Molekulární podtypování trojnásobně negativního karcinomu prsu a imunogenicita související s africkým předkem
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Intervence / Léčba
Detailní popis
Tato studie se snaží charakterizovat profil mRNA TNBC v Nigérii a porovnat jej s referenční populací v Novém Skotsku. Poprvé bude prozkoumán pohled do jedinečného nádorově-imunitního profilu TNBC v Nigérii a spojení mezi Duffyho antigenním receptorem pro chemokiny (DARC) a podtypem TNBC vázaným na Západní Afriku.
Čerstvá zmrazená tkáň TNBC z Africké výzkumné skupiny pro onkologii (ARGO) a biobanky Dalhousie/NSHA pro rakovinu prsu bude zpracována a analyzována Genomics Core Facility na Dalhousie University. Klinická data jsou prospektivně shromažďována při odběru vzorků v biobance ARGO. Pro biobanku Dalhousie / NSHA budou klinická data retrospektivně shromážděna z lékařského záznamu a přenesena do elektronické databáze pro prospektivní sběr v průběhu studie. Obě kohorty vzorků budou podrobeny sekvenování DNA a celého transkriptomu (mRNA) na platformě TSO500 (Illumina Ulc.). Nádorově imunní mikroprostředí bude porovnáno mezi kohortami a mRNA shlukem pomocí transkripčních signatur pro 22 leukocytárních populací a imunoregulačních proteinů CTLA-4 a PD-L1. Nakonec bude z transkriptomových dat generována nádorová exprese DARC, která umožní posouzení vztahu mezi expresí DARC, klastry TNBC mRNA a sociodemografickými proměnnými (tj. rasa/rod, pohlaví). Celá transkriptomová data z The Cancer Genome Atlas budou stažena jako třetí kohorta, včetně 55 TNBC vzorků od Afroameričanů.
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
Nova Scotia
-
Halifax, Nova Scotia, Kanada, B2Y 1A7
- Nova Scotia Health
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Diagnostikována Triple-negativní rakovina prsu
Kritéria vyloučení:
- Žádná diagnóza Triple-negativního karcinomu prsu
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Budoucí
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Nova scotia TNBC kohorta
Sekvenování DNA a mRNA celého transkriptomu, včetně celkové mutační zátěže a nestability mikrosatelitů, bude provedeno pomocí platformy TruSight Oncology 500 (TSO500) (Illumina Canada, Ulc).
Data transkriptomu budou použita ke kategorizaci vzorků do jedné ze čtyř odlišných podskupin mRNA a budou porovnána mezi kohortami.
|
Sekvenování DNA a mRNA celého transkriptomu, včetně celkové mutační zátěže a nestability mikrosatelitů, bude provedeno pomocí platformy TruSight Oncology 500 (TSO500) (Illumina Canada, Ulc).
|
|
Nigerijská kohorta TNBC
Sekvenování DNA a mRNA celého transkriptomu, včetně celkové mutační zátěže a nestability mikrosatelitů, bude provedeno pomocí platformy TruSight Oncology 500 (TSO500) (Illumina Canada, Ulc).
Data transkriptomu budou použita ke kategorizaci vzorků do jedné ze čtyř odlišných podskupin mRNA a budou porovnána mezi kohortami.
|
Sekvenování DNA a mRNA celého transkriptomu, včetně celkové mutační zátěže a nestability mikrosatelitů, bude provedeno pomocí platformy TruSight Oncology 500 (TSO500) (Illumina Canada, Ulc).
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Časové okno |
|---|---|
|
Sekvenování DNA a mRNA
Časové okno: 3 roky
|
3 roky
|
|
Duffyho antigenní receptor pro chemokiny
Časové okno: 3 roky
|
3 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Spolupracovníci
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Aktuální)
Dokončení studie (Aktuální)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 42127
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .