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子宮頸がんの予後を正確に予測するための第三世代ナノポア HPV 統合サイト

2024年10月15日 更新者:Zhang Fuquan、Peking Union Medical College Hospital

子宮頸がんの予後を正確に予測するための第三世代ナノポア HPV 組み込み部位検出キットの開発

子宮頸がんは女性にとって重大な健康上の脅威であり、世界中で年間50万人以上の新規感染者と約34万2,000人が死亡しており、中国では約10万7,000人の新規感染者と5万1,000人が死亡している。 現在のスクリーニング方法には、HPV検査、細胞診、コルポスコピー、生検などがありますが、持続陽性患者におけるHPVゲノムの組み込みを検出できる方法はありません。

私たちのチームは、HPV 統合部位に焦点を当て、第 3 世代のナノポア技術を使用して 200 を超える子宮頸部細胞サンプルを分析してきました。 当社は、正確な HPV 挿入ポイントを特定し、完全なヒト-ウイルス-ヒト (H-V-H) ウイルス挿入配列を検出する独自の長いフラグメントのキャプチャおよびシーケンス手法 (リード平均 2 ~ 5 kb) を開発しました。 われわれは、子宮頸部上皮内腫瘍(CIN)のさまざまな段階にわたって、また再発および転移を伴うがん患者においてHPV組み込み遺伝子の重複を発見し、腫瘍の進行および予後不良の潜在的なバイオマーカーを示唆した。

また、根治的放射線化学療法の前後の患者から採取したサンプル中の HPV 配列の割合と遺伝子挿入数を分析し、治療効果と予後についての洞察を提供しました。 私たちの研究は、中国のHPV感染パターンに合わせた国産のナノポアシーケンスプラットフォームとプローブを使用して、末期子宮頸がんおよび治療後の再発/転移患者の組み込み部位を検出することを目的としています。 私たちは、検出プロセス全体を 8 時間以内に完了するように方法を最適化し、ポイントオブケア診断と分散化におけるテクノロジーの応用を拡大することを目指しています。

調査の概要

詳細な説明

子宮頸がんは生殖管の最も一般的な悪性腫瘍であり、女性の健康に重大な脅威をもたらします。 世界保健機関 (WHO) のデータによると、世界中で毎年 50 万人を超える子宮頸がんの新規症例があり、約 342,000 人が死亡しています。 中国では年間約10万7000人の新規感染者が発生し、約5万1000人の患者が子宮頸がんで死亡している。 検出市場は広大であり、成長し続けています。 子宮頸がんの検査と治療後の主な検査方法には、HPV検査、細胞診スクリーニング、コルポスコピー、子宮頸部生検などがあります。 市場に出回っているすべての HPV 検査は定性的および半定量的であり、現在、HPV が持続的 HPV 陽性患者のゲノムに組み込まれているかどうかを検出できる製品は市場にありません。

私たちのチームは、以前の研究で、上皮内腫瘍のない高リスク HPV 感染患者、子宮頸部上皮内腫瘍 (CIN) I、CIN II、CIN III の患者からの細胞サンプル、および局所進行子宮頸がんのサンプルを含む 200 を超える子宮頸部細胞サンプルを登録しました。複数の時点での放射線化学療法後。 第 3 世代のナノポア技術を使用して、93 個の子宮頸部細胞サンプルの実験と分析を完了しました。 プローブハイブリダイゼーション捕捉原理に基づいて、HPV ウイルス DNA の組み込み部位を濃縮し、配列決定しました。 暫定的な結論は次のとおりです。

  1. 当社は、自社開発した実験技術プロセスを通じて、長い断片のウイルスの捕捉と配列決定(平均リード長 2 ~ 5kb)を達成し、HPV 挿入部位の同定とより正確なゲノム位置特定を実現しました。 さらに、ナノポア長断片シークエンシングは、完全なヒト-ウイルス-ヒト (H-V-H) ウイルス挿入構造配列を検出できます。
  2. 炎症グループ、CIN I、CIN II、CIN III グループの HPV 挿入遺伝子と、再発および転移のあるがん患者の HPV 挿入遺伝子の間には一定の割合の重複があり、これは関連する分子マーカーのスクリーニングにさらに役立ちます。腫瘍の進行と予後不良につながります。
  3. 根治的放射線化学療法前後の患者サンプル中の HPV 配列の割合と挿入遺伝子の数は、治療の有効性と予後をさらに評価することができ、治療前の介入とリスク警告のためのサポートデータを提供します。

この研究の目標は、国産のナノポア配列決定プラットフォームと、中国人のHPV感染の特徴をターゲットとした自社設計のプローブと連携することです。 私たちは、末期子宮頸がん(IIIB期以降)のコホートと、根治的子宮頸がん放射線化学療法後に再発・転移した患者を対象に挿入部位の検出を実施することを目指しています。 さらに、長断片ウイルス濃縮法とナノポアシークエンシング実験プロセスを確立、最適化し、検出プロセス全体を1営業日(8時間)以内に完了させます。 これにより、ベッドサイドでの診断や分散型の方向へのテクノロジーの応用も拡大します。

