- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT05319392
Transkriptomiske signaturer i gastrisk adenocarcinom (GAC)
Udforskning af de transkriptomiske signaturer og deres relevans i gastrisk adenocarcinom
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Denne undersøgelse af gastrisk adenocarcinom er retrospektiv såvel som prospektiv, som vil blive udført på SGPGIMS, Lucknow, Indien. Patienter, der gennemgår gastrisk resektion på kirurgisk gastroenterologisk afdeling, og som er diagnosticeret med GAC baseret på den endoskopiske biopsi i patologisk afdeling, vil blive rekrutteret til undersøgelsen. Til den retrospektive del af undersøgelsen vil tilfælde blive udvalgt baseret på histologiske fund hentet fra hospitalets informationssystem og patientjournaler.
Til prøvetagning vil kirurgisk resekerede friske prøver blive indsamlet i RNAlater og opbevaret ved -80⁰C. Arkiverede formalinfikserede paraffinindlejrede (FFPE) vævsblokke til retrospektive tilfælde vil blive hentet og gennemgået histopatologisk. Efter en bekræftet diagnose af GAC, vil væv blive behandlet for at opnå tumor og normalt væv til eksperimentel del.
RNA fra tumoren og det normale område vil blive ekstraheret fra FFPE-blokke og friske vævsprøver. Hele transkriptomiske næste generations sekventering vil blive udført efter vellykket kvalitetskontrol, biblioteksforberedelse og amplifikation. Genekspressionsdata opnået fra sekventering vil blive bioinformatisk analyseret for at belyse differentiel genekspression mellem tumor og tilstødende normalt væv i forhold til TME. De signifikant differentielt udtrykte gener mellem tumor- og normale områder vil blive kommenteret og identificeret ved hjælp af bioinformatiske pakker til genannotering. Ved hjælp af statistisk analyse vil de differentielt udtrykte gener blive korreleret med patientens kliniske træk og udfald for at identificere TME-gener med signifikant prognostisk værdi.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Forventet)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: Raghavendra Lingaiah
- Telefonnummer: +91-522-2494250
- E-mail: raghulingaiah@gmail.com
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Shalini Singh
- E-mail: shal_singh@yahoo.co.uk
Studiesteder
-
-
Uttar Pradesh
-
Lucknow, Uttar Pradesh, Indien, 226014
- Rekruttering
- Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences
-
Kontakt:
- Raghavendra Lingaiah
- Telefonnummer: +91-522-2494250
- E-mail: raghulingaiah@gmail.com
-
Kontakt:
- Shalini Singh
- E-mail: shal_singh@yahoo.co.uk
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Patienter med oprindelse af tumor i den distale del af maven
- Patienter, der gennemgik total eller delvis gastrectomi efter biopsiundersøgelse
- Mulighed for opfølgning i strålebehandling eller gastro afdeling
- Tilgængelighed af FFPE-gatrektomiprøvevæv fra udvalgte tilfælde i histopatologi
Ekskluderingskriterier:
- Patienter med oprindelse af tumor i den proksimale del af maven
- Patienter med kun biopsi tilgængelig
- Patienter, hvis opfølgning ikke er tilgængelig
- Manglende tilgængelighed af FFPE-vævsblokke
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
---|---|
Patienter med gastrisk adenocarcinom
Patienter med oprindelse af tumor i den distale del af maven, som har gennemgået total eller delvis gastrectomi efter biopsiundersøgelse med tilgængelighed af opfølgning og arkiveret FFPE-væv, vil blive overvejet til denne undersøgelse.
|
Udforskning af transkriptomiske signaturer relateret til tumormikromiljø, der har en væsentlig rolle i prognosen for gastriske adenocarcinompatienter
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Transkriptomprofilering af gastrisk adenokarcinom
Tidsramme: Interval på 6 måneder til 5 års patientrekruttering
|
At opnå genekspressionsdata for cancerøst og normalt væv gennem RNA - sekventering
|
Interval på 6 måneder til 5 års patientrekruttering
|
Differentiel genekspressionsanalyse i gastrisk adenokarcinom
Tidsramme: Interval på 6 måneder til 5 års patientrekruttering
|
At bestemme differentielt udtrykt gen mellem tumor og normalt væv gennem bioinformatisk analyse af genekspressionsdata
|
Interval på 6 måneder til 5 års patientrekruttering
|
Indflydelse af tumormikromiljø på genekspressionsprofil af gastrisk adenocarcinom
Tidsramme: Interval på 6 måneder til 5 års patientrekruttering
|
At identificere tumormikromiljørelaterede gener og deres funktionelle annotering ved hjælp af bioinformatiske pakker
|
Interval på 6 måneder til 5 års patientrekruttering
|
Korrelation af tumormikromiljørelaterede gener med patientens kliniske egenskaber
Tidsramme: Interval på 6 måneder til 5 års patientrekruttering
|
At korrelere differentielt udtrykt tumormikromiljørelateret gen med udfald hos patienter for at identificere gener, der er signifikant relateret til den samlede overlevelse
|
Interval på 6 måneder til 5 års patientrekruttering
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Patientrisikostratificering baseret på sammenhæng mellem genekspression og samlet overlevelse
Tidsramme: Interval på 6 måneder til 5 års patientrekruttering
|
At stratificere patienter baseret på gensignaturer relateret til samlet overlevelse hos gastriske adenocarcinompatienter
|
Interval på 6 måneder til 5 års patientrekruttering
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Raghavendra Lingaiah, SGPGIMS
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Ahn B, Chae YS, Kim CH, Lee Y, Lee JH, Kim JY. Tumor microenvironmental factors have prognostic significances in advanced gastric cancer. APMIS. 2018 Oct;126(10):814-821. doi: 10.1111/apm.12889.
