解読ゲノム資源情報データベース (GRID®)
2026年8月14日 更新者:GenomeDx Biosciences Corp
Decipher Genomics Resource Information Database (GRID)® とデータ共有プログラムを使用した予測発現解析
個々の患者の腫瘍をよりよく特徴付けるツールとしてのゲノム発現データの有用性を前向きに評価し、定期的な臨床検査を受けている個々の患者からのゲノム情報を集団レベルの分析で使用して治療と結果を改善する方法を理解すること。
調査の概要
詳細な説明
参加機関がこれらのデータを臨床治療およびDecipherテストが実施された患者の結果データと組み合わせることができるようにする、ゲノム全体の発現データのリリースを含む観察研究。
これらのコラボレーションを通じて、GRID データベース集団は、がんのゲノミクスを特徴付け、疾患の生物学の現在の理解を広げるのに役立つ可能性のある新しい遺伝子発現シグネチャを発見するために使用されます。
研究の種類
観察的
入学 (推定)
1000000
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究場所
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California
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Indian Wells、California、アメリカ、92210
- Desert Medical Imaging LLC
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Los Angeles、California、アメリカ、90048
- Cedars-Sinai Medical Center
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San Francisco、California、アメリカ、94158
- University of California San Francisco
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Florida
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Miami、Florida、アメリカ、33136
- University of Miami Miller School of Medicine
-
Tampa、Florida、アメリカ、33612
- Moffitt Cancer Center
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Illinois
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Evanston、Illinois、アメリカ、60208
- Northwestern University Feinberg School of Medicine
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Maryland
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Baltimore、Maryland、アメリカ、21287
- Johns Hopkins School of Medicine
-
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Massachusetts
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Boston、Massachusetts、アメリカ、02115
- Dana Farber/Brigham and Women's Cancer Center
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Michigan
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Royal Oak、Michigan、アメリカ、48067
- Comprehensive Urology
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Pennsylvania
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Philadelphia、Pennsylvania、アメリカ、19107
- Sidney Kimmel Medical College at Thomas Jefferson University
-
-
参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
いいえ
サンプリング方法
非確率サンプル
調査対象母集団
臨床現場でデシファー検査を受けている患者。
Decipher テストの結果は、通常の臨床ケアの一部として使用できることが理解されています。
Decipher でテストされた次の基準を満たす患者は、この研究に参加できます。
説明
包含基準:
術後の臨床適応症の解読
患者は、最初の PSA ナディアを達成している必要があります (検出不能な PSA として定義されます。
≤0.1 ng/mL) 4 ~ 6 週間以内、および
- 切除断端陽性の病理学的病期 T2 疾患、または
- 病理学的病期 T3 疾患 (例えば、前立腺外への進展、精嚢浸潤、膀胱頸部浸潤)、または
- 術前PSAが高い(例:PSA≧20ng/mL)、または
- 高グリーソングレードの疾患(例:グリーソン7~10または三次グリーソンパターン5)、または
- 神経周囲、リンパ管浸潤、または
- リンパ節の関与、または
- PSAの上昇または生化学的再発
生検の臨床適応症の解読
• 限局性前立腺がんと診断され、NCCN ガイドラインによりリスクが非常に低い、低い、中程度、または高いと評価された患者:
非常に低いリスク: T1c、グリーソン スコア ≤ 6、PSA < 10ng/mL、前立腺生検コアが 3 つ未満、陽性、
- 50% のがんがどのコアにもあり、PSA 濃度 <0.15 ng/mL/g
- 低リスク: T1-T2a、グリーソン スコア ≤ 6、PSA < 10ng/mL
- 中間リスク: T2b-T2c、グリソンスコア 7、または PSA 10-20 ng/mL
- 高リスク: T3a、またはグリソンスコア 8-10、または PSA > 20 ng/mL
除外基準:
- 転移性疾患(M1)と診断されている
- 手術前の転移性疾患 (M+)
- サルベージ設定患者の場合: PSA 上昇時の転移性疾患 (M+)
- -根治的前立腺切除術の前にネオアジュバント前立腺癌治療を受けた
- 適格基準の評価に必要な患者の臨床データが利用できない
- -治療する医師、治験責任医師、または被指名人が決定するその他の病状 研究から被験者を除外する必要があります
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:ケースのみ
- 時間の展望:見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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GRID 患者の解読
