База данных информации о ресурсах расшифровки геномики (GRID®)
14 августа 2026 г. обновлено: GenomeDx Biosciences Corp
Проспективный анализ экспрессии с использованием базы данных Decipher Genomics Resource Information Database (GRID)® и программы обмена данными
Проспективно оценить полезность данных геномной экспрессии в качестве инструмента для лучшей характеристики опухолей у отдельных пациентов и понять, как геномная информация от отдельных пациентов, проходящих рутинное клиническое тестирование, может быть использована в анализе на уровне популяции для улучшения лечения и результатов.
Обзор исследования
Статус
Запись по приглашению
Условия
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Обсервационное исследование, включающее выпуск данных об экспрессии всего генома, позволяющее участвующим учреждениям сопоставить эти данные с данными о клиническом лечении и исходах для пациентов, у которых было проведено тестирование Decipher.
Благодаря этому сотрудничеству база данных GRID будет использоваться для характеристики геномики рака и обнаружения новых сигнатур экспрессии генов, которые могут быть полезны для расширения текущего понимания биологии заболевания.
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Оцененный)
1000000
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
California
-
Indian Wells, California, Соединенные Штаты, 92210
- Desert Medical Imaging LLC
-
Los Angeles, California, Соединенные Штаты, 90048
- Cedars-Sinai Medical Center
-
San Francisco, California, Соединенные Штаты, 94158
- University of California San Francisco
-
-
Florida
-
Miami, Florida, Соединенные Штаты, 33136
- University of Miami Miller School of Medicine
-
Tampa, Florida, Соединенные Штаты, 33612
- Moffitt Cancer Center
-
-
Illinois
-
Evanston, Illinois, Соединенные Штаты, 60208
- Northwestern University Feinberg School of Medicine
-
-
Maryland
-
Baltimore, Maryland, Соединенные Штаты, 21287
- Johns Hopkins School of Medicine
-
-
Massachusetts
-
Boston, Massachusetts, Соединенные Штаты, 02115
- Dana Farber/Brigham and Women's Cancer Center
-
-
Michigan
-
Royal Oak, Michigan, Соединенные Штаты, 48067
- Comprehensive Urology
-
-
Pennsylvania
-
Philadelphia, Pennsylvania, Соединенные Штаты, 19107
- Sidney Kimmel Medical College at Thomas Jefferson University
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Метод выборки
Невероятностная выборка
Исследуемая популяция
Пациенты, проходящие тестирование Decipher в клинических условиях.
Понятно, что результаты теста Decipher могут использоваться как часть обычной клинической помощи.
Любой пациент, отвечающий следующим критериям и прошедший тестирование с помощью Decipher, может участвовать в исследовании.
Описание
Критерии включения:
Расшифровка послеоперационных клинических показаний
Пациент должен достичь начального надира ПСА (определяемого как неопределяемый уровень ПСА
≤0,1 нг/мл) в течение 4-6 недель и
- Патологическая стадия Т2 с положительным хирургическим краем или
- Патологическая стадия заболевания Т3 (например, экстрапростатическое распространение, инвазия семенных пузырьков, инвазия шейки мочевого пузыря) или
- Высокий предоперационный уровень ПСА (например, ПСА ≥20 нг/мл) или
- Болезнь с высокой степенью Глисона (например, от 7 до 10 баллов по шкале Глисона или третичная оценка по шкале Глисона 5), или
- Периневральная, лимфоваскулярная инвазия или
- Вовлечение лимфатических узлов или
- Повышение уровня ПСА или биохимический рецидив
Расшифровка клинических показаний биопсии
• Любой пациент с диагностированным локализованным раком предстательной железы, которому в соответствии с рекомендациями NCCN присвоен очень низкий, низкий, средний или высокий риск:
Очень низкий риск: T1c, оценка по шкале Глисона ≤ 6, ПСА < 10 нг/мл, менее 3 положительных результатов биопсии предстательной железы,
- 50 % рака в любом ядре, плотность ПСА <0,15 нг/мл/г
- Низкий риск: T1-T2a, сумма баллов по шкале Глисона ≤ 6, ПСА < 10 нг/мл.
- Промежуточный риск: T2b-T2c, 7 баллов по шкале Глисона или ПСА 10–20 нг/мл.
- Высокий риск: T3a или сумма баллов по шкале Глисона 8–10, или уровень ПСА > 20 нг/мл.
