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Trajectories trascrictomiques cardio-métaboliques prédictives dans l'étude de suivi de la progéniture de Barilla (PREDICT-OMICS)

10 mars 2025 mis à jour par: Alessandra Dei Cas, Azienda Ospedaliero-Universitaria di Parma

Trajectories trascrictomiques cardio-métaboliques prédictives dans l'étude de suivi de la progéniture de Barilla: l'étude Predict-Omics.

Étude expérimentale, sans drogue, longitudinale, à un centre pour la prédiction du risque cardiométabolique chez les sujets de l'étude de Barilla Off-Spring en analysant l'évolution des signatures transcriptomiques

Aperçu de l'étude

Statut

Actif, ne recrute pas

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

Dans les sociétés occidentalisées, les maladies métaboliques et cardiovasculaires courantes ont des étiologies complexes impliquant des interactions dynamiques du génome-métagénome-environnement. On pense que les altérations moléculaires précoces qui déclenchent et soutiennent leur progression, bien que ne sont encore que partiellement comprises, partagent des racines communes sur le terrain de la résistance à l'insuline (IR). Au cours des dernières décennies, les relations réciproques entre l'IR et l'inflammation ont été démêlées, conduisant au concept général de «méta-inflammation». À son tour, le rôle de régulation joué par les signatures métaboliques dans les cellules immunitaires a conduit au concept d '"immunométabolisme". En particulier, dans ces troubles liés à la méta-inflammation, il y a une pénurie de données prospectives d'expression génique, en particulier aux premiers stades de leur histoire naturelle. Le profil d'expression génique des cellules mononucléaires du sang périphérique (PBMC) peut être une fenêtre utile et accessible sur la physiopathologie des processus se produisant dans les organes et les tissus difficiles à accès. Dans une cohorte saine profondément phénotypée, l'étude de la progéniture de Barilla, une signature transcriptomique exclusivement associée à l'IR, a été trouvée en analysant l'expression du gène de PBMC avec une nouvelle méthode de classification basée sur un rang, qui s'est également révélée discriminer les individus en bonne santé dans la maladie d'Alzheimer, l'insuffisance cardiaque chronique et les diabètes de type 2. La granularité de cette approche peut être encore améliorée en examinant l'expression des gènes dans les monocytes, en tant que cellules d'immunité innée et principalement impliquées dans les troubles inflammatoires / dégénératifs et leurs facteurs de risque. Dans cette étude longitudinale, nous visons à identifier la ou les signatures transcriptomiques dans les cellules immunitaires en circulation et les biomarqueurs inflammatoires qui prédisent ou sont associés à des changements de 15 ans dans la tolérance au glucose et / ou le phénotype athérogène de l'artère carotide. L'étude a des locaux solides: i. La cohorte de sujets offre une occasion unique d'identifier les trajectoires transcriptomiques du PBMC (ligne de base et suivi de 15 ans) qui prédisent les changements dans le phénotype cardiométabolique; ii L'évaluation transversale du profilage transcriptomique des monocytes dans la même cohorte peut révéler des signatures spécifiques à la lignée supplémentaires associées à différents cardio-métabotypes au suivi, permettant une comparaison avec le PBMC; iii. Une méthode de classification innovante basée sur des rangs - Scudo et ses extensions - seront utilisées, en plus des méthodes standard, pour calculer les analyses transcriptomiques. Les résultats de l'étude peuvent identifier les signatures et les trajectoires transcriptomiques cellulaires, qui pourraient lier les phénotypes cardiométaboliques au niveau moléculaire et cellulaire, mettant en évidence les mécanismes biologiques possibles de la sensibilité et de la progression des maladies cardiométaboliques, et en révélant un large éventail de cibles moléculaires dans la PBMC et, en particulier, des monocytes, qui peuvent être étudiés plus avant pour leur validité PBMC et, en particulier, des monocytes, qui peuvent être étudiés plus avant pour leur validité PBMC et, en particulier, des monocytes, ce qui peut être étudié plus avant pour leur validité PBMC et pour les monocytes, ce qui peut être étudié davant évaluation. Les résultats fourniront également de nouvelles informations sur les stratégies pharmacologiques ciblées pour la prévention et / ou le traitement des maladies cardiométaboliques.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

