メタゲノム病原体シーケンシングによるカンボジアの熱性疾患の状況
メタゲノム病原体シーケンシングによるカンボジアの熱性疾患ランドスケープのキャラクタリゼーション
バックグラウンド:
ベクター媒介性疾患は、感染した蚊、ハエ、ノミ、マダニ、またはその他の吸血動物に刺されることによって引き起こされます。 これらの疾患により、年間約 100 万人が死亡しています。 そしてそれらは特に東南アジアで増加しています。 研究者は、これらの病気がカンボジアの発熱の約 10% を占めていると考えています。 しかし、これらの病気の多くは決して診断されません。 これらの病気を研究することは、それらを特定して治療するための新しい方法を見つけるのに役立ちます。
目的:
メタゲノム病原体シーケンシング プラットフォームを使用して、熱のある人の病原体を見つける。
資格:
カンボジアの紹介病院を受診する、摂氏38度以上の発熱がある生後6か月から65歳の人
デザイン:
参加者は病歴でスクリーニングされます。 子供たちは、血液サンプルを提供するのに十分な大きさであることを確認するために体重を量ります。
参加者は、性別、年齢、住んでいる場所に関するデータを共有します。 彼らは、自分の健康歴についてさらに多くの質問に答えます。 彼らは、最近旅行した場所についての質問に答えます。 彼らはアンケートを取ります。 彼らは血液検査を受けます。
マラリア陽性の2歳以上の参加者は、もう1回血液検査を受けます。
参加は2日まで…。
調査の概要
状態
状態
詳細な説明
ベクター媒介性疾患は、特に東南アジアで、世界的に重大な罹患率と死亡率を引き起こし続けています。 しかし、資源の乏しい国では利用できる診断法が不足しているため、多くのベクター媒介性疾患は診断されず、その影響は過小評価されています。 横断的レトロスペクティブ調査により、蚊が媒介するウイルスや外部寄生虫が媒介するリケッチア病を含む多くの疾患に対する抗体の有病率が予想よりも高いことが明らかになりました。
ここでは、カンボジアの小児および成人における原因不明の病気の可能性のある感染病因を調査するために、新しいゲノミクス技術 (偏りのない次世代シーケンシング) を使用してカンボジアの熱性疾患の状況をよりよく説明するために、発熱者から標本を収集することを目指しています。 配列決定により、公衆衛生上懸念される伝染性の高い病原体が特定された場合、回復期のサンプルを採取し、血清学的アッセイを使用して濃厚接触者をスクリーニングし、疾患の負荷に対する理解をさらに深めます。 現在、世界中でベクター媒介性疾患が増加しているため、この研究の結果が、この地域におけるベクター媒介性疾患の疫学と負担をよりよく理解するのに役立つことを願っています。
研究の種類
研究の種類
入学 (推定)
入学
連絡先と場所
研究連絡先
研究連絡先
- 名前:Christina C Yek, M.D.
- 電話番号:(202) 359-2641
- メール:christina.yek@nih.gov
研究場所
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Chbar Mon、カンボジア
- 募集
- Kampong Speu Referral Hospital
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コンタクト:
- Christina Yek, M.D.
- 電話番号:(202) 359-2641
- メール:christina.yek@nih.gov
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Phnom Penh、カンボジア
- 募集
- National Pediatric Hospital
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コンタクト:
- Christina Yek, M.D.
- 電話番号:(202) 359-2641
- メール:christina.yek@nih.gov
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Phnom Penh、カンボジア
- 募集
- Preah Kossomak Hospital
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コンタクト:
- Christina Yek, M.D.
- 電話番号:(202) 359-2641
- メール:christina.yek@nih.gov
-
Phnom Penh、カンボジア
- 募集
- Kantha Bopha Hospital
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コンタクト:
- Christina Yek, M.D.
- 電話番号:(202) 359-2641
- メール:christina.yek@nih.gov
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Phnom Penh、カンボジア
- 募集
- Khmer-Soviet Friendship Hospital
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コンタクト:
- Christina Yek, M.D.
- 電話番号:(202) 359-2641
- メール:christina.yek@nih.gov
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Takeo、カンボジア
- 募集
- Takeo District Referral Hospital
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コンタクト:
- Christina Yek, M.D.