Критерий исключения:
- Диагностировано метастатическое заболевание (M1)
- Метастатическое заболевание (М+) до операции
- Для пациентов в условиях спасения: метастатическое заболевание (M+) при повышении уровня ПСА
- Получал любое неоадъювантное лечение рака предстательной железы до радикальной простатэктомии
- Требуемые клинические данные пациента недоступны для оценки критериев приемлемости
- Любое другое медицинское состояние, которое определяет лечащий врач, исследователи или уполномоченный представитель, должно исключить субъекта из исследования.
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Наблюдательные модели: Только для случая
- Временные перспективы: Перспективный
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Расшифровать пациентов GRID
Пациенты, которые были протестированы с помощью любого из клинических тестов Decipher
|
The Decipher tests use gene expression-based molecular diagnostic assays that are used to better risk stratify or characterize tumor biology that are commercially available through Veracyte, Inc CLIA & CAP certified laboratory in San Diego, CA
Другие имена:
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Свяжите полные данные массива экспрессии геномной РНК, полученные в результате тестирования Decipher, с клиническими данными для пациентов, которые согласились участвовать.
Временное ограничение: По завершении обучения, в среднем 1 год
|
Роль данных геномной экспрессии в биологии некоторых видов рака
|
По завершении обучения, в среднем 1 год
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Соавторы
Следователи
- Главный следователь: Elai Davicioni, PhD, Veracyte, Inc.
Публикации и полезные ссылки
Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.
Общие публикации
- Karnes RJ, Bergstralh EJ, Davicioni E, Ghadessi M, Buerki C, Mitra AP, Crisan A, Erho N, Vergara IA, Lam LL, Carlson R, Thompson DJ, Haddad Z, Zimmermann B, Sierocinski T, Triche TJ, Kollmeyer T, Ballman KV, Black PC, Klee GG, Jenkins RB. Validation of a genomic classifier that predicts metastasis following radical prostatectomy in an at risk patient population. J Urol. 2013 Dec;190(6):2047-53. doi: 10.1016/j.juro.2013.06.017. Epub 2013 Jun 11.
- Ross AE, Johnson MH, Yousefi K, Davicioni E, Netto GJ, Marchionni L, Fedor HL, Glavaris S, Choeurng V, Buerki C, Erho N, Lam LL, Humphreys EB, Faraj S, Bezerra SM, Han M, Partin AW, Trock BJ, Schaeffer EM. Tissue-based Genomics Augments Post-prostatectomy Risk Stratification in a Natural History Cohort of Intermediate- and High-Risk Men. Eur Urol. 2016 Jan;69(1):157-65. doi: 10.1016/j.eururo.2015.05.042. Epub 2015 Jun 6.
- Cooperberg MR, Davicioni E, Crisan A, Jenkins RB, Ghadessi M, Karnes RJ. Combined value of validated clinical and genomic risk stratification tools for predicting prostate cancer mortality in a high-risk prostatectomy cohort. Eur Urol. 2015 Feb;67(2):326-33. doi: 10.1016/j.eururo.2014.05.039. Epub 2014 Jul 2.
- Den RB, Feng FY, Showalter TN, Mishra MV, Trabulsi EJ, Lallas CD, Gomella LG, Kelly WK, Birbe RC, McCue PA, Ghadessi M, Yousefi K, Davicioni E, Knudsen KE, Dicker AP. Genomic prostate cancer classifier predicts biochemical failure and metastases in patients after postoperative radiation therapy. Int J Radiat Oncol Biol Phys. 2014 Aug 1;89(5):1038-1046. doi: 10.1016/j.ijrobp.2014.04.052. Epub 2014 Jul 8.
- Erho N, Crisan A, Vergara IA, Mitra AP, Ghadessi M, Buerki C, Bergstralh EJ, Kollmeyer T, Fink S, Haddad Z, Zimmermann B, Sierocinski T, Ballman KV, Triche TJ, Black PC, Karnes RJ, Klee G, Davicioni E, Jenkins RB. Discovery and validation of a prostate cancer genomic classifier that predicts early metastasis following radical prostatectomy. PLoS One. 2013 Jun 24;8(6):e66855. doi: 10.1371/journal.pone.0066855. Print 2013.
- Hall WA, Fishbane N, Liu Y, Xu MJ, Davicioni E, Mahal BA, Den RB, Dess RT, Jackson WC, Wong AC, Schaeffer EM, Karnes RJ, Carroll PR, Cooperberg MR, Bismar TA, Kim HL, Klein EA, Davis JW, Ross AE, Tosoian JJ, Morgan TM, Mehra R, Salami SS, Nguyen PL, Lawton CAF, Spratt DE, Feng F. Development and Validation of a Genomic Tool to Predict Seminal Vesicle Invasion in Adenocarcinoma of the Prostate. JCO Precis Oncol. 2020 Nov;4:1228-1238. doi: 10.1200/PO.20.00013.