-Decipher臨床試験のいずれかでテストされた患者
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The Decipher tests use gene expression-based molecular diagnostic assays that are used to better risk stratify or characterize tumor biology that are commercially available through Veracyte, Inc CLIA & CAP certified laboratory in San Diego, CA
他の名前:
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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Decipher テストから生成された完全なゲノム RNA 発現アレイ データを、参加に同意した患者の臨床データとリンクします。
時間枠:研究完了まで、平均1年
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特定のがんの生物学におけるゲノム発現データの役割
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研究完了まで、平均1年
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協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
出版物と役立つリンク
研究に関する情報を入力する責任者は、自発的にこれらの出版物を提供します。これらは、研究に関連するあらゆるものに関するものである可能性があります。
一般刊行物
- Karnes RJ, Bergstralh EJ, Davicioni E, Ghadessi M, Buerki C, Mitra AP, Crisan A, Erho N, Vergara IA, Lam LL, Carlson R, Thompson DJ, Haddad Z, Zimmermann B, Sierocinski T, Triche TJ, Kollmeyer T, Ballman KV, Black PC, Klee GG, Jenkins RB. Validation of a genomic classifier that predicts metastasis following radical prostatectomy in an at risk patient population. J Urol. 2013 Dec;190(6):2047-53. doi: 10.1016/j.juro.2013.06.017. Epub 2013 Jun 11.
- Ross AE, Johnson MH, Yousefi K, Davicioni E, Netto GJ, Marchionni L, Fedor HL, Glavaris S, Choeurng V, Buerki C, Erho N, Lam LL, Humphreys EB, Faraj S, Bezerra SM, Han M, Partin AW, Trock BJ, Schaeffer EM. Tissue-based Genomics Augments Post-prostatectomy Risk Stratification in a Natural History Cohort of Intermediate- and High-Risk Men. Eur Urol. 2016 Jan;69(1):157-65. doi: 10.1016/j.eururo.2015.05.042. Epub 2015 Jun 6.
- Cooperberg MR, Davicioni E, Crisan A, Jenkins RB, Ghadessi M, Karnes RJ. Combined value of validated clinical and genomic risk stratification tools for predicting prostate cancer mortality in a high-risk prostatectomy cohort. Eur Urol. 2015 Feb;67(2):326-33. doi: 10.1016/j.eururo.2014.05.039. Epub 2014 Jul 2.
- Den RB, Feng FY, Showalter TN, Mishra MV, Trabulsi EJ, Lallas CD, Gomella LG, Kelly WK, Birbe RC, McCue PA, Ghadessi M, Yousefi K, Davicioni E, Knudsen KE, Dicker AP. Genomic prostate cancer classifier predicts biochemical failure and metastases in patients after postoperative radiation therapy. Int J Radiat Oncol Biol Phys. 2014 Aug 1;89(5):1038-1046. doi: 10.1016/j.ijrobp.2014.04.052. Epub 2014 Jul 8.
- Erho N, Crisan A, Vergara IA, Mitra AP, Ghadessi M, Buerki C, Bergstralh EJ, Kollmeyer T, Fink S, Haddad Z, Zimmermann B, Sierocinski T, Ballman KV, Triche TJ, Black PC, Karnes RJ, Klee G, Davicioni E, Jenkins RB. Discovery and validation of a prostate cancer genomic classifier that predicts early metastasis following radical prostatectomy. PLoS One. 2013 Jun 24;8(6):e66855. doi: 10.1371/journal.pone.0066855. Print 2013.
- Hall WA, Fishbane N, Liu Y, Xu MJ, Davicioni E, Mahal BA, Den RB, Dess RT, Jackson WC, Wong AC, Schaeffer EM, Karnes RJ, Carroll PR, Cooperberg MR, Bismar TA, Kim HL, Klein EA, Davis JW, Ross AE, Tosoian JJ, Morgan TM, Mehra R, Salami SS, Nguyen PL, Lawton CAF, Spratt DE, Feng F. Development and Validation of a Genomic Tool to Predict Seminal Vesicle Invasion in Adenocarcinoma of the Prostate. JCO Precis Oncol. 2020 Nov;4:1228-1238. doi: 10.1200/PO.20.00013.
