急性膵炎の重症度の人工知能予測
急性膵炎の重症度予測における人工知能の応用
急性膵炎 (AP) の発生率は、今日増加しています。 AP の診断は、次の 3 つの所見のうち 2 つが存在するアトランタの基準に従って定義されます。 a) 特徴的な腹痛 b) アミラーゼ値とリパーゼ値が 3 倍以上 c) 超音波検査 (USG)、磁気共鳴画像法 (MRI)、またはコンピュータ断層撮影法 (CT) 画像による AP 診断。 病気の 80% は軽度の経過ですが、20% は重症であり、集中治療が必要です。 死亡率は、重度 (重度) AP では 10 ~ 25% の間で変動しますが、軽度 AP では 1 ~ 3% です。
疾患の重症度を評価するために、臨床的、検査的、および放射線学的所見によるスコアリングシステムが使用されます。 高齢(70歳以上)、肥満(体格指数(BMI、kg/m2)、タバコとアルコールの使用、血中尿素窒素(BUN)≧20mg/dl、クレアチニン上昇、C反応性タンパク値(CRP)> 120mg/dl、Hctレベルの減少または増加、腹部CTのバルタザールスコアが8以上の場合、重篤なAPが示唆されます。 改訂されたアトランタの基準によると、AP には 3 種類の重大度が存在します。 軽度(臓器不全および局所合併症なし)、中等度(偽嚢胞、膿瘍、壊死、血管血栓症などの局所合併症)および/または一過性の全身合併症(48時間未満)および重度(長期にわたる全身合併症(> 48時間));肺、心臓、胃腸、腎臓などの臓器不全)。 アトランタのスコアリングは今日非常に人気があると考えられていますが、感染壊死、非膵臓感染症、非膵臓壊死、および臓器不全の動的な性質にいくつかの欠陥があるため、依然として修正が必要なようです. 30 の重症度スコアリング システム (その中で最も受け入れられているのは APACHE 2 スコアです) が存在するにもかかわらず、どの患者が非常に重度の疾患を発症し、どの患者が軽度の経過をたどるかを確実に予測できるものはまだ発見されていません。
今日、人工知能 (機械学習) アプリケーションは、医療の多くの分野 (診断、手術、医薬品開発、個別化治療、遺伝子編集技術など) で使用されています。 AP における暴力を判断する際の機械学習に関する研究が、文献に登場し始めています。 この研究の目的は、人工知能 (AI) アプリケーションが AP の疾患の重症度を決定する役割を持っているかどうかを調査することです。
調査の概要
詳細な説明
レトロスペクティブな方法で、2010 年 10 月から 2020 年 2 月までの間にベズミアレム財団大学の消化器病クリニックで追跡調査を受け、アトランタの基準に従って AP と診断された 1550 人の患者がスクリーニングされました。 データが欠落している 216 人の患者を除外した後、1334 人の患者が評価のために研究に含まれました。
- 患者の人口統計情報; [年齢 (yo)、性別 (男性/女性)、タバコ/アルコールの使用 (はいまたはいいえ)]、臨床情報; [身長 (センチメートル)、体重 (キログラム)、BMI (kg/m2 として)、真性糖尿病および高血圧の有無 (はいまたはいいえ)]、胆石、アルコールなどの AP の病因、および以下の範囲内で受けた臨床検査入場の最初の 24 時間。 【CRP値(mg/dl、平時:0~5)、BUN値(mg/dl、平時、9.8~20.1)、クレアチニン値(mg/dl、平時、0.57~1.11) 、白血球数 (通常 4.5 ~ 11.0 ×109/L) およびヘマトクリット値 (%、通常: 35.5 ~ 48%)]、およびバルタザール断層撮影スコア [0: 正常、1: 膵臓サイズの増加、 2: 膵臓組織および膵臓周囲脂肪組織の炎症性変化、3: 不規則に縁取られた単一の液体収集、4: 不規則に縁取られた 2 つ以上の液体収集、5 ~ 10 の異なる程度の壊死)] が Excel ファイルに記録されます。
- 改訂されたアトランタのスコアも、入院後 1 週間以内に軽度、中等度、重度のスコアとして記録されます。 急性膵炎の経過中に発症した感染性膵臓壊死および敗血症は、アトランタのスコアリングでいくつかの問題が不適切であるため、重度の急性膵炎として受け入れられます。 疾患の重症度は、アトランタスコアに従って評価されます。 そして、人工知能研究の結果は、アトランタのスコアリングの結果に応じて照合されます。
- 合併症は 0 として分類されます。なし、2;局所合併症:仮性嚢胞、膿瘍、壊死、血栓症、および腸間膜脂肪織炎、3;全身合併症:肺、腎臓、胃腸および心臓血管の合併症、4;重篤な合併症/併存疾患の混合状況、5: 感染性および敗血症性合併症。