- Berglund AE, Rounbehler RJ, Gerke T, Awasthi S, Cheng CH, Takhar M, Davicioni E, Alshalalfa M, Erho N, Klein EA, Freedland SJ, Ross AE, Schaeffer EM, Trock BJ, Den RB, Cleveland JL, Park JY, Dhillon J, Yamoah K. Distinct transcriptional repertoire of the androgen receptor in ETS fusion-negative prostate cancer. Prostate Cancer Prostatic Dis. 2019 May;22(2):292-302. doi: 10.1038/s41391-018-0103-4. Epub 2018 Oct 26.
- Jairath NK, Dal Pra A, Vince R Jr, Dess RT, Jackson WC, Tosoian JJ, McBride SM, Zhao SG, Berlin A, Mahal BA, Kishan AU, Den RB, Freedland SJ, Salami SS, Kaffenberger SD, Pollack A, Tran P, Mehra R, Morgan TM, Weiner AB, Mohamad O, Carroll PR, Cooperberg MR, Karnes RJ, Nguyen PL, Michalski JM, Tward JD, Feng FY, Schaeffer EM, Spratt DE. A Systematic Review of the Evidence for the Decipher Genomic Classifier in Prostate Cancer. Eur Urol. 2021 Mar;79(3):374-383. doi: 10.1016/j.eururo.2020.11.021. Epub 2020 Dec 5.
- Qiu X, Boufaied N, Hallal T, Feit A, de Polo A, Luoma AM, Alahmadi W, Larocque J, Zadra G, Xie Y, Gu S, Tang Q, Zhang Y, Syamala S, Seo JH, Bell C, O'Connor E, Liu Y, Schaeffer EM, Jeffrey Karnes R, Weinmann S, Davicioni E, Morrissey C, Cejas P, Ellis L, Loda M, Wucherpfennig KW, Pomerantz MM, Spratt DE, Corey E, Freedman ML, Shirley Liu X, Brown M, Long HW, Labbe DP. MYC drives aggressive prostate cancer by disrupting transcriptional pause release at androgen receptor targets. Nat Commun. 2022 May 13;13(1):2559. doi: 10.1038/s41467-022-30257-z.
- Zhao SG, Chang SL, Erho N, Yu M, Lehrer J, Alshalalfa M, Speers C, Cooperberg MR, Kim W, Ryan CJ, Den RB, Freedland SJ, Posadas E, Sandler H, Klein EA, Black P, Seiler R, Tomlins SA, Chinnaiyan AM, Jenkins RB, Davicioni E, Ross AE, Schaeffer EM, Nguyen PL, Carroll PR, Karnes RJ, Spratt DE, Feng FY. Associations of Luminal and Basal Subtyping of Prostate Cancer With Prognosis and Response to Androgen Deprivation Therapy. JAMA Oncol. 2017 Dec 1;3(12):1663-1672. doi: 10.1001/jamaoncol.2017.0751.
- Mahal BA, Yang DD, Wang NQ, Alshalalfa M, Davicioni E, Choeurng V, Schaeffer EM, Ross AE, Spratt DE, Den RB, Martin NE, Mouw KW, Orio PF 3rd, Choueiri TK, Taplin ME, Trinh QD, Feng FY, Nguyen PL. Clinical and Genomic Characterization of Low-Prostate-specific Antigen, High-grade Prostate Cancer. Eur Urol. 2018 Aug;74(2):146-154. doi: 10.1016/j.eururo.2018.01.043. Epub 2018 Feb 22.
- Chu CE, Alshalalfa M, Sjostrom M, Zhao SG, Liu Y, Chou J, Herlemann A, Mahal B, Kishan AU, Spratt DE, Cooperberg M, Small E, Wong A, Porten S, Hope TA, Ross AE, Davicioni E, Nguyen P, Karnes RJ, Carroll PR, Schaeffer E, Feng FY. Prostate-specific Membrane Antigen and Fluciclovine Transporter Genes are Associated with Variable Clinical Features and Molecular Subtypes of Primary Prostate Cancer. Eur Urol. 2021 Jun;79(6):717-721. doi: 10.1016/j.eururo.2021.03.017. Epub 2021 Apr 8.
