Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Transkriptomické signatury u adenokarcinomu žaludku (GAC)

8. dubna 2022 aktualizováno: raghavendra, Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences

Zkoumání transkriptomických signatur a jejich významu u adenokarcinomu žaludku

Gastrický adenokarcinom (GAC), který představuje hlavní procento všech malignit žaludku, je spojen se špatným celkovým přežitím 25–30 % navzdory pokroku v léčebných strategiích. Má se za to, že několik faktorů spojených s mikroprostředím tumoru (TME) hraje důležitou roli v tumorigenezi a získané chemorezistenci vůči terapiím, které nejsou jinak řešeny komplexní molekulární klasifikací GAC danou TCGA a ACRG. V této studii mají výzkumníci v úmyslu provést transkriptomové profilování nádorové tkáně GAC a přilehlé normální tkáně, aby prozkoumali odlišně exprimované geny mezi těmito dvěma ve vztahu k TME, což by mohlo pomoci při identifikaci genových signatur, které jsou klinicky relevantní pro výsledek přežití u adenokarcinomu žaludku.

Přehled studie

Postavení

Nábor

Podmínky

Intervence / Léčba

Detailní popis

Tato studie o adenokarcinomu žaludku je retrospektivní i prospektivní, která bude provedena v SGPGIMS, Lucknow, Indie. Do studie budou zařazeni pacienti podstupující resekci žaludku na oddělení chirurgické gastroenterologie, u kterých je na základě endoskopické biopsie na oddělení patologie diagnostikována GAC. Pro retrospektivní část studie budou vybrány případy na základě histologických nálezů získaných z nemocničního informačního systému a záznamů pacientů.

Pro odběr vzorků budou chirurgicky resekované čerstvé vzorky odebrány do RNAlater a uloženy při -80 °C. Archivované tkáňové bloky zalité do parafínu (FFPE) pro retrospektivní případy budou získány a histopatologicky přezkoumány. Po potvrzené diagnóze GAC budou tkáně zpracovány pro získání nádorové a normální tkáně pro experimentální část.

RNA z nádoru a normální oblasti bude extrahována z FFPE bloků a vzorků čerstvé tkáně. Celé transkriptomické sekvenování nové generace bude provedeno po úspěšné kontrole kvality, přípravě knihovny a amplifikaci. Data genové exprese získaná ze sekvenování budou bioinformaticky analyzována za účelem objasnění rozdílné genové exprese mezi nádorem a přilehlou normální tkání ve vztahu k TME. Významně odlišně exprimované geny mezi nádorovou a normální oblastí budou anotovány a identifikovány pomocí bioinformatických balíčků pro genovou anotaci. Pomocí statistické analýzy budou rozdílně exprimované geny korelovány s klinickými rysy a výsledkem pacienta, aby se identifikovaly geny TME s významnou prognostickou hodnotou.

Typ studie

Pozorovací

Zápis (Očekávaný)

48

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní kontakt

Studijní záloha kontaktů

Studijní místa

  • Indie
    • Uttar Pradesh
      • Lucknow, Uttar Pradesh, Indie, 226014

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

18 let až 80 let (Dospělý, Starší dospělý)

Přijímá zdravé dobrovolníky

N/A

Pohlaví způsobilá ke studiu

Všechno

Metoda odběru vzorků

Vzorek nepravděpodobnosti

Studijní populace

Do této studie budou přijati jedinci s diagnózou distálního adenokarcinomu žaludku na SGPGIMS

Popis

Kritéria pro zařazení:

  • Pacienti s původem nádoru v distální části žaludku
  • Pacienti, kteří podstoupili celkovou nebo částečnou gastrektomii po bioptickém vyšetření
  • Možnost sledování na Radioterapeutickém nebo Gastro oddělení
  • Dostupnost vzorku tkáně FFPE gastrektomie u vybraných případů v histopatologii

Kritéria vyloučení:

  • Pacienti s původem nádoru v proximální části žaludku
  • Pacienti s dostupnou pouze biopsií
  • Pacienti, jejichž sledování není k dispozici
  • Nedostupnost tkáňových bloků FFPE

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

Kohorty a intervence

Skupina / kohorta
Intervence / Léčba
Pacienti s adenokarcinomem žaludku
Pro tuto studii budou zvažováni pacienti s původem tumoru v distální části žaludku, kteří podstoupili totální nebo částečnou gastrektomii po bioptickém vyšetření s dostupností sledování a archivované tkáně FFPE.
Diagnostický test: Observační studie
Průzkum transkriptomických signatur souvisejících s nádorovým mikroprostředím, které mají významnou roli v prognóze pacientů s adenokarcinomem žaludku

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Profilování transkriptomu adenokarcinomu žaludku
Časové okno: Rozsah náboru pacientů od 6 měsíců do 5 let
Získat data o genové expresi rakovinné a normální tkáně pomocí sekvenování RNA
Rozsah náboru pacientů od 6 měsíců do 5 let
Analýza diferenciální genové exprese u adenokarcinomu žaludku
Časové okno: Rozsah náboru pacientů od 6 měsíců do 5 let
Stanovit rozdílně exprimovaný gen mezi nádorovou a normální tkání pomocí bioinformatické analýzy dat genové exprese
Rozsah náboru pacientů od 6 měsíců do 5 let
Vliv nádorového mikroprostředí na profil genové exprese adenokarcinomu žaludku
Časové okno: Rozsah náboru pacientů od 6 měsíců do 5 let
Identifikovat geny související s nádorovým mikroprostředím a jejich funkční anotace pomocí bioinformatických balíčků
Rozsah náboru pacientů od 6 měsíců do 5 let
Korelace genů souvisejících s mikroprostředím nádoru s klinickými rysy pacienta
Časové okno: Rozsah náboru pacientů od 6 měsíců do 5 let
Korelovat odlišně exprimovaný gen související s mikroprostředím nádoru s výsledkem u pacientů, aby se identifikovaly geny významně související s celkovým přežitím
Rozsah náboru pacientů od 6 měsíců do 5 let

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Stratifikace rizika pacientů na základě korelace mezi genovou expresí a celkovým přežitím
Časové okno: Rozsah náboru pacientů od 6 měsíců do 5 let
Stratifikovat pacienty na základě genových signatur souvisejících s celkovým přežitím u pacientů s adenokarcinomem žaludku
Rozsah náboru pacientů od 6 měsíců do 5 let

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Sponzor

Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Raghavendra Lingaiah, SGPGIMS

Publikace a užitečné odkazy

Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.

Obecné publikace

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

6. srpna 2021

Primární dokončení (Očekávaný)

6. dubna 2025

Dokončení studie (Očekávaný)

6. října 2025

Termíny zápisu do studia

První předloženo

31. března 2022

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

31. března 2022

První zveřejněno (Aktuální)

8. dubna 2022

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

15. dubna 2022

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

8. dubna 2022

Naposledy ověřeno

1. dubna 2022

Více informací

Termíny související s touto studií

Klíčová slova

Další relevantní podmínky MeSH

Další identifikační čísla studie

  • 2021-240-PhD-EXP-42

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

NE

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Předplatit