- さらに、超音波内視鏡検査(EUS)、内視鏡的逆行性胆道膵管造影(ERCP)(はいまたはいいえ)、入院期間(10日未満または11日以上)、集中治療室の要件(存在するかどうか)などの侵襲的処置の要件)、将来の AP 発作の数 (1 か月の入院後の持続時間、1 回の発作または複数回の発作の時点で)、および生存 (死亡、生存) も記録されます。
機械学習アルゴリズムが使用されます: Gradient Boosted Ensemble Trees Trees。 (「グリーディ関数近似: 勾配ブースティング マシン」ジェローム H. フリードマン (1999))。 データセットは 90%-10% の比率で分割されています。 10% は検証用で、90% は AI 機械学習用です。 90% の機械学習部分も、70% が AI 学習用、30% が学習のテスト用として 2 つの部分に分割されています。 この目的のために、5 倍層化サンプリングが使用されています。
研究の人工知能方法
AI 機械学習に使用される機能:
- 性別: M/F
- 年齢:継続値
- 身長(cm):連続値
- 重量 (Kg): 連続値
- BMI グループ: グループ 1: ≤ 25 kg/m2;グループ 2; 25-30kg/m2;グループ 3: >30,1 kg/m2
- タバコ: 0;いいえ、1;はい
- アルコール: 0;いいえ、1;はい
- 真性糖尿病: 0;いいえ、1;はい
- 高血圧: 0;いいえ、1;はい
- 病因: 1;胆道、2;アルコール、3;高トリグリセリド血症、4;高カルシウム血症、5;薬、6;先天性、7;潜在性、8;内視鏡的逆行性胆道造影(ERCP)、9;奇妙な括約筋機能障害 (OSD)、10。悪性、11;乳頭内粘液性腫瘍 (IPMN)、12: 原発性硬化性胆管造影 (PSC) 13: 自己免疫、14: 複数の病因
- 白血球数 (WBC): N; 4,5-11x100
- ヘマトクリット (Hct): N; %35,5-48
- C反応性タンパク(CRP):N:0~5mg/dl
- 血中尿素窒素 (BUN): N: 9,8-20,1 mg/dl
- クレアチニン (KREA): N: 0,57-1,11 mg/dl
- バルタザールの得点 (BLTZR): 0;通常の P、1;膵臓のサイズの増加、2;膵臓組織および膵臓周囲脂肪組織における炎症性変化、3;不規則に縁取られた単一の体液コレクション、4、不規則に縁取られた 2 つ以上の体液コレクション、さまざまな程度の壊死 (5 ~ 10 の範囲)
人工知能では、ディシジョン ツリー モデルが教師あり機械学習に広く使用されています。 それらは、ジニ指数、ゲイン比/エントロピー、カイ二乗、回帰などに依存する場合があります。 AI では、人工ニューラル ネットワークやサポート ベクター マシンなどの他の機械学習アルゴリズムとは異なり、人間にとって理解しやすいルールを生成するため、好まれます。 一方、彼らは弱い学習者であると考えられています。 つまり、データセットに存在するノイズや外れ値の影響を大きく受けます。 このハンディキャップを回避するために、ランダム フォレスト、アンサンブル ツリー、勾配ブースティングなどのモデルが開発されました。
ランダム フォレストとアンサンブル ツリーは、データ セットの垂直方向と水平方向の部分に特定の決定木アルゴリズムを適用してルールを生成します。 この手法により、学習で発生するエラーが大幅に減少します。 学習プロセスが完了すると、弱いデシジョン ツリーが結合されて、強力で大きなデシジョン ツリー モデルになります。 アンサンブル学習モデルは、F ^(x) 近似を介してトレーニング セットの損失関数の平均値を最小化することにより、より優れた学習を実現します。 アイデアは、貪欲な方法で最小化問題に最急降下ステップを適用することです。
この研究では、Friedman によって提案された勾配ブースト ツリー モデルが機械学習に使用されています。 このモデルは、ツリー全体に対して 1 つの最適値を選択するのではなく、ツリーの各部分に対して個別の最適値を選択します。 このアプローチを使用して、段階ごとの加算モデリングの転送と組み合わせて、微分可能な損失 L(y, F) を最小限に抑えることができます。 多くの場合、勾配ブースティング ツリー モデルは、ランダム フォレストおよび通常のアンサンブル ツリーよりも優れていることが報告されています。
アルゴリズムの目標は、予想される L(y,F(x)) 損失関数を最小化する近似 F_m (x_i) を見つけることです。
アルゴリズムは次のように要約できます。
入力:
トレーニング データ セット: {(x_i,y_i )} i=1 ~ n (n 次元およびクラス変数) 微分可能な損失関数: L(y,F(x)) 反復回数: M.
