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Molekulare Subtypisierung von dreifach negativem Brustkrebs und afrikanischer Abstammungs-Immunogenität

19. August 2024 aktualisiert von: Nova Scotia Health Authority
Triple-negativer Brustkrebs (TNBC) ist eine heterogene Erkrankung, die in Nordamerika mit einem jüngeren Erkrankungsalter, schlechteren stadiengerechten Ergebnissen und Frauen afrikanischer Abstammung einhergeht. Eine höhere Inzidenz von TNBC wird auch in Westafrika beobachtet, trotz einzigartiger umweltbedingter, sozioökonomischer und modifizierbarer Risikofaktoren. Die Transkriptomanalyse von TNBC hat vier verschiedene Untergruppen mit therapeutischer und prognostischer Bedeutung abgegrenzt. Bei weiterer Charakterisierung sind wichtige regionale Unterschiede zwischen Populationen afrikanischer vs. Europäische Abstammung. Diese Unterschiede können erhebliche Auswirkungen auf die Wirksamkeit einer neuartigen TNBC-gerichteten Therapie haben und müssen weiter evaluiert werden. Transkriptionsdaten zu TNBC in Subsahara-Afrika bieten auch die Möglichkeit, die Beziehung zwischen Brustkrebs-Phänotyp und abstammungsbedingten Unterschieden in der tumorimmunen Mikroumgebung zu bewerten.

Studienübersicht

Status

Abgeschlossen

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Detaillierte Beschreibung

Diese Studie versucht, das mRNA-Profil von TNBC in Nigeria zu charakterisieren und mit einer Referenzpopulation in Nova Scotia zu vergleichen. Erstmals werden Einblicke in das einzigartige Tumorimmunprofil von TNBC in Nigeria und die Verbindung zwischen dem mit Westafrika verknüpften Duffy-Antigen-Rezeptor für Chemokine (DARC) und dem TNBC-Subtyp untersucht.

Frisches gefrorenes TNBC-Gewebe von der African Research Group for Oncology (ARGO) und Brustkrebs-Biobanken von Dalhousie/NSHA wird von der Genomics Core Facility an der Dalhousie University verarbeitet und analysiert. Klinische Daten werden prospektiv mit Probengewinnung in der ARGO Biobank erhoben. Für die Dalhousie/NSHA-Biobank werden klinische Daten rückwirkend aus der Krankenakte erhoben und im Laufe der Studie zur prospektiven Erhebung in eine elektronische Datenbank migriert. Beide Kohorten von Proben werden auf der TSO500-Plattform (Illumina Ulc.) einer DNA- und Gesamttranskriptom-Sequenzierung (mRNA) unterzogen. Die tumorimmune Mikroumgebung wird zwischen Kohorten und nach mRNA-Clustern verglichen, wobei die Transkriptionssignaturen für 22 Leukozytenpopulationen und die immunregulierenden Proteine ​​CTLA-4 und PD-L1 verwendet werden. Schließlich wird die Tumorexpression von DARC aus den Transkriptomdaten generiert, die eine Bewertung der Beziehung zwischen DARC-Expression, TNBC-mRNA-Clustern und soziodemografischen Variablen (d. h. Rasse/Abstammung, Geschlecht). Als dritte Kohorte werden vollständige Transkriptomdaten aus dem Cancer Genome Atlas herangezogen, darunter 55 TNBC-Proben von Afroamerikanern.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Tatsächlich)

120

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

  • Kanada
    • Nova Scotia
      • Halifax, Nova Scotia, Kanada, B2Y 1A7
        • Nova Scotia Health

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

  • Kind
  • Erwachsene
  • Älterer Erwachsener

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Biologische Proben von Patientinnen mit dreifach negativem Brustkrebs

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Dreifach-negativer Brustkrebs diagnostiziert

Ausschlusskriterien:

  • Keine Diagnose von Triple-negativem Brustkrebs

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

  • Beobachtungsmodelle: Kohorte
  • Zeitperspektiven: Interessent

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Nova Scotia TNBC-Kohorte
Die DNA- und mRNA-Sequenzierung des gesamten Transkriptoms, einschließlich der Gesamtmutationslast und der Mikrosatelliteninstabilität, wird unter Verwendung der TruSight Oncology 500 (TSO500)-Plattform (Illumina Canada, Ulc) durchgeführt. Transkriptomdaten werden verwendet, um Proben in eine von vier unterschiedlichen mRNA-Untergruppen zu kategorisieren und werden zwischen Kohorten verglichen.
Genetisch: DNA- und mRNA-Sequenzierung des gesamten Transkriptoms
Die DNA- und mRNA-Sequenzierung des gesamten Transkriptoms, einschließlich der Gesamtmutationslast und der Mikrosatelliteninstabilität, wird unter Verwendung der TruSight Oncology 500 (TSO500)-Plattform (Illumina Canada, Ulc) durchgeführt.
Nigerianische TNBC-Kohorte
Die DNA- und mRNA-Sequenzierung des gesamten Transkriptoms, einschließlich der Gesamtmutationslast und der Mikrosatelliteninstabilität, wird unter Verwendung der TruSight Oncology 500 (TSO500)-Plattform (Illumina Canada, Ulc) durchgeführt. Transkriptomdaten werden verwendet, um Proben in eine von vier unterschiedlichen mRNA-Untergruppen zu kategorisieren und werden zwischen Kohorten verglichen.
Genetisch: DNA- und mRNA-Sequenzierung des gesamten Transkriptoms
Die DNA- und mRNA-Sequenzierung des gesamten Transkriptoms, einschließlich der Gesamtmutationslast und der Mikrosatelliteninstabilität, wird unter Verwendung der TruSight Oncology 500 (TSO500)-Plattform (Illumina Canada, Ulc) durchgeführt.

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Zeitfenster
DNA- und mRNA-Sequenzierung
Zeitfenster: 3 Jahre
3 Jahre
Duffy-Antigen-Rezeptor für Chemokine
Zeitfenster: 3 Jahre
3 Jahre

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Nova Scotia Health Authority

Mitarbeiter

Obafemi Awolowo University

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

1. Dezember 2021

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

1. Dezember 2023

Studienabschluss (Tatsächlich)

1. Dezember 2023

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

27. Oktober 2021

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

27. Oktober 2021

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

8. November 2021

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

21. August 2024

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

19. August 2024

Zuletzt verifiziert

1. August 2024

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • 42127

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

NEIN

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

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