- 電話番号:(202) 359-2641
- メール:christina.yek@nih.gov
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参加基準
適格基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
- 包含基準:
この研究に参加する資格を得るには、個人は次の基準をすべて満たす必要があります。
署名と日付が記入されたインフォームド コンセント フォームの提供。
-すべての研究手順を遵守する意思を表明した。
生後 6 か月から 65 歳までの男性または女性で、過去 24 時間に摂氏 38 度以上の発熱が記録されている。
生物学的サンプルが将来の研究のために保存され、すべての匿名化されたメタゲノム配列決定データが公的にアクセス可能なデータベースに保存されることを許可します。
次のケース定義のいずれかを満たしています。
- 発熱患者: 過去 24 時間に 38 (無限) C 以上の発熱が記録されています。
- 無熱性濃厚接触者:メタゲノムシーケンシングで既知の赤旗または黄旗の伝染性病原体で発病した時点で、熱のある登録者と同じ家庭に住んでいたか、同じ密閉された作業スペースで毎日働いていた無熱の個人です。
生物学的サンプルが将来の研究のために保存され、すべての匿名化されたメタゲノム配列決定データが公的にアクセス可能なデータベースに保存されることを許可します。
除外基準:
治験責任医師の意見では、研究への参加を妨げる可能性のある基礎疾患、慢性疾患、または現在の病状(例: 採血ができない、または非常に困難である)。
前月に手術を受けた熱のある人。
-最初の研究採血から30日以内にこの研究に登録して終了した熱のある個人、または登録して14日以内に終了した無熱の濃厚接触者。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:コホート
- 時間の展望:断面図
グループ/コホートの数
コホートと介入
グループ/コホートグループ/コホート |
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熱性濃厚接触者
既知の高度に病的な病原体および/または伝染性の病原体に感染した時点で、発熱している登録者と同じ世帯に住んでいた、または毎日同じ密閉された作業場で働いていた。
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発熱患者
発熱を伴う、または臨床的に検証された検査によって高度に病的および/または伝染性の病原体と診断された、生後2か月から65歳までの患者。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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病原体配列の同定
時間枠:登録(0日目から2日目の間)
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これは、カンボジアの都市近郊において、原因不明の発熱性疾患のどの部分が媒介媒介であるかを特徴づける試みである。
この研究のデータは、今後の研究の指針として使用されます。
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登録(0日目から2日目の間)
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二次結果の測定
二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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ELISAまたはウエスタンブロットアッセイによって検出される、適切なベクターの唾液腺ホモジネート反応性に対する反応性の評価。
時間枠:登録(0~2日目)
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ベクター媒介疾患を持つカンボジア人のベクター唾液タンパク質反応性プロファイル (蚊、マダニ、ノミ) の特徴を明らかにすることは、感染パターン、原因となるベクター、カンボジアの人々がこれらのベクターに曝露するリスクをよりよく理解するための最初のステップです。
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登録(0~2日目)
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協力者と研究者
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捜査官
捜査官
- 主任研究者:Christina C Yek, M.D.、National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Vong S, Khieu V, Glass O, Ly S, Duong V, Huy R, Ngan C, Wichmann O, Letson GW, Margolis HS, Buchy P. Dengue incidence in urban and rural Cambodia: results from population-based active fever surveillance, 2006-2008. PLoS Negl Trop Dis. 2010 Nov 30;4(11):e903. doi: 10.1371/journal.pntd.0000903.
- Gu W, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Next-Generation Sequencing for Pathogen Detection. Annu Rev Pathol. 2019 Jan 24;14:319-338. doi: 10.1146/annurev-pathmechdis-012418-012751. Epub 2018 Oct 24.
- Tabor A, Valle MR. Report from the 'One Health' 9th Tick and Tick-Borne Pathogen Conference and the 1st Asia-Pacific Rickettsia Conference, Cairns, Australia, 27th August-1st September 2017. Vet Sci. 2018 Oct 2;5(4):85. doi: 10.3390/vetsci5040085.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
研究開始
一次修了 (推定)
一次修了
研究の完了 (推定)
研究の完了
試験登録日
最初に提出
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
最初の投稿
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
投稿された最後の更新
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
その他の研究ID番号
その他の研究ID番号
- 999919109
- 19-I-N109
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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