出力:
F_m (x_i)
アルゴリズム:
モデルを定数値で初期化します。
F_0 (x)=arg min∑_(i=1)^n▒〖L(y_i,γ)〗
m = 1 ~ M の場合:
擬似残差を計算します rim r_im=-[(∂L(y_(i,) F(x_i )))/(∂F(x_i))]
トレーニング セットを使用して、基本学習器を疑似残差にトレーニングします。
{(x_i,y_i )} i=1 to n 乗数 γ を計算 γ=arg min∑_(i=1)^n▒〖L(y_i,F_(m-1) (x_i )+γh_m (x_i )) 〗
モデルを更新します。
〖F_m(x_i)=F〗_(m-1)(x_i)+γ_m h_m(x_i) 出力F_m(x_i)
分析では、クラス変数の不均衡の欠点を回避するために、Synthetic Minority Oversampling Technique (SMOTE) [5] が使用されています。 SMOTE は、データを増やすためのデータ拡張技術です。 場合によっては、クラス変数がすべてのケースから同じ量の値を持っていないことがあります。 たとえば、命を落とした患者よりも生き残った患者の方がはるかに多い可能性があります。 このような状況では、データが拡張されます。 この研究のデータセットのクラス変数には不均衡がありました。 そのため、トレーニング用のマイノリティ クラスを増やすために SMOTE が適用されました。
データセットは 90%-10% の比率で分割されています。 10% は検証用で、90% は AI 機械学習用です。 90% の機械学習部分も、70% が AI 学習用、30% が学習のテスト用として 2 つの部分に分割されています。 この目的のために、5 倍層化サンプリングが使用されています。 KNIME 分析プラットフォームは、AI 機械学習に使用されています。
研究の種類
入学 (実際)
連絡先と場所
研究場所
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Istanbul、七面鳥、34093
- Bezmialem Vakif University, Gastroenterology Clinic
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
-腹痛の開始後24時間以内にERに入院した急性膵炎の診断を受けた患者
除外基準:
- 入院直後に治療拒否票に署名し、退院する患者
- データが未完成の患者
- 精神病患者
- 全身状態が非常に悪い患者
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:コホート
- 時間の展望:回顧
コホートと介入
グループ/コホート |
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人工知能 (AI) 機械学習グループ
90% の機械学習部分も、70% が AI 学習用、30% が学習のテスト用として 2 つの部分に分割されています。 急性膵炎患者の 70% (約 840 pts) が、研究のモデル トレーニング グループを形成します。 急性膵炎患者の 30% (約 360 ポイント) が、この研究のテストグループを形成します。 ここでモデルにもクロスバリデーションが適用されるため、データ自体も変化し、分布も最適化されて予測力が向上します。 |
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検証グループ
急性膵炎患者の 10% (約 134 人) が、この研究の検証グループを形成します。 ここでモデルにもクロスバリデーションが適用されるため、データ自体も変化し、分布も最適化されて予測力が向上します。 |
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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機械学習による正確な重症度推定
時間枠:1週間以内に。
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重症度は、改訂されたアトランタの基準に従って、軽度、中等度、および重度の急性膵炎として表されます。
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1週間以内に。
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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侵襲的手続きの要件
時間枠:1週間以内に
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-結石による遠位総胆管閉塞、仮性嚢胞または壊死の発生などの理由を評価するための入院中のEUSまたはERCPの必要性(はいまたはいいえとして)
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1週間以内に
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集中治療室の要件
時間枠:1週間以内に
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患者が呼吸困難(呼吸数が 25/分以上の場合)、低血圧(90/60 mmHg 未満)、消化管出血(2 1 日で lt.)、患者の BUN レベルが 20 mg よりも高く、徐々に増加する場合 (yes または no として)
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1週間以内に
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生存状況
時間枠:1週間以内に
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死亡: 患者が生存している場合 (はい) 死亡している場合 (いいえ)
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1週間以内に
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入院期間
時間枠:1ヶ月以内
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入院期間は1日(10日未満または10日以上)
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1ヶ月以内
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AP 攻撃の数
時間枠:1回の発作または複数回の発作として1か月入院した後
