NGS を使用した進行性非扁平上皮 NSCLC における一致するサンプルの遺伝子変異の比較
次世代シーケンスを使用した進行性非扁平上皮非小細胞肺がんにおける原発腫瘍、一致する転移性リンパ節および末梢血における遺伝子変異の比較
調査の概要
状態
状態
条件
条件
介入・治療
介入・治療
詳細な説明
肺がんでは多くの遺伝子変異が検出されており、同じ患者の原発腫瘍と転移腫瘍の間で変異が異なる可能性があります。 1つは腫瘍の不均一性によって引き起こされる可能性があり、もう1つは検出技術の感度によって引き起こされる可能性があります。 そこで我々は、進行性非扁平上皮NSCLCにおける原発腫瘍、転移性LN、末梢血の間のさまざまな遺伝子変異を検出するために、より感度の高い技術であるNGSを使用することにしました。
この研究は、前向きの単一施設研究として設計されました。 35人の患者が研究に登録され、喫煙歴、がん歴、職業暴露などを含む患者の臨床データが収集され、症例報告書に記録される。 この研究で募集された患者については、肺介入技術によって原発腫瘍と転移性リンパ節が採取されます。 また、同時に約10mlの末梢血を採取します。 組織は上海胸部病院病理学部に送られ、パラフィン包埋処理され、非扁平上皮NSCLCと診断された患者については、残りの組織がDNAで抽出され、Illumina Nextseq500シーケンサーを使用して適格なDNAサンプルに対してNGSが実行される。一致した末梢血も DNA で抽出され、Illumina Nextseq500 シーケンサーを使用して NGS が実行されます。
研究の種類
研究の種類
入学 (実際)
入学
段階
段階
- 適用できない
連絡先と場所
研究場所
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Shanghai
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Shanghai、Shanghai、中国、200030
- Shanghai Chest Hospital
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参加基準
適格基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
説明
包含基準:
- 臨床検査、臨床検査および画像データにより非扁平上皮非小細胞肺がんの疑いがあり、これまで原発性肺がんと診断されたことがない患者が研究に登録される。
- 患者の臨床病期は画像データから判断されるステージ IIIA ~ IV にあり、当初は手術を受けることができないが、
- 少なくとも 1 つの原発腫瘍と少なくとも 1 つの拡大した LN が存在し、これらは低侵襲技術で生検できます。
除外基準:
- 臨床データによると、患者は良性病変、小細胞肺がん、扁平上皮がんの疑いが強くあります。
- 手術が主な治療法と考えられていました。
- 肺がんと診断され薬物治療を受けている患者、または肺がんが再発した患者は除外される。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 主な目的:診断
- 割り当て:非ランダム化
- 介入モデル:単一グループの割り当て
- マスキング:なし(オープンラベル)
アーム数
武器と介入
参加者グループ / アーム参加者グループ / アーム |
介入・治療介入・治療 |
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実験的:末梢血
末梢血サンプルから DNA が抽出され、Illumina Nextseq500 シーケンサーを使用して NGS が実行されます。
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シーケンサーは、原発腫瘍、転移性LN、患者から採取した末梢血サンプルの遺伝子変異を検出するために使用されます。
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実験的:原発腫瘍
非扁平上皮NSCLCと診断された原発腫瘍組織の遺伝子検査は、Illumina Nextseq500シーケンサーを使用したNGS技術で実施されます。
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シーケンサーは、原発腫瘍、転移性LN、患者から採取した末梢血サンプルの遺伝子変異を検出するために使用されます。
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実験的:転移性リンパ節
非扁平上皮NSCLCと診断された転移性リンパ節組織の遺伝子検査は、Illumina Nextseq500シーケンサーを使用したNGS技術で実行されます。
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シーケンサーは、原発腫瘍、転移性LN、患者から採取した末梢血サンプルの遺伝子変異を検出するために使用されます。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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一致したサンプル内の遺伝子変異
時間枠:最長1年半
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原発腫瘍、一致する転移性 LN および末梢血サンプルにおける遺伝子変異は、NGS 技術を使用して検査されます。
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最長1年半
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協力者と研究者
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Wang S, Wang Z. Meta-analysis of epidermal growth factor receptor and KRAS gene status between primary and corresponding metastatic tumours of non-small cell lung cancer. Clin Oncol (R Coll Radiol). 2015 Jan;27(1):30-9. doi: 10.1016/j.clon.2014.09.014. Epub 2014 Oct 14.
- Sherwood J, Dearden S, Ratcliffe M, Walker J. Mutation status concordance between primary lesions and metastatic sites of advanced non-small-cell lung cancer and the impact of mutation testing methodologies: a literature review. J Exp Clin Cancer Res. 2015 Sep 4;34(1):92. doi: 10.1186/s13046-015-0207-9.
- Masago K, Fujita S, Muraki M, Hata A, Okuda C, Otsuka K, Kaji R, Takeshita J, Kato R, Katakami N, Hirata Y. Next-generation sequencing of tyrosine kinase inhibitor-resistant non-small-cell lung cancers in patients harboring epidermal growth factor-activating mutations. BMC Cancer. 2015 Nov 16;15:908. doi: 10.1186/s12885-015-1925-2.
- Park S, Holmes-Tisch AJ, Cho EY, Shim YM, Kim J, Kim HS, Lee J, Park YH, Ahn JS, Park K, Janne PA, Ahn MJ. Discordance of molecular biomarkers associated with epidermal growth factor receptor pathway between primary tumors and lymph node metastasis in non-small cell lung cancer. J Thorac Oncol. 2009 Jul;4(7):809-15. doi: 10.1097/JTO.0b013e3181a94af4.
- Gomez-Roca C, Raynaud CM, Penault-Llorca F, Mercier O, Commo F, Morat L, Sabatier L, Dartevelle P, Taranchon E, Besse B, Validire P, Italiano A, Soria JC. Differential expression of biomarkers in primary non-small cell lung cancer and metastatic sites. J Thorac Oncol. 2009 Oct;4(10):1212-20. doi: 10.1097/JTO.0b013e3181b44321.
- Metzker ML. Sequencing technologies - the next generation. Nat Rev Genet. 2010 Jan;11(1):31-46. doi: 10.1038/nrg2626. Epub 2009 Dec 8.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始
研究開始
一次修了 (実際)
一次修了
研究の完了 (実際)
研究の完了
試験登録日
最初に提出
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (見積もり)
最初の投稿
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (見積もり)
投稿された最後の更新
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
最終確認日
詳しくは
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