110

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

  • Italie
    • PR
      • Parma, PR, Italie, 43126
        • University of Parma, Department of Medicine and Surgery

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Oui

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Des adultes en bonne santé qui ont participé à l'étude de la progéniture de Barilla transversale en 2006-2007

La description

Critères d'inclusion:

  • Être inscrit à l'étude Off-Spring Barilla (2006-2007)
  • Capacité à comprendre les méthodes, les objectifs et les implications de l'étude, et à donner un consentement gratuit et éclairé

Critères d'exclusion:

  • Grossesse

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Participants à l'étude de la progéniture de Barilla
Autre: Évaluation des profils transcriptomiques et cardio-métaboliques
Les paramètres et variables collectés en 2006-2007 (T0) seront réévalués lors de la visite de suivi (T1), y compris la démographie, anthropométrique, les données de style de vie (habitude du tabagisme, activité physique, qualité du sommeil), analyse biochimique standard et profil inflammatoire. Pour évaluer l'évolution de la tolérance au glucose et des dommages vasculaires, des analyses de profil métaboliques (OGTT) et cardiovasculaires (écodoppler carotide) seront répétées. Pour les analyses d'expression génique, en plus de l'ARN messager des PBMC (comme à T0), l'ARN des monocytes dérivés de PBMC sera également extrait et séquencé à T1.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
La sélection d'un ensemble de gènes candidats est directement corrélé avec le développement de phénotypes métaboliques altérés
Délai: Dans les six mois suivant la visite d'inscription

Toutes les données liées à la transcriptomique des PBMC à T0 (2006-2007) seront récupérées. À T1, un échantillon de sang sera prélevé à partir de laquelle les PBMC seront isolés. L'ARN total sera purifié et sa qualité testée à l'aide de la technique fluorimétrique du Quibit et du système de station de bande. À partir du même échantillon de sang, la sous-population monocytaire sera également isolée et utilisée pour identifier la signature transcriptomique spécifique.

Les deux ensembles de données d'ARN, collectés à T0 et T1, seront traités pour identifier les signatures transcriptomiques informatives des conditions de référence et de suivi. Les ensembles seront convertis pour obtenir un profil pour un gène de symbole; Cela permettra une comparaison plus facile des signatures transcriptomiques calculées entre différents ensembles de données, facilitant l'interprétation biologique des résultats.
Dans les six mois suivant la visite d'inscription

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Sélection d'un ensemble de gènes candidats directement liés au développement de phénotypes vasculaires altérés
Délai: Dans les six mois suivant la visite d'inscription

Toutes les données liées à la transcriptomique des PBMC à T0 (2006-2007) seront récupérées. À T1, un échantillon de sang sera prélevé à partir de laquelle les PBMC seront isolés. L'ARN total sera purifié et sa qualité testée à l'aide de la technique fluorimétrique du Quibit et du système de station de bande. À partir du même échantillon de sang, la sous-population monocytaire sera également isolée et utilisée pour identifier la signature transcriptomique spécifique.

Les deux ensembles de données d'ARN, collectés à T0 et T1, seront traités pour identifier les signatures transcriptomiques informatives des conditions de référence et de suivi. Les ensembles seront convertis pour obtenir un profil pour un gène de symbole; Cela permettra une comparaison plus facile des signatures transcriptomiques calculées entre différents ensembles de données, facilitant l'interprétation biologique des résultats.
Dans les six mois suivant la visite d'inscription
Sélection d'un ensemble de gènes candidats directement liés aux phénotypes métaboliques et / ou vasculaires modifiés manifestes.
Délai: Dans les six mois suivant la visite d'inscription

Toutes les données liées à la transcriptomique des PBMC à T0 (2006-2007) seront récupérées. À T1, un échantillon de sang sera prélevé à partir de laquelle les PBMC seront isolés. L'ARN total sera purifié et sa qualité testée à l'aide de la technique fluorimétrique du Quibit et du système de station de bande. À partir du même échantillon de sang, la sous-population monocytaire sera également isolée et utilisée pour identifier la signature transcriptomique spécifique.

