effectuer un test d'antigène par rapport à la RT-PCR. Le compromis pour la facilité d'utilisation et la rapidité d'exécution des tests antigéniques est une diminution de la sensibilité par rapport à la RT-PCR, en particulier si la personne a une faible charge virale (par exemple, elle est au début ou à la fin de la maladie) parce que le les niveaux d'antigènes présents dans les voies respiratoires supérieures pourraient tomber en dessous du seuil de détection. La sensibilité analytique semble être d'environ 50 % dans l'ensemble, mais elle augmente pendant les périodes d'infectiosité anticipée lorsque la charge virale est > 60 000 (seuil de temps de cycle RT-PCR < 27) à environ 90 %. La spécificité des tests antigéniques a toujours été signalée comme étant très élevée (> 97 %). Ainsi, si le test d'antigène est positif, il est très probable qu'il s'agisse d'un vrai résultat et que la personne ait le COVID-19. Les tests de détection d'antigènes sont donc principalement utilisés pour détecter l'infectiosité d'un individu, plutôt que d'être utilisés comme test de diagnostic clinique pour le COVID-19.

L'application potentielle des LFA pour vaincre le Covid-19 est évidente, avec plusieurs scénarios cliniques ci-dessous démontrant des domaines où la comparaison des performances de la RT-PCR à celle des LFA pourrait améliorer les soins aux enfants et améliorer la sécurité du personnel hospitalier. Cependant, l'évaluation de l'utilisation de ces tests en milieu clinique est essentielle avant de recommander une mise en œuvre complète dans la pratique clinique de routine.

À l'heure actuelle, tous les enfants sont testés pour le COVID-19 par RT-PCR lorsqu'ils sont admis à l'hôpital, quels que soient leurs symptômes. Pendant les mois d'hiver, lorsque davantage d'enfants présentant des symptômes respiratoires chercheront des soins médicaux, les directives actuelles recommandent l'isolement ou le regroupement de ces patients à l'hôpital jusqu'à ce que leur test SARS-CoV-2 soit de retour(5). Cependant, la majorité des enfants sont susceptibles d'avoir une cause alternative à leurs symptômes, comme le virus respiratoire syncytial, l'adénovirus ou la grippe. L'identification précoce des enfants infectieux atteints de COVID-19 à l'aide d'un test au point de service permettrait une cohorte ou un isolement plus efficace et réduirait potentiellement la propagation du COVID-19 en milieu hospitalier, non seulement des enfants mais aussi de leurs parents qui sont susceptibles de être infecté en tant que contact familial. En outre, l'identification précoce des enfants atteints de COVID-19 à l'aide de LFA contribuera au respect de l'utilisation stricte des EPI pour les travailleurs de la santé qui s'occupent de ces enfants.

Les enfants admis pour des procédures électives sont actuellement également systématiquement testés pour le COVID-19 avec un prélèvement nasopharyngé avant l'admission. Ceci est effectué pour réduire le risque qu'ils hébergent le SRAS-CoV-2 au moment d'avoir une procédure générant des aérosols à haut risque (AGP), où le risque de transmission du SRAS-CoV-2 au personnel est accru. Généralement, ces enfants sont asymptomatiques, car la présence de symptômes de SG empêche souvent la réalisation d'une anesthésie. Dans cette population, les LFA pourraient être utilisés pour identifier les enfants qui incubaient le SRAS-CoV-2 au moment de l'écouvillonnage mais qui n'excrétaient pas le virus et qui ont ensuite progressé pour commencer à excréter le virus (tableau 1). L'exécution de LFA permet potentiellement d'identifier les enfants infectieux et peut être utilisée pour orienter les décisions concernant la poursuite d'une procédure et l'utilisation d'EPI chez les enfants lorsque la procédure se poursuit.

Enfin, les LFA pourraient être utilisés dans les zones hospitalières «à haut risque», en particulier les unités de soins intensifs et de dépendance élevée où les AGP à haut risque sont couramment pratiquées et où les enfants sont plus susceptibles de présenter des symptômes conformes à COVID-19. La surveillance du SRAS-CoV-2 par RT-PCR est effectuée en routine dans certaines unités, mais un délai de 24 à 48 heures dans le résultat a un impact minimal sur la pratique autour des AGP. Les LFA peuvent être utilisées comme outil de dépistage pour les patients infectieux dans ces zones afin de soutenir l'utilisation d'EPI appropriés.

Une utilisation plus poussée de ces tests pourrait également être envisagée dans le cadre du dépistage de l'infectivité des travailleurs de la santé (TS) après des expositions connues à des cas de Covid-19, afin de limiter le nombre d'absences de TS en raison d'une exposition potentielle à la fois à l'extérieur et à l'intérieur de l'hôpital. Ils pourraient également être utilisés dans la communauté, dans des contextes tels que les écoles et les clubs sportifs, pour identifier les individus infectieux. La validation et l'utilisabilité dans un cadre clinique contrôlé sont recommandées avant l'utilisation dans la communauté au sens large. L'analyse mathématique des LFA montre qu'en raison de leur haute spécificité, la valeur prédictive négative est bonne en période de forte et de faible prévalence, même lorsque la sensibilité du test est faible.