研究の種類

観察的

入学 (実際)

200

連絡先と場所

このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。

研究場所

    • Beijing
      • Peking、Beijing、中国、100730
        • Peking Union Medical College Hospital

参加基準

研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。

適格基準

就学可能な年齢

  • 高齢者

健康ボランティアの受け入れ

いいえ

サンプリング方法

非確率サンプル

調査対象母集団

この研究に登録された患者は、放射線腫瘍医によってTCT処置が行われた進行期子宮頸がん(ステージIIIB以降)の患者である。 この手順では、子宮頸部の外部分泌物を除去するために、滅菌生理学的綿球が使用されます。 サイトブラシを子宮頸部病変または頸管内の扁平円柱接合部に挿入してサンプルを採取し、3~4回回転させて数秒間放置した後、細胞保存液に入れて密封して検査に送ります。 放射線腫瘍科は治療部門として、子宮頸がん患者の診断、治療、経過観察の全過程に深く関わっています。 治療中、患者は侵襲的近接照射療法を受けますが、TCT 処置よりも高いレベルの無菌性要件と操作の難しさがあり、そのため患者は TCT 標本収集を実行できます。

説明

包含基準:

  • A. 当施設または協力施設で根治的放射線化学療法を受けている。 B. 病理学的に子宮頸がんと確認された。 C. 進行期患者(FIGO病期分類IIIB、IIIC、IVA、IVB)、または根治的放射線化学療法後に局所再発もしくは遠隔転移を経験した患者と診断されている。 D. 定期的にフォローアップ訪問ができる。 E. 患者またはその家族が研究プロトコールを理解し、書面によるインフォームドコンセントを提供してこの研究に参加する意思があること。

除外基準:

  • A. 病理検査により子宮頸部神経内分泌癌と確認された。 B. 標準化された根治的治療を受けていない(ステージ IIIB 以降の子宮頸がん患者のコホートの場合、標準化された根治的放射線化学療法を受けていない人は除外されなければなりません)。 根治的放射線化学療法後に局所再発または遠隔転移を起こした患者のコホートについては、子宮頸がんの手術のみを受けて再発した患者、および子宮頸がん手術後に標準放射線化学療法を受けていない患者は除外しなければならない)。 C. HPV 検査は陰性であり、ゲノム内に HPV の明確な組み込み部位がありません。 D. 患者または家族が研究に協力できない、または書面によるインフォームドコンセントを提供できない。

研究計画

このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。

研究はどのように設計されていますか?

デザインの詳細

コホートと介入

グループ/コホート
介入・治療
進行期子宮頸がん患者群(IIIB期以降)
後期子宮頸がん(ステージ IIIB 以降)および HPV 感染に関連する治療後の再発および転移標本(TCT、組織)を収集します。 第 3 世代のナノポア技術を利用して、プローブ ハイブリダイゼーション キャプチャの原理に基づいて HPV DNA の組み込み部位を検出します。 サンプル内の HPV 組み込みおよびホット スポット遺伝子に関する情報を取得します。 原発組織および再発/転移組織における HPV の組み込みを分析することにより、再発/転移に関連する挿入および遺伝子変化を特定し、予測式を開発します。

この研究は何を測定していますか?

主要な結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
無病生存期間
時間枠:5年
無病生存期間は、子宮頸がんの診断から、局所、地域、遠隔地での死亡や疾患の進行を含む事象、または最後の追跡調査日までの期間として定義されました。
5年

二次結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
全生存期間
時間枠:5年
全生存期間は、子宮頸がんの診断から死亡日または最後の追跡調査日までの期間として定義されました。
5年

協力者と研究者

ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。

研究記録日

これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。

主要日程の研究

研究開始 (実際)

2019年9月19日

一次修了 (実際)

2024年8月31日

研究の完了 (実際)

2024年8月31日

試験登録日

最初に提出

2024年10月15日

QC基準を満たした最初の提出物

2024年10月15日

最初の投稿 (実際)

2024年10月16日

学習記録の更新

投稿された最後の更新 (実際)

2024年10月16日

QC基準を満たした最後の更新が送信されました

2024年10月15日

最終確認日

2019年9月1日

詳しくは

本研究に関する用語

個々の参加者データ (IPD) の計画

個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?

いいえ

IPD プランの説明

患者様のプライバシーを守るため

医薬品およびデバイス情報、研究文書

米国FDA規制医薬品の研究

いいえ

米国FDA規制機器製品の研究

いいえ

米国で製造され、米国から輸出された製品。

いいえ

この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。

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