- Berglund AE, Rounbehler RJ, Gerke T, Awasthi S, Cheng CH, Takhar M, Davicioni E, Alshalalfa M, Erho N, Klein EA, Freedland SJ, Ross AE, Schaeffer EM, Trock BJ, Den RB, Cleveland JL, Park JY, Dhillon J, Yamoah K. Distinct transcriptional repertoire of the androgen receptor in ETS fusion-negative prostate cancer. Prostate Cancer Prostatic Dis. 2019 May;22(2):292-302. doi: 10.1038/s41391-018-0103-4. Epub 2018 Oct 26.
- Jairath NK, Dal Pra A, Vince R Jr, Dess RT, Jackson WC, Tosoian JJ, McBride SM, Zhao SG, Berlin A, Mahal BA, Kishan AU, Den RB, Freedland SJ, Salami SS, Kaffenberger SD, Pollack A, Tran P, Mehra R, Morgan TM, Weiner AB, Mohamad O, Carroll PR, Cooperberg MR, Karnes RJ, Nguyen PL, Michalski JM, Tward JD, Feng FY, Schaeffer EM, Spratt DE. A Systematic Review of the Evidence for the Decipher Genomic Classifier in Prostate Cancer. Eur Urol. 2021 Mar;79(3):374-383. doi: 10.1016/j.eururo.2020.11.021. Epub 2020 Dec 5.
- Qiu X, Boufaied N, Hallal T, Feit A, de Polo A, Luoma AM, Alahmadi W, Larocque J, Zadra G, Xie Y, Gu S, Tang Q, Zhang Y, Syamala S, Seo JH, Bell C, O'Connor E, Liu Y, Schaeffer EM, Jeffrey Karnes R, Weinmann S, Davicioni E, Morrissey C, Cejas P, Ellis L, Loda M, Wucherpfennig KW, Pomerantz MM, Spratt DE, Corey E, Freedman ML, Shirley Liu X, Brown M, Long HW, Labbe DP. MYC drives aggressive prostate cancer by disrupting transcriptional pause release at androgen receptor targets. Nat Commun. 2022 May 13;13(1):2559. doi: 10.1038/s41467-022-30257-z.
- Zhao SG, Chang SL, Erho N, Yu M, Lehrer J, Alshalalfa M, Speers C, Cooperberg MR, Kim W, Ryan CJ, Den RB, Freedland SJ, Posadas E, Sandler H, Klein EA, Black P, Seiler R, Tomlins SA, Chinnaiyan AM, Jenkins RB, Davicioni E, Ross AE, Schaeffer EM, Nguyen PL, Carroll PR, Karnes RJ, Spratt DE, Feng FY. Associations of Luminal and Basal Subtyping of Prostate Cancer With Prognosis and Response to Androgen Deprivation Therapy. JAMA Oncol. 2017 Dec 1;3(12):1663-1672. doi: 10.1001/jamaoncol.2017.0751.
- Mahal BA, Yang DD, Wang NQ, Alshalalfa M, Davicioni E, Choeurng V, Schaeffer EM, Ross AE, Spratt DE, Den RB, Martin NE, Mouw KW, Orio PF 3rd, Choueiri TK, Taplin ME, Trinh QD, Feng FY, Nguyen PL. Clinical and Genomic Characterization of Low-Prostate-specific Antigen, High-grade Prostate Cancer. Eur Urol. 2018 Aug;74(2):146-154. doi: 10.1016/j.eururo.2018.01.043. Epub 2018 Feb 22.
- Chu CE, Alshalalfa M, Sjostrom M, Zhao SG, Liu Y, Chou J, Herlemann A, Mahal B, Kishan AU, Spratt DE, Cooperberg M, Small E, Wong A, Porten S, Hope TA, Ross AE, Davicioni E, Nguyen P, Karnes RJ, Carroll PR, Schaeffer E, Feng FY. Prostate-specific Membrane Antigen and Fluciclovine Transporter Genes are Associated with Variable Clinical Features and Molecular Subtypes of Primary Prostate Cancer. Eur Urol. 2021 Jun;79(6):717-721. doi: 10.1016/j.eururo.2021.03.017. Epub 2021 Apr 8.
