MALDI-TOF MS プロファイリングによるヒト唾液中の SARS-CoV2 (COVID-19) 診断 (CoviDiagMS)
2020 年 3 月以降、SARS-CoV2 ウイルス (nCoV19; COVID-19) はパンデミックと見なされています。 ヒト集団におけるその蔓延率と感染率が高く、効果的で有効な治療法がないため、いくつかの国の当局は COVID-19 の蔓延を遅らせるために人口を制限しています。 この健康危機の管理の一環として、「感染者」を隔離するために個人のスクリーニングが不可欠です。 これらのスクリーニング検査は現在、ウイルス RNA の検出に RT-PCR を使用して鼻咽頭スワブで実施されています。 高感度で特異的ではありますが、これらの検査は依然として比較的長く (2 ~ 5 時間)、高価であり、核酸抽出キットと酵素に対する国際的な需要が高いため、広範なスクリーニングの実施を制限する要因となっています (スワブや分子生物学の消耗品の供給の問題)。
スクリーニング手段の不足のリスクを防ぐために、MALDI-TOF MS プロファイリングによるヒト唾液中の特定のタンパク質シグネチャの検出に基づいて、PCR を使用しない革新的な代替戦略を開発することを提案します。 MALDI-TOF MS プロファイリングは、微生物を同定するための微生物学研究所によるルーチン診断で使用される方法です。 MALDI-TOF MS プロファイリングは、唾液の分析に基づいて感染状態 (口腔病状) に従って個人を分類するために使用されてきましたが、細胞培養上清から呼吸器ウイルスを識別するためのツールとしても使用されています。 さらに、当社は MALDI-TOF MS プロファイリングの分野における専門知識とスキルを備えており、特に昆虫学的およびベクター同定プロジェクトのコンテキストにおいて、プロファイルとその分析の質を向上させるための新しい戦略を実装しました。 最後に、最近の中国の研究では、COVID-19 が RT-PCR によって唾液から検出可能であることが報告されています。
この研究の主な目的は、唾液サンプルから SARS-CoV2 に感染した個人を検出するための MALDI-TOF プロファイリング法に基づくテストを開発することです。
調査の概要
状態
状態
条件
条件
研究の種類
研究の種類
入学 (実際)
入学
連絡先と場所
研究連絡先
研究連絡先
- 名前:Lionel ALMERAS, PhD
- メール:almeras.lionel@gmail.com
研究連絡先のバックアップ
- 名前:Emilie JAVELLE, MD
- 電話番号:+33 491617459
- メール:emilie.javelle@intradef.gouv.fr
研究場所
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Marseille、フランス、13013
- Hôpital d'Instruction des Armées Laveran
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参加基準
適格基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 18歳;
- 含める前96時間以内に鼻咽頭スワブからRT-PCRによりSARS-CoV2についてスクリーニングした。
除外基準:
- -集中治療室に入院した患者;
- 妊婦。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
グループ/コホートの数
コホートと介入
グループ/コホートグループ/コホート |
介入・治療介入・治療 |
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Covid+入院グループ
SARS-CoV2感染で入院した患者
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唾液サンプルは、最大 30 日間連続して定期的に収集されます。
参加者の臨床データは、最大 30 日間連続して定期的に収集されます。
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Covid+外来グループ
SARS-CoV2感染症について外来でフォローされている患者または介護者
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唾液サンプルは、最大 30 日間連続して定期的に収集されます。
参加者の臨床データは、最大 30 日間連続して定期的に収集されます。
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Covidグループ
SARS-CoV2に感染していない介護者
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唾液サンプルは、最大 30 日間連続して定期的に収集されます。
参加者の臨床データは、最大 30 日間連続して定期的に収集されます。
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非SARS病理グループ
SARS-CoV2に感染していないが、別の急性および/または感染性の非SARS病理に感染している個人
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唾液サンプルは、最大 30 日間連続して定期的に収集されます。
参加者の臨床データは、最大 30 日間連続して定期的に収集されます。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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唾液サンプルからSARS-CoV2感染者を検出するMALDI-TOFプロファイリング法に基づく検査の開発。
時間枠:30日目
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このテストの開発は、唾液サンプルと臨床データの質量分析分析の結果を使用して、唾液サンプルと臨床データを区別するために必要な情報を決定する数学モデルの「トレーニング」を含む機械学習技術に基づいています。健康な唾液サンプルから SARS-CoV2 に感染した参加者。
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30日目
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二次結果の測定
二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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唾液検体からの検査(MALDI-TOF MSプロファイリング)による正答率
時間枠:30日目
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各唾液サンプルについて、テスト (MALDI-TOF MS プロファイリング) によるサンプルの分類 (「感染」または「感染していない」) のステータス (「正しい」または「正しくない」) が決定されます。
次に、正分類率が計算されます。
テストは、95% を超える正しい分類率に達したときに効率的であると見なされます。
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30日目
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唾液サンプルからのRT-PCRによる正分類率
時間枠:30日目
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各唾液サンプルについて、RT-PCR によるサンプルの分類 (「感染」または「感染していない」) のステータス (「正しい」または「正しくない」) が決定されます。
次に、RT-PCR による正分類率を計算します。
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30日目
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SARS-CoV2感染に特異的なタンパク質の同定
時間枠:30日目
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各唾液サンプルで、質量分析を使用してタンパク質の発現を決定します。
SARS-CoV2感染唾液サンプルと非感染唾液サンプルを比較することにより、SARS-CoV2感染唾液サンプルで特異的に発現するタンパク質の存在が決定されます。
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30日目
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RT-PCRによる陽性の抗SARS-CoV2抗体反応の存在
時間枠:30日目
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各 SARS-CoV2 感染唾液サンプルについて、抗 SARS-CoV2 抗体の存在が RT-PCR によって決定されます。
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30日目
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同定されたタンパク質マーカーと参加者の臨床経過との相関。
時間枠:30日目
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SARS-CoV2 感染参加者(Covid+ 入院群および Covid+ 外来群)において、SARS-CoV2 感染に特異的なタンパク質の存在と患者の臨床的進展との間の相関関係の存在が決定されます。
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30日目
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協力者と研究者
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
研究開始
一次修了 (実際)
一次修了
研究の完了 (実際)
研究の完了
試験登録日
最初に提出
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
最初の投稿
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
投稿された最後の更新
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
その他の研究ID番号
その他の研究ID番号
- 2020-COVID19-15
- 2020-A01249-30 (その他の識別子:IDRCB)
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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