- Zhang S, Zeng Z, Liu Y, Huang J, Long J, Wang Y, Peng X, Hu Z, Ouyang Y. Prognostic landscape of tumor-infiltrating immune cells and immune-related genes in the tumor microenvironment of gastric cancer. Aging (Albany NY). 2020 Sep 23;12(18):17958-17975. doi: 10.18632/aging.103519. Epub 2020 Sep 23.
- Qiu XT, Song YC, Liu J, Wang ZM, Niu X, He J. Identification of an immune-related gene-based signature to predict prognosis of patients with gastric cancer. World J Gastrointest Oncol. 2020 Aug 15;12(8):857-876. doi: 10.4251/wjgo.v12.i8.857.
- Ren N, Liang B, Li Y. Identification of prognosis-related genes in the tumor microenvironment of stomach adenocarcinoma by TCGA and GEO datasets. Biosci Rep. 2020 Oct 30;40(10):BSR20200980. doi: 10.1042/BSR20200980.
- Cai WY, Dong ZN, Fu XT, Lin LY, Wang L, Ye GD, Luo QC, Chen YC. Identification of a Tumor Microenvironment-relevant Gene set-based Prognostic Signature and Related Therapy Targets in Gastric Cancer. Theranostics. 2020 Jul 9;10(19):8633-8647. doi: 10.7150/thno.47938. eCollection 2020.
- Li T, Gao X, Han L, Yu J, Li H. Identification of hub genes with prognostic values in gastric cancer by bioinformatics analysis. World J Surg Oncol. 2018 Jun 19;16(1):114. doi: 10.1186/s12957-018-1409-3.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Forventet)
Studieafslutning (Forventet)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 2021-240-PhD-EXP-42
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Gastrisk Adenocarcinom
-
Medtronic - MITGAfsluttet
-
Washington University School of MedicineNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases (NIDDK)AfsluttetRoux-en-Y Gastric Bypass | Bariatrisk kirurgi | Vertikal ærmegatrektomi | Mavebånd | Bypass, GastricForenede Stater
-
DuomedAktiv, ikke rekrutterendeFedme | Gastrectomi | Roux-en-Y Gastric Bypass | Mini Gastric BypassBelgien
-
Olympus Corporation of the AmericasUnity Health TorontoAfsluttet
-
North Dakota State UniversityNational Institutes of Health (NIH)AfsluttetRoux en Y Gastric Bypass OperationForenede Stater
-
Rijnstate HospitalAfsluttetRoux-en-Y Gastric Bypass | Mavetømning | Bariatrisk kirurgiHolland
-
Wageningen UniversityRijnstate HospitalUkendtRoux-en-Y Gastric BypassHolland
-
North Dakota State UniversityNeuropsychiatric Research Institute, Fargo, North DakotaAfsluttetRoux en Y Gastric BypassForenede Stater
-
Rijnstate HospitalAfsluttet
-
M.D. Anderson Cancer CenterNational Cancer Institute (NCI)Aktiv, ikke rekrutterendeKlinisk trin III Gastroøsofageal Junction Adenocarcinoma AJCC v8 | Klinisk trin IV Gastroøsofageal Junction Adenocarcinoma AJCC v8 | Uoperabelt Gastroøsofageal Junction Adenocarcinoma | Lokalt avanceret Gastroøsofageal Junction Adenocarcinoma | Postneoadjuverende terapi Stage III Gastroøsofageal... og andre forholdForenede Stater
Kliniske forsøg med Observationsstudie
-
Clinical Research Centre, MalaysiaHospital Queen Elizabeth, MalaysiaAfsluttetCovid19 | Kritisk sygMalaysia
-
Verily Life Sciences LLCAfsluttet
-
Tampere University HospitalAfsluttet
-
Radicle ScienceAktiv, ikke rekrutterendeKognitiv funktionForenede Stater
-
University of MichiganAfsluttet
-
University of MichiganAfsluttet
-
Radicle ScienceRekrutteringSmerte | Neuropatisk smerte | Nociceptiv smerteForenede Stater
-
Scion NeuroStimTilmelding efter invitationParkinsons sygdom | Parkinsons sygdom og ParkinsonismeForenede Stater
-
Apple Inc.Stanford UniversityAfsluttetAtrieflimren | Arytmier, hjerte | AtrieflimrenForenede Stater
-
National Eye Institute (NEI)AfsluttetMakuladegeneration | Diabetisk retinopati | Mitokondrier | Hippel-Landaus sygdomForenede Stater