삼중 음성 유방암 및 아프리카 조상 관련 면역원성의 분자 하위 유형화
연구 개요
상세 설명
이 연구는 나이지리아에서 TNBC의 mRNA 프로필을 특성화하고 Nova Scotia의 참조 인구와 비교하고자 합니다. 나이지리아에서 TNBC의 독특한 종양-면역 프로필에 대한 통찰력과 DARC(케모카인에 대한 서아프리카 연결 Duffy-항원 수용체)와 TNBC 하위 유형 사이의 연관성을 처음으로 탐구할 것입니다.
ARGO(African Research Group for Oncology) 및 Dalhousie/NSHA 유방암 바이오뱅크의 신선한 냉동 TNBC 조직은 Dalhousie University의 Genomics Core Facility에서 처리 및 분석됩니다. 임상 데이터는 ARGO 바이오뱅크에서 검체 획득과 함께 전향적으로 수집됩니다. Dalhousie/NSHA 바이오뱅크의 경우, 임상 데이터는 의료 기록에서 소급적으로 수집되고 연구 과정 동안 전향적 수집을 위해 전자 데이터베이스로 마이그레이션됩니다. 표본의 두 코호트 모두 TSO500 플랫폼(Illumina Ulc.)에서 DNA 및 전체 전사체(mRNA) 시퀀싱을 통해 실행됩니다. 종양-면역 미세환경은 22개의 백혈구 집단 및 면역-조절 단백질 CTLA-4 및 PD-L1에 대한 전사 시그니처를 사용하여 코호트 간에 그리고 mRNA 클러스터에 의해 비교될 것이다. 마지막으로, DARC의 종양 발현은 DARC 발현, TNBC mRNA 클러스터 및 사회인구학적 변수(즉, 인종/조상, 성별). The Cancer Genome Atlas의 전체 전사체 데이터는 아프리카계 미국인의 TNBC 표본 55개를 포함하여 세 번째 코호트로 뽑힐 것입니다.
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
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Nova Scotia
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Halifax, Nova Scotia, 캐나다, B2Y 1A7
- Nova Scotia Health
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 어린이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 삼중 음성 유방암으로 진단
제외 기준:
- 삼중 음성 유방암 진단 없음
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 관찰 모델: 보병대
- 시간 관점: 유망한
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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노바스코샤 TNBC 코호트
TruSight Oncology 500(TSO500) 플랫폼(Illumina Canada, Ulc)을 사용하여 DNA 및 전체 전사체 mRNA 시퀀싱(총 돌연변이 부하 및 미소부수체 불안정성 포함)을 수행합니다.
Transcriptome 데이터는 표본을 4개의 개별 mRNA 하위 그룹 중 하나로 분류하는 데 사용되며 코호트 간에 비교됩니다.
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TruSight Oncology 500(TSO500) 플랫폼(Illumina Canada, Ulc)을 사용하여 DNA 및 전체 전사체 mRNA 시퀀싱(총 돌연변이 부하 및 미소부수체 불안정성 포함)을 수행합니다.
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나이지리아 TNBC 코호트
TruSight Oncology 500(TSO500) 플랫폼(Illumina Canada, Ulc)을 사용하여 DNA 및 전체 전사체 mRNA 시퀀싱(총 돌연변이 부하 및 미소부수체 불안정성 포함)을 수행합니다.
Transcriptome 데이터는 표본을 4개의 개별 mRNA 하위 그룹 중 하나로 분류하는 데 사용되며 코호트 간에 비교됩니다.
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TruSight Oncology 500(TSO500) 플랫폼(Illumina Canada, Ulc)을 사용하여 DNA 및 전체 전사체 mRNA 시퀀싱(총 돌연변이 부하 및 미소부수체 불안정성 포함)을 수행합니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
기간 |
|---|---|
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DNA 및 mRNA 시퀀싱
기간: 3 년
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3 년
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케모카인에 대한 Duffy-항원 수용체
기간: 3 년
|
3 년
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공동 작업자 및 조사자
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (실제)
연구 완료 (실제)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
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