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胃腺癌におけるトランスクリプトームの特徴 (GAC)

2022年4月8日 更新者：raghavendra、Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences

胃腺癌におけるトランスクリプトーム シグネチャとその関連性の探索

すべての胃の悪性腫瘍の大部分を占める胃腺癌 (GAC) は、治療戦略の進歩にもかかわらず、全生存率が 25 ～ 30% と低いことに関連しています。 腫瘍微小環境 (TME) に関連するいくつかの要因は、TCGA および ACRG によって与えられた GAC の包括的な分子分類では対処されない、腫瘍形成および治療に対する獲得化学療法抵抗性において重要な役割を果たしていると考えられています。 本研究では、研究者は GAC 腫瘍組織と隣接する正常組織のトランスクリプトームプロファイリングを行い、胃腺癌の生存転帰と臨床的に関連する遺伝子シグネチャーの同定に役立つ可能性がある TME に関連して 2 つの間で発現差のある遺伝子を調査する予定です。

調査の概要

状態

募集

条件

介入・治療

詳細な説明

胃腺癌に関するこの研究は、インドのラクナウにある SGPGIMS で実施されるレトロスペクティブおよびプロスペクティブです。 消化器外科で胃切除を受け、病理部で内視鏡生検によりGACと診断された患者を募集する。 研究のレトロスペクティブな部分では、病院の情報システムと患者の記録から取得した組織学的所見に基づいて症例が選択されます。

サンプル収集のために、外科的に切除された新鮮な標本を RNAlater で収集し、-80⁰C で保存します。 遡及症例用のアーカイブされたホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織ブロックが回収され、組織病理学的にレビューされます。 GACの診断が確認された後、組織を処理して、実験用の腫瘍組織と正常組織を取得します。

腫瘍および正常領域からの RNA は、FFPE ブロックおよび新鮮な組織標本から抽出されます。 全トランスクリプトーム次世代シーケンスは、品質チェック、ライブラリーの準備、および増幅が成功した後に実行されます。 シーケンシングから得られた遺伝子発現データは、生物情報学的に分析され、TMEに関連して腫瘍と隣接する正常組織との間の異なる遺伝子発現が解明されます。 腫瘍領域と正常領域の間で有意に差次的に発現する遺伝子は、遺伝子注釈用のバイオインフォマティクス パッケージを使用して注釈が付けられ、識別されます。 統計分析を使用して、差次的に発現する遺伝子を患者の臨床的特徴および転帰と相関させ、有意な予後的価値を持つ TME 遺伝子を特定します。

研究の種類

観察的

入学 (予想される)

48

連絡先と場所

このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。

研究連絡先

研究連絡先のバックアップ

研究場所

  • インド
    • Uttar Pradesh
      • Lucknow、Uttar Pradesh、インド、226014
        • 募集
        • Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences
        • コンタクト：
        • コンタクト：

参加基準

研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。

適格基準

就学可能な年齢

18年～80年 (大人、高齢者)

健康ボランティアの受け入れ

なし

受講資格のある性別

全て

サンプリング方法

非確率サンプル

調査対象母集団

SGPGIMSで遠位胃腺癌と診断された被験者は、この研究のために募集されます

説明

包含基準:

  • 胃の遠位部に腫瘍の起点がある患者
  • 生検後に胃全摘または部分切除を行った患者
  • 放射線治療または胃科でのフォローアップの利用可能性
  • 組織病理学における選択された症例のFFPE胃切除標本組織の入手可能性

除外基準:

  • 胃の近位部に腫瘍の起点がある患者
  • 生検しか受けられない患者
  • 経過観察ができない患者
  • FFPE組織ブロックが利用できない

研究計画

このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。

研究はどのように設計されていますか？

デザインの詳細

コホートと介入

グループ/コホート
介入・治療
胃腺癌患者
胃の遠位部に腫瘍の起源を持つ患者で、フォローアップとアーカイブされたFFPE組織が利用できる生検検査後に胃の全摘または部分切除を受けた患者は、この研究の対象となります。
診断テスト：観察研究
胃腺癌患者の予後に重要な役割を果たす腫瘍微小環境に関連するトランスクリプトーム シグネチャの探索

この研究は何を測定していますか？

主要な結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
胃腺癌のトランスクリプトームプロファイリング
時間枠：6か月から5年の範囲の患者募集
RNA - シーケンシングを介して癌組織および正常組織の遺伝子発現データを取得する
6か月から5年の範囲の患者募集
胃腺癌における差次的遺伝子発現解析
時間枠：6か月から5年の範囲の患者募集
遺伝子発現データのバイオインフォマティクス解析により、腫瘍組織と正常組織の間で発現差のある遺伝子を決定する
6か月から5年の範囲の患者募集
胃腺癌の遺伝子発現プロファイルに対する腫瘍微小環境の影響
時間枠：6か月から5年の範囲の患者募集
バイオインフォマティクスパッケージを使用して、腫瘍微小環境関連遺伝子とその機能注釈を特定する
6か月から5年の範囲の患者募集
腫瘍微小環境関連遺伝子と患者の臨床的特徴との相関
時間枠：6か月から5年の範囲の患者募集
差次的に発現する腫瘍微小環境関連遺伝子を患者の転帰と相関させて、全生存に有意に関連する遺伝子を特定する
6か月から5年の範囲の患者募集

二次結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
遺伝子発現と全生存期間の相関に基づく患者のリスク層別化
時間枠：6か月から5年の範囲の患者募集
胃腺癌患者の全生存に関連する遺伝子シグネチャーに基づいて患者を層別化する
6か月から5年の範囲の患者募集

協力者と研究者

ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。

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Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences

捜査官

  • 主任研究者：Raghavendra Lingaiah、SGPGIMS

出版物と役立つリンク

研究に関する情報を入力する責任者は、自発的にこれらの出版物を提供します。これらは、研究に関連するあらゆるものに関するものである可能性があります。

一般刊行物

研究記録日

これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。

主要日程の研究

研究開始 (実際)

2021年8月6日

一次修了 (予想される)

2025年4月6日

研究の完了 (予想される)

2025年10月6日

試験登録日

最初に提出

2022年3月31日

QC基準を満たした最初の提出物

2022年3月31日

最初の投稿 (実際)

2022年4月8日

学習記録の更新

投稿された最後の更新 (実際)

2022年4月15日

QC基準を満たした最後の更新が送信されました

2022年4月8日

最終確認日

2022年4月1日

詳しくは

本研究に関する用語

キーワード

追加の関連 MeSH 用語

その他の研究ID番号

  • 2021-240-PhD-EXP-42

個々の参加者データ (IPD) の計画

個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?

いいえ

医薬品およびデバイス情報、研究文書

米国FDA規制医薬品の研究

いいえ

米国FDA規制機器製品の研究

いいえ

この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。

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