トリプルネガティブ乳がんの分子サブタイピングとアフリカの祖先に関連する免疫原性
調査の概要
詳細な説明
この研究では、ナイジェリアの TNBC の mRNA プロファイルを特徴付け、ノバスコシア州の参照集団と比較しようとしています。 ナイジェリアにおける TNBC のユニークな腫瘍免疫プロファイルと、西アフリカに関連するケモカインのダフィー抗原受容体 (DARC) と TNBC サブタイプとの関連性についての洞察が初めて調査されます。
アフリカ腫瘍研究グループ (ARGO) およびダルハウジー/NSHA 乳がんバイオバンクからの新鮮凍結 TNBC 組織は、ダルハウジー大学のゲノミクス コア施設によって処理および分析されます。 臨床データは、ARGO バイオバンクでの検体取得により前向きに収集されます。 ダルハウジー/NSHAバイオバンクの場合、臨床データは医療記録からさかのぼって収集され、研究の過程で将来の収集のために電子データベースに移行されます。 標本の両方のコホートは、TSO500 プラットフォーム (Illumina Ulc.) で DNA および全トランスクリプトーム (mRNA) シーケンスを実行します。 腫瘍免疫微小環境は、22 の白血球集団と免疫調節タンパク質 CTLA-4 および PD-L1 の転写シグネチャを使用して、コホート間および mRNA クラスター別に比較されます。 最後に、DARC の腫瘍発現は、DARC 発現、TNBC mRNA クラスター、および社会人口学的変数 (すなわち、 人種/祖先、性別)。 The Cancer Genome Atlas からの全トランスクリプトーム データは、アフリカ系アメリカ人からの 55 の TNBC 標本を含む 3 番目のコホートとして抽出されます。
研究の種類
入学 (実際)
連絡先と場所
研究場所
-
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Nova Scotia
-
Halifax、Nova Scotia、カナダ、B2Y 1A7
- Nova Scotia Health
-
-
参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- トリプルネガティブ乳がんと診断されました
除外基準:
- トリプルネガティブ乳がんの診断なし
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 観測モデル：コホート
- 時間の展望：見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
介入・治療 |
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ノバスコシア TNBC コホート
TruSight Oncology 500 (TSO500) プラットフォーム (Illumina Canada, Ulc) を使用して、DNA および全トランスクリプトーム mRNA シーケンシング (総突然変異負荷およびマイクロサテライト不安定性を含む) を実行します。
トランスクリプトーム データは、標本を 4 つの異なる mRNA サブグループの 1 つに分類するために使用され、コホート間で比較されます。
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TruSight Oncology 500 (TSO500) プラットフォーム (Illumina Canada, Ulc) を使用して、DNA および全トランスクリプトーム mRNA シーケンシング (総突然変異負荷およびマイクロサテライト不安定性を含む) を実行します。
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ナイジェリアの TNBC コホート
TruSight Oncology 500 (TSO500) プラットフォーム (Illumina Canada, Ulc) を使用して、DNA および全トランスクリプトーム mRNA シーケンシング (総突然変異負荷およびマイクロサテライト不安定性を含む) を実行します。
トランスクリプトーム データは、標本を 4 つの異なる mRNA サブグループの 1 つに分類するために使用され、コホート間で比較されます。
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TruSight Oncology 500 (TSO500) プラットフォーム (Illumina Canada, Ulc) を使用して、DNA および全トランスクリプトーム mRNA シーケンシング (総突然変異負荷およびマイクロサテライト不安定性を含む) を実行します。
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
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DNA および mRNA シーケンス
時間枠：3年
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3年
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ケモカインのダフィー抗原受容体
時間枠：3年
|
3年
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協力者と研究者
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
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