Les deux ensembles de données d'ARN, collectés à T0 et T1, seront traités pour identifier les signatures transcriptomiques informatives des conditions de référence et de suivi. Les ensembles seront convertis pour obtenir un profil pour un gène de symbole; Cela permettra une comparaison plus facile des signatures transcriptomiques calculées entre différents ensembles de données, facilitant l'interprétation biologique des résultats.
Dans les six mois suivant la visite d'inscription
Sélection de marqueurs directement liés au développement de phénotypes métaboliques et / ou vasculaires altérés.
Délai: Dans les six mois suivant la visite d'inscription

Toutes les données liées à la transcriptomique des PBMC à T0 (2006-2007) seront récupérées. À T1, un échantillon de sang sera prélevé à partir de laquelle les PBMC seront isolés. L'ARN total sera purifié et sa qualité testée à l'aide de la technique fluorimétrique du Quibit et du système de station de bande. À partir du même échantillon de sang, la sous-population monocytaire sera également isolée et utilisée pour identifier la signature transcriptomique spécifique.

Les deux ensembles de données d'ARN, collectés à T0 et T1, seront traités pour identifier les signatures transcriptomiques informatives des conditions de référence et de suivi. Les ensembles seront convertis pour obtenir un profil pour un gène de symbole; Cela permettra une comparaison plus facile des signatures transcriptomiques calculées entre différents ensembles de données, facilitant l'interprétation biologique des résultats.
Dans les six mois suivant la visite d'inscription
Sélection d'un ensemble de gènes candidats directement liés aux altérations des paramètres biohumoraux et du profil inflammatoire.
Délai: Dans les six mois suivant la visite d'inscription

Toutes les données liées à la transcriptomique des PBMC à T0 (2006-2007) seront récupérées. À T1, un échantillon de sang sera prélevé à partir de laquelle les PBMC seront isolés. L'ARN total sera purifié et sa qualité testée à l'aide de la technique fluorimétrique du Quibit et du système de station de bande. À partir du même échantillon de sang, la sous-population monocytaire sera également isolée et utilisée pour identifier la signature transcriptomique spécifique.

Les deux ensembles de données d'ARN, collectés à T0 et T1, seront traités pour identifier les signatures transcriptomiques informatives des conditions de référence et de suivi. Les ensembles seront convertis pour obtenir un profil pour un gène de symbole; Cela permettra une comparaison plus facile des signatures transcriptomiques calculées entre différents ensembles de données, facilitant l'interprétation biologique des résultats.
Dans les six mois suivant la visite d'inscription
Sélection d'un ensemble de gènes candidats directement liés aux altérations du mode de vie.
Délai: Dans les six mois suivant la visite d'inscription

Toutes les données liées à la transcriptomique des PBMC à T0 (2006-2007) seront récupérées. À T1, un échantillon de sang sera prélevé à partir de laquelle les PBMC seront isolés. L'ARN total sera purifié et sa qualité testée à l'aide de la technique fluorimétrique du Quibit et du système de station de bande. À partir du même échantillon de sang, la sous-population monocytaire sera également isolée et utilisée pour identifier la signature transcriptomique spécifique.

Les deux ensembles de données d'ARN, collectés à T0 et T1, seront traités pour identifier les signatures transcriptomiques informatives des conditions de référence et de suivi. Les ensembles seront convertis pour obtenir un profil pour un gène de symbole; Cela permettra une comparaison plus facile des signatures transcriptomiques calculées entre différents ensembles de données, facilitant l'interprétation biologique des résultats.
Dans les six mois suivant la visite d'inscription

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Azienda Ospedaliero-Universitaria di Parma

Collaborateurs

University of Parma

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

23 mai 2024

Achèvement primaire (Estimé)

1 juillet 2025

Achèvement de l'étude (Estimé)

31 décembre 2025

Dates d'inscription aux études

Première soumission

10 mars 2025

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

10 mars 2025

Première publication (Réel)

25 mars 2025

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

25 mars 2025

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

10 mars 2025

Dernière vérification

1 mars 2025

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Autres numéros d'identification d'étude

  • 604-2023
  • 2022FZL247 (Autre subvention/numéro de financement: PRIN-2022)

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

produit fabriqué et exporté des États-Unis.

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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