- Kensler KH, Awasthi S, Alshalalfa M, Trock BJ, Freedland SJ, Freeman MR, You S, Mahal BA, Den RB, Dicker AP, Karnes RJ, Klein EA, Lal P, Liu Y, Davicioni E, Rayford W, Yamoah K, Rebbeck TR. Variation in Molecularly Defined Prostate Tumor Subtypes by Self-identified Race. Eur Urol Open Sci. 2022 Apr 26;40:19-26. doi: 10.1016/j.euros.2022.03.014. eCollection 2022 Jun.
- Zhao SG, Lehrer J, Chang SL, Das R, Erho N, Liu Y, Sjostrom M, Den RB, Freedland SJ, Klein EA, Karnes RJ, Schaeffer EM, Xu M, Speers C, Nguyen PL, Ross AE, Chan JM, Cooperberg MR, Carroll PR, Davicioni E, Fong L, Spratt DE, Feng FY. The Immune Landscape of Prostate Cancer and Nomination of PD-L2 as a Potential Therapeutic Target. J Natl Cancer Inst. 2019 Mar 1;111(3):301-310. doi: 10.1093/jnci/djy141.
- Cooperberg MR, Erho N, Chan JM, Feng FY, Fishbane N, Zhao SG, Simko JP, Cowan JE, Lehrer J, Alshalalfa M, Kolisnik T, Chelliserry J, Margrave J, Aranes M, Plessis MD, Buerki C, Tenggara I, Davicioni E, Carroll PR. The Diverse Genomic Landscape of Clinically Low-risk Prostate Cancer. Eur Urol. 2018 Oct;74(4):444-452. doi: 10.1016/j.eururo.2018.05.014. Epub 2018 May 28.
- Rayford W, Beksac AT, Alger J, Alshalalfa M, Ahmed M, Khan I, Falagario UG, Liu Y, Davicioni E, Spratt DE, Schaeffer EM, Feng FY, Mahal B, Nguyen PL, Den RB, Greenberger MD, Bradley R, Watson JM, Beamer M, Stamatakis L, Carmen DJ, Awasthi S, Hwang J, Weil R, Merisaari H, Mohamed N, Deane LA, Chakravarty D, Yadav KK, Yamoah K, Nair SS, Tewari AK. Comparative analysis of 1152 African-American and European-American men with prostate cancer identifies distinct genomic and immunological differences. Commun Biol. 2021 Jun 3;4(1):670. doi: 10.1038/s42003-021-02140-y.
- Spratt DE, Zhang J, Santiago-Jimenez M, Dess RT, Davis JW, Den RB, Dicker AP, Kane CJ, Pollack A, Stoyanova R, Abdollah F, Ross AE, Cole A, Uchio E, Randall JM, Nguyen H, Zhao SG, Mehra R, Glass AG, Lam LLC, Chelliserry J, du Plessis M, Choeurng V, Aranes M, Kolisnik T, Margrave J, Alter J, Jordan J, Buerki C, Yousefi K, Haddad Z, Davicioni E, Trabulsi EJ, Loeb S, Tewari A, Carroll PR, Weinmann S, Schaeffer EM, Klein EA, Karnes RJ, Feng FY, Nguyen PL. Development and Validation of a Novel Integrated Clinical-Genomic Risk Group Classification for Localized Prostate Cancer. J Clin Oncol. 2018 Feb 20;36(6):581-590. doi: 10.1200/JCO.2017.74.2940. Epub 2017 Nov 29.
- Muralidhar V, Zhang J, Wang Q, Mahal BA, Butler SS, Spratt DE, Davicioni E, Sartor O, Feng FY, Mouw KW, Nguyen PL. Genomic Validation of 3-Tiered Clinical Subclassification of High-Risk Prostate Cancer. Int J Radiat Oncol Biol Phys. 2019 Nov 1;105(3):621-627. doi: 10.1016/j.ijrobp.2019.06.2510. Epub 2019 Jul 2.
- Zhao SG, Evans JR, Kothari V, Sun G, Larm A, Mondine V, Schaeffer EM, Ross AE, Klein EA, Den RB, Dicker AP, Karnes RJ, Erho N, Nguyen PL, Davicioni E, Feng FY. The Landscape of Prognostic Outlier Genes in High-Risk Prostate Cancer. Clin Cancer Res. 2016 Apr 1;22(7):1777-86. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-15-1250. Epub 2015 Dec 2.
