子宮頸がんの予後を正確に予測するための第三世代ナノポア HPV 統合サイト

子宮頸がんは生殖管の最も一般的な悪性腫瘍であり、女性の健康に重大な脅威をもたらします。 世界保健機関 (WHO) のデータによると、世界中で毎年 50 万人を超える子宮頸がんの新規症例があり、約 342,000 人が死亡しています。 中国では年間約10万7000人の新規感染者が発生し、約5万1000人の患者が子宮頸がんで死亡している。 検出市場は広大であり、成長し続けています。 子宮頸がんの検査と治療後の主な検査方法には、HPV検査、細胞診スクリーニング、コルポスコピー、子宮頸部生検などがあります。 市場に出回っているすべての HPV 検査は定性的および半定量的であり、現在、HPV が持続的 HPV 陽性患者のゲノムに組み込まれているかどうかを検出できる製品は市場にありません。

私たちのチームは、以前の研究で、上皮内腫瘍のない高リスク HPV 感染患者、子宮頸部上皮内腫瘍 (CIN) I、CIN II、CIN III の患者からの細胞サンプル、および局所進行子宮頸がんのサンプルを含む 200 を超える子宮頸部細胞サンプルを登録しました。複数の時点での放射線化学療法後。 第 3 世代のナノポア技術を使用して、93 個の子宮頸部細胞サンプルの実験と分析を完了しました。 プローブハイブリダイゼーション捕捉原理に基づいて、HPV ウイルス DNA の組み込み部位を濃縮し、配列決定しました。 暫定的な結論は次のとおりです。

1. 当社は、自社開発した実験技術プロセスを通じて、長い断片のウイルスの捕捉と配列決定（平均リード長 2 ～ 5kb）を達成し、HPV 挿入部位の同定とより正確なゲノム位置特定を実現しました。 さらに、ナノポア長断片シークエンシングは、完全なヒト-ウイルス-ヒト (H-V-H) ウイルス挿入構造配列を検出できます。
2. 炎症グループ、CIN I、CIN II、CIN III グループの HPV 挿入遺伝子と、再発および転移のあるがん患者の HPV 挿入遺伝子の間には一定の割合の重複があり、これは関連する分子マーカーのスクリーニングにさらに役立ちます。腫瘍の進行と予後不良につながります。
3. 根治的放射線化学療法前後の患者サンプル中の HPV 配列の割合と挿入遺伝子の数は、治療の有効性と予後をさらに評価することができ、治療前の介入とリスク警告のためのサポートデータを提供します。

この研究の目標は、国産のナノポア配列決定プラットフォームと、中国人のHPV感染の特徴をターゲットとした自社設計のプローブと連携することです。 私たちは、末期子宮頸がん（IIIB期以降）のコホートと、根治的子宮頸がん放射線化学療法後に再発・転移した患者を対象に挿入部位の検出を実施することを目指しています。 さらに、長断片ウイルス濃縮法とナノポアシークエンシング実験プロセスを確立、最適化し、検出プロセス全体を1営業日（8時間）以内に完了させます。 これにより、ベッドサイドでの診断や分散型の方向へのテクノロジーの応用も拡大します。