- Kensler KH, Awasthi S, Alshalalfa M, Trock BJ, Freedland SJ, Freeman MR, You S, Mahal BA, Den RB, Dicker AP, Karnes RJ, Klein EA, Lal P, Liu Y, Davicioni E, Rayford W, Yamoah K, Rebbeck TR. Variation in Molecularly Defined Prostate Tumor Subtypes by Self-identified Race. Eur Urol Open Sci. 2022 Apr 26;40:19-26. doi: 10.1016/j.euros.2022.03.014. eCollection 2022 Jun.
- Zhao SG, Lehrer J, Chang SL, Das R, Erho N, Liu Y, Sjostrom M, Den RB, Freedland SJ, Klein EA, Karnes RJ, Schaeffer EM, Xu M, Speers C, Nguyen PL, Ross AE, Chan JM, Cooperberg MR, Carroll PR, Davicioni E, Fong L, Spratt DE, Feng FY. The Immune Landscape of Prostate Cancer and Nomination of PD-L2 as a Potential Therapeutic Target. J Natl Cancer Inst. 2019 Mar 1;111(3):301-310. doi: 10.1093/jnci/djy141.
- Cooperberg MR, Erho N, Chan JM, Feng FY, Fishbane N, Zhao SG, Simko JP, Cowan JE, Lehrer J, Alshalalfa M, Kolisnik T, Chelliserry J, Margrave J, Aranes M, Plessis MD, Buerki C, Tenggara I, Davicioni E, Carroll PR. The Diverse Genomic Landscape of Clinically Low-risk Prostate Cancer. Eur Urol. 2018 Oct;74(4):444-452. doi: 10.1016/j.eururo.2018.05.014. Epub 2018 May 28.
- Rayford W, Beksac AT, Alger J, Alshalalfa M, Ahmed M, Khan I, Falagario UG, Liu Y, Davicioni E, Spratt DE, Schaeffer EM, Feng FY, Mahal B, Nguyen PL, Den RB, Greenberger MD, Bradley R, Watson JM, Beamer M, Stamatakis L, Carmen DJ, Awasthi S, Hwang J, Weil R, Merisaari H, Mohamed N, Deane LA, Chakravarty D, Yadav KK, Yamoah K, Nair SS, Tewari AK. Comparative analysis of 1152 African-American and European-American men with prostate cancer identifies distinct genomic and immunological differences. Commun Biol. 2021 Jun 3;4(1):670. doi: 10.1038/s42003-021-02140-y.
- Spratt DE, Zhang J, Santiago-Jimenez M, Dess RT, Davis JW, Den RB, Dicker AP, Kane CJ, Pollack A, Stoyanova R, Abdollah F, Ross AE, Cole A, Uchio E, Randall JM, Nguyen H, Zhao SG, Mehra R, Glass AG, Lam LLC, Chelliserry J, du Plessis M, Choeurng V, Aranes M, Kolisnik T, Margrave J, Alter J, Jordan J, Buerki C, Yousefi K, Haddad Z, Davicioni E, Trabulsi EJ, Loeb S, Tewari A, Carroll PR, Weinmann S, Schaeffer EM, Klein EA, Karnes RJ, Feng FY, Nguyen PL. Development and Validation of a Novel Integrated Clinical-Genomic Risk Group Classification for Localized Prostate Cancer. J Clin Oncol. 2018 Feb 20;36(6):581-590. doi: 10.1200/JCO.2017.74.2940. Epub 2017 Nov 29.
- Muralidhar V, Zhang J, Wang Q, Mahal BA, Butler SS, Spratt DE, Davicioni E, Sartor O, Feng FY, Mouw KW, Nguyen PL. Genomic Validation of 3-Tiered Clinical Subclassification of High-Risk Prostate Cancer. Int J Radiat Oncol Biol Phys. 2019 Nov 1;105(3):621-627. doi: 10.1016/j.ijrobp.2019.06.2510. Epub 2019 Jul 2.
- Zhao SG, Evans JR, Kothari V, Sun G, Larm A, Mondine V, Schaeffer EM, Ross AE, Klein EA, Den RB, Dicker AP, Karnes RJ, Erho N, Nguyen PL, Davicioni E, Feng FY. The Landscape of Prognostic Outlier Genes in High-Risk Prostate Cancer. Clin Cancer Res. 2016 Apr 1;22(7):1777-86. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-15-1250. Epub 2015 Dec 2.