- Chipidza FE, Alshalalfa M, Mahal BA, Karnes RJ, Liu Y, Davicioni E, Martin NE, Mouw KW, Feng FY, Nguyen PL, Muralidhar V. Development and Validation of a Novel TP53 Mutation Signature That Predicts Risk of Metastasis in Primary Prostate Cancer. Clin Genitourin Cancer. 2021 Jun;19(3):246-254.e5. doi: 10.1016/j.clgc.2020.08.004. Epub 2020 Aug 13.
- Goldberg H, Spratt D, Chandrasekar T, Klaassen Z, Wallis CJD, Santiago-Jimenez M, Fishbane N, Davicioni E, Noorani R, Ahmad AE, Herrera Caceres JO, Alibhai S, Berlin A, Fleshner NE. Clinical-genomic Characterization Unveils More Aggressive Disease Features in Elderly Prostate Cancer Patients with Low-grade Disease. Eur Urol Focus. 2021 Jul;7(4):797-806. doi: 10.1016/j.euf.2020.02.008. Epub 2020 Mar 7.
- Kishan AU, Romero T, Alshalalfa M, Liu Y, Tran PT, Nickols NG, Ye H, Sajed D, Rettig MB, Reiter RE, Garraway IP, Spratt DE, Freedland SJ, Zhao X, Li Z, Deek M, Livingstone J, Mahal BA, Nguyen PL, Feng FY, Den RB, Schaeffer EM, Lotan TL, Karnes RJ, Klein EA, Ross AE, Grogan T, Davicioni E, Elashoff D, Boutros PC, Weidhaas JB. Transcriptomic Heterogeneity of Gleason Grade Group 5 Prostate Cancer. Eur Urol. 2020 Sep;78(3):327-332. doi: 10.1016/j.eururo.2020.05.009. Epub 2020 May 24.
- Den RB, Yousefi K, Trabulsi EJ, Abdollah F, Choeurng V, Feng FY, Dicker AP, Lallas CD, Gomella LG, Davicioni E, Karnes RJ. Genomic classifier identifies men with adverse pathology after radical prostatectomy who benefit from adjuvant radiation therapy. J Clin Oncol. 2015 Mar 10;33(8):944-51. doi: 10.1200/JCO.2014.59.0026. Epub 2015 Feb 9.
- Feng FY, Huang HC, Spratt DE, Zhao SG, Sandler HM, Simko JP, Davicioni E, Nguyen PL, Pollack A, Efstathiou JA, Dicker AP, Todorovic T, Margrave J, Liu YS, Dabbas B, Thompson DJS, Das R, Dignam JJ, Sweeney C, Attard G, Bahary JP, Lukka HR, Hall WA, Pisansky TM, Shah AB, Pugh SL, Shipley WU, Tran PT. Validation of a 22-Gene Genomic Classifier in Patients With Recurrent Prostate Cancer: An Ancillary Study of the NRG/RTOG 9601 Randomized Clinical Trial. JAMA Oncol. 2021 Apr 1;7(4):544-552. doi: 10.1001/jamaoncol.2020.7671.
- Adams EJ, Karthaus WR, Hoover E, Liu D, Gruet A, Zhang Z, Cho H, DiLoreto R, Chhangawala S, Liu Y, Watson PA, Davicioni E, Sboner A, Barbieri CE, Bose R, Leslie CS, Sawyers CL. FOXA1 mutations alter pioneering activity, differentiation and prostate cancer phenotypes. Nature. 2019 Jul;571(7765):408-412. doi: 10.1038/s41586-019-1318-9. Epub 2019 Jun 26.
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
1 октября 2015 г.
Первичное завершение (Оцененный)
1 декабря 2030 г.
Завершение исследования (Оцененный)
1 декабря 2040 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
16 ноября 2015 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
18 ноября 2015 г.
Первый опубликованный (Оцененный)
20 ноября 2015 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
18 августа 2026 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
14 августа 2026 г.
Последняя проверка
1 августа 2026 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
- Урогенитальные заболевания
- Генитальные заболевания
- Генитальные новообразования, мужчины
- Урогенитальные новообразования
- Новообразования по локализации
- Новообразования
- Заболевания половых органов, мужчины
- Заболевания предстательной железы
- Мужские мочеполовые заболевания
- Заболевания почек
- Урологические заболевания
- Женские урогенитальные заболевания
- Женские мочеполовые заболевания и осложнения беременности
- Урологические новообразования
- Заболевания мочевого пузыря
- Новообразования предстательной железы
- Новообразования мочевого пузыря
- Новообразования почек
Другие идентификационные номера исследования
- GRD001
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
НЕ РЕШЕНО
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .