HCV ビリオン結合タンパク質

肝細胞癌 (HCC) の出現により、その主要な原因物質の 1 つである C 型肝炎ウイルス (HCV) の生物学の徹底的な理解への探求が促されています。 HCV 粒子は、細胞タンパク質の出芽とカプシド形成を介して獲得されます。 いくつかのウイルス種に関して、ビリオン結合タンパク質がウイルスサイクルの複製、出芽/退出、または侵入/放出段階のいずれかに関与する傾向があるという証拠が増えている。

このような標的を同定すると、宿主タンパク質の限られたサブセットに対する HCV の依存性について洞察を得るのに理想的な候補が得られる可能性があり、したがって、治療のための遺伝的に安定な標的の洗練されたセットが提供される可能性があります。 このプロジェクトの目標は、臨床サンプル中の HCV ビリオンの堅牢かつ再現性の高い精製のための適切な条件を設定し、その後 HCV 結合宿主タンパク質の同定とその機能の特性評価を行うことです。 臨床サンプルから精製された HCV 粒子のプロテオミクス プロファイリングは、臨床バイオマーカー発見グレードの基準を使用して、私の博士課程後期研修中に細胞培養で成長させた HCV 粒子で同定および特徴付けされたタンパク質とオーバーレイされます。 両方のサンプル セットで特定された標的は、HCV 複製細胞を使用して in vitro 研究に供されます。 従来の生化学的および画像化法は、(i) HCV ビリオンとの物理的関連を確認するために使用されます。 (ii) HCV タンパク質との相互作用の様式を定義する。 (iii) HCV タンパク質およびビリオンとの関連のトポロジーおよび細胞内局在を解読する。 (iv) 粒子の出芽、放出または分泌、および感染力におけるそれらの機能的関与を定量的に評価する。 これらの実験で満足のいく結果が得られた候補は公開され、共同研究プログラムにおいて構造生物学のレベルでさらに研究される予定です。