- Chipidza FE, Alshalalfa M, Mahal BA, Karnes RJ, Liu Y, Davicioni E, Martin NE, Mouw KW, Feng FY, Nguyen PL, Muralidhar V. Development and Validation of a Novel TP53 Mutation Signature That Predicts Risk of Metastasis in Primary Prostate Cancer. Clin Genitourin Cancer. 2021 Jun;19(3):246-254.e5. doi: 10.1016/j.clgc.2020.08.004. Epub 2020 Aug 13.
- Goldberg H, Spratt D, Chandrasekar T, Klaassen Z, Wallis CJD, Santiago-Jimenez M, Fishbane N, Davicioni E, Noorani R, Ahmad AE, Herrera Caceres JO, Alibhai S, Berlin A, Fleshner NE. Clinical-genomic Characterization Unveils More Aggressive Disease Features in Elderly Prostate Cancer Patients with Low-grade Disease. Eur Urol Focus. 2021 Jul;7(4):797-806. doi: 10.1016/j.euf.2020.02.008. Epub 2020 Mar 7.
- Kishan AU, Romero T, Alshalalfa M, Liu Y, Tran PT, Nickols NG, Ye H, Sajed D, Rettig MB, Reiter RE, Garraway IP, Spratt DE, Freedland SJ, Zhao X, Li Z, Deek M, Livingstone J, Mahal BA, Nguyen PL, Feng FY, Den RB, Schaeffer EM, Lotan TL, Karnes RJ, Klein EA, Ross AE, Grogan T, Davicioni E, Elashoff D, Boutros PC, Weidhaas JB. Transcriptomic Heterogeneity of Gleason Grade Group 5 Prostate Cancer. Eur Urol. 2020 Sep;78(3):327-332. doi: 10.1016/j.eururo.2020.05.009. Epub 2020 May 24.
- Den RB, Yousefi K, Trabulsi EJ, Abdollah F, Choeurng V, Feng FY, Dicker AP, Lallas CD, Gomella LG, Davicioni E, Karnes RJ. Genomic classifier identifies men with adverse pathology after radical prostatectomy who benefit from adjuvant radiation therapy. J Clin Oncol. 2015 Mar 10;33(8):944-51. doi: 10.1200/JCO.2014.59.0026. Epub 2015 Feb 9.
- Feng FY, Huang HC, Spratt DE, Zhao SG, Sandler HM, Simko JP, Davicioni E, Nguyen PL, Pollack A, Efstathiou JA, Dicker AP, Todorovic T, Margrave J, Liu YS, Dabbas B, Thompson DJS, Das R, Dignam JJ, Sweeney C, Attard G, Bahary JP, Lukka HR, Hall WA, Pisansky TM, Shah AB, Pugh SL, Shipley WU, Tran PT. Validation of a 22-Gene Genomic Classifier in Patients With Recurrent Prostate Cancer: An Ancillary Study of the NRG/RTOG 9601 Randomized Clinical Trial. JAMA Oncol. 2021 Apr 1;7(4):544-552. doi: 10.1001/jamaoncol.2020.7671.
- Adams EJ, Karthaus WR, Hoover E, Liu D, Gruet A, Zhang Z, Cho H, DiLoreto R, Chhangawala S, Liu Y, Watson PA, Davicioni E, Sboner A, Barbieri CE, Bose R, Leslie CS, Sawyers CL. FOXA1 mutations alter pioneering activity, differentiation and prostate cancer phenotypes. Nature. 2019 Jul;571(7765):408-412. doi: 10.1038/s41586-019-1318-9. Epub 2019 Jun 26.
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2015年10月1日
一次修了 (推定)
2030年12月1日
研究の完了 (推定)
2040年12月1日
試験登録日
最初に提出
2015年11月16日
QC基準を満たした最初の提出物
2015年11月18日
最初の投稿 (推定)
2015年11月20日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2026年8月18日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2026年8月14日
最終確認日
2026年8月1日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- GRD001
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
未定
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
いいえ
米国FDA規制機器製品の研究
いいえ
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。