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AP攻撃で再入院。
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1回の発作または複数回の発作として1か月入院した後
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者:Gökhan Silahtaroğlu, Prof.、Medipol University
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Banks PA, Bollen TL, Dervenis C, Gooszen HG, Johnson CD, Sarr MG, Tsiotos GG, Vege SS; Acute Pancreatitis Classification Working Group. Classification of acute pancreatitis--2012: revision of the Atlanta classification and definitions by international consensus. Gut. 2013 Jan;62(1):102-11. doi: 10.1136/gutjnl-2012-302779. Epub 2012 Oct 25.
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- van den Heever M, Mittal A, Haydock M, Windsor J. The use of intelligent database systems in acute pancreatitis--a systematic review. Pancreatology. 2014 Jan-Feb;14(1):9-16. doi: 10.1016/j.pan.2013.11.010. Epub 2013 Dec 4.
- Yoldas O, Koc M, Karakose N, Kilic M, Tez M. Prediction of clinical outcomes using artificial neural networks for patients with acute biliary pancreatitis. Pancreas. 2008 Jan;36(1):90-2. doi: 10.1097/MPA.0b013e31812e964b. No abstract available.
- Pearce CB, Gunn SR, Ahmed A, Johnson CD. Machine learning can improve prediction of severity in acute pancreatitis using admission values of APACHE II score and C-reactive protein. Pancreatology. 2006;6(1-2):123-31. doi: 10.1159/000090032. Epub 2005 Dec 1.
- Andersson B, Andersson R, Ohlsson M, Nilsson J. Prediction of severe acute pancreatitis at admission to hospital using artificial neural networks. Pancreatology. 2011;11(3):328-35. doi: 10.1159/000327903. Epub 2011 Jul 9.
- Qiu Q, Nian YJ, Guo Y, Tang L, Lu N, Wen LZ, Wang B, Chen DF, Liu KJ. Development and validation of three machine-learning models for predicting multiple organ failure in moderately severe and severe acute pancreatitis. BMC Gastroenterol. 2019 Jul 4;19(1):118. doi: 10.1186/s12876-019-1016-y.
- Greedy function approximation: A gradient boostingmachine.
- Clustering, A. (2009). Clustering Categorical Data Using Hierarchies. Engineering and Technology, 1(2), 334-339.
- Silahtaroğlu, G. (2009). An Attribute-Centre Based Decision Tree Classification Algorithm. Engineering and Technology, 302-306.
- Bentéjac, C., Csörgő, A., & Martínez-Muñoz, G. (2021). A comparative analysis of gradient boosting algorithms. Artificial Intelligence Review, 54(3). https://doi.org/10.1007/s10462-020-09896-5.
- Bentéjac, C., Csörgő, A., & Martínez-Muñoz, G. (2021). A comparative analysis of gradient boosting algorithms. Artificial Intelligence Review, 54(3). https://doi.org/10.1007/s10462-020-09896-5
- Berthold, M. R., Cebron, N., Dill, F., Gabriel, T. R., Kötter, T., Meinl, T., … Wiswedel, B. (2009). KNIME - the Konstanz information miner. ACM SIGKDD Explorations Newsletter. https://doi.org/10.1145/1656274.1656280
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
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医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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