HCV ビリオン結合タンパク質
C型肝炎ウイルス粒子に結合したヒトタンパク質：臨床サンプルにおける同定とウイルスのライフサイクルへの影響
肝細胞癌 (HCC) の出現により、その主要な原因物質の 1 つである C 型肝炎ウイルス (HCV) の生物学の徹底的な理解への探求が促されています。 HCV 粒子は、細胞タンパク質の出芽とカプシド形成を介して獲得されます。 いくつかのウイルス種に関して、ビリオン結合タンパク質がウイルスサイクルの複製、出芽/退出、または侵入/放出段階のいずれかに関与する傾向があるという証拠が増えている。
このような標的を同定すると、宿主タンパク質の限られたサブセットに対する HCV の依存性について洞察を得るのに理想的な候補が得られる可能性があり、したがって、治療のための遺伝的に安定な標的の洗練されたセットが提供される可能性があります。 このプロジェクトの目標は、臨床サンプル中の HCV ビリオンの堅牢かつ再現性の高い精製のための適切な条件を設定し、その後 HCV 結合宿主タンパク質の同定とその機能の特性評価を行うことです。 臨床サンプルから精製された HCV 粒子のプロテオミクス プロファイリングは、臨床バイオマーカー発見グレードの基準を使用して、私の博士課程後期研修中に細胞培養で成長させた HCV 粒子で同定および特徴付けされたタンパク質とオーバーレイされます。 両方のサンプル セットで特定された標的は、HCV 複製細胞を使用して in vitro 研究に供されます。 従来の生化学的および画像化法は、(i) HCV ビリオンとの物理的関連を確認するために使用されます。 (ii) HCV タンパク質との相互作用の様式を定義する。 (iii) HCV タンパク質およびビリオンとの関連のトポロジーおよび細胞内局在を解読する。 (iv) 粒子の出芽、放出または分泌、および感染力におけるそれらの機能的関与を定量的に評価する。 これらの実験で満足のいく結果が得られた候補は公開され、共同研究プログラムにおいて構造生物学のレベルでさらに研究される予定です。
調査の概要
研究の種類
入学 (実際)
段階
- 適用できない
連絡先と場所
研究場所
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Lyon、フランス、69004
- Service d'Hépato-Gastroentérologie Lyon Croix-Rousse Hospices Civils de Lyon
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
説明
包含基準:
- 大人> 18 歳および <60 歳
- HCV ジェノタイプ 1 に感染しており、HCV 抗体陽性。
- ウイルス血症陽性が6か月以上続いている
- ウイルス血症 > 106 IU / ml。
- 以前の治療に反応せず、2か月間抗ウイルス治療を受けなかった患者。
- 対照サンプルの場合: 以前の治療に反応し、2か月間抗ウイルス治療を受けなかった患者。
除外基準:
- 2か月以内に抗ウイルス治療を受けている、または受けた患者。
- 150mlの血液サンプルに対する適応症のある患者
- 免疫抑制療法患者
- C型肝炎以外の肝疾患のある患者。
- 肝硬変患者。
- 肝細胞癌患者。
- 以下のように定義される 1 つ以上の重度の併存疾患を持つ患者:
- HIV または HBV との同時感染。
- 血液悪性腫瘍の変化または形成不全
- インスリン依存性糖尿病
- 透析を受けた慢性腎不全
- 心不全
- 法的保護の対象となる人、または社会保障制度に加入していない、またはそのような制度の受益者ではない司法保障措置の対象者
- 妊娠中の女性
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 主な目的：基礎科学
- 割り当て：非ランダム化
- 介入モデル：並列代入
- マスキング：独身
武器と介入
参加者グループ / アーム |
介入・治療 |
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実験的：ヴィラエミック
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実験的：応答グループ
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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精製ビリオン調製物中の特定のビリオン結合タンパク質の定性的同定 (使用単位: Protein Prophet スコア)
時間枠：質量分析により候補が特定されてから 1 ～ 2 年後
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プロテイン・プロフェット・スコアを使用すると、MS アプローチにおける特定のタンパク質の同定の堅牢性を推定できます。
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質量分析により候補が特定されてから 1 ～ 2 年後
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ウイルスの形態形成におけるその関与の定量的評価（使用単位：TCID50）。
時間枠：質量分析により候補が特定されてから 1 ～ 2 年後
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TCID50 単位は、ウイルスの感染力を定量化するために HCV 研究で日常的に使用される感染力単位です。
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質量分析により候補が特定されてから 1 ～ 2 年後
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ウイルス侵入の定量的評価（使用単位：HCV RNA /GUS mRNAコピー比）。
時間枠：質量分析により候補が特定されてから 1 ～ 2 年後
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HCV RNA /GUS mRNA コピー比は、2^delta(delta Ct) 法から導出されます。
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質量分析により候補が特定されてから 1 ～ 2 年後
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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臨床ビリオン データセットと in vitro 増殖ビリオン データセットの比較
時間枠：質量分析により候補が特定されてから 1 ～ 2 年後
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臨床サンプルから精製されたウイルス粒子から同定されたタンパク質は、ヒト肝癌細胞からのウイルス粒子から同定されたタンパク質と比較されます (Huh7.5)
HCV に感染しており、そこからデータが公開されています。
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質量分析により候補が特定されてから 1 ～ 2 年後
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協力者と研究者
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捜査官
- 主任研究者：Fabien ZOULIM, MD、Service d'Hépato-Gastroentérologie Lyon Croix-Rousse Hospices Civils de Lyon
出版物と役立つリンク
研究記録日
主要日程の研究
研究開始
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (推定)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (推定)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- 2009-596
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