Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Transkriptomiske signaturer i gastrisk adenokarsinom (GAC)

8. april 2022 oppdatert av: raghavendra, Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences

Utforske transkriptomiske signaturer og deres relevans i gastrisk adenokarsinom

Gastrisk adenokarsinom (GAC) som står for den største prosentandelen av alle magekreft, er assosiert med en dårlig total overlevelse på 25-30 % til tross for fremskritt i behandlingsstrategier. Flere faktorer assosiert med tumormikromiljø (TME) antas å spille en viktig rolle i tumorgenese og ervervet kjemoresistens mot terapier som ellers ikke er adressert av den omfattende molekylære klassifiseringen av GAC gitt av TCGA og ACRG. I denne studien har etterforskere til hensikt å gjøre transkriptomprofilering av GAC-svulstvev og tilstøtende normalt vev for å undersøke differensielt uttrykte gener mellom de to i forhold til TME som kan hjelpe til med identifisering av gensignaturer som er klinisk relevante med overlevelsesutfall i gastrisk adenokarsinom.

Studieoversikt

Status

Rekruttering

Forhold

Intervensjon / Behandling

Detaljert beskrivelse

Denne studien på gastrisk adenokarsinom er retrospektiv så vel som prospektiv som vil bli utført ved SGPGIMS, Lucknow, India. Pasienter som gjennomgår gastrisk reseksjon ved avdeling for kirurgisk gastroenterologi som får diagnosen GAC basert på den endoskopiske biopsien ved patologisk avdeling vil bli rekruttert til studien. For den retrospektive delen av studien vil tilfeller bli valgt basert på histologiske funn hentet fra sykehusets informasjonssystem og pasientjournaler.

For prøvetaking vil kirurgisk resekerte ferske prøver samles inn i RNAlater og lagres ved -80⁰C. Arkiverte formalinfikserte parafininnstøpte (FFPE) vevsblokker for retrospektive tilfeller vil bli hentet og gjennomgått histopatologisk. Etter en bekreftet diagnose av GAC, vil vev bli behandlet for å oppnå tumor og normalt vev for eksperimentell del.

RNA fra svulsten og det normale området vil bli ekstrahert fra FFPE-blokker og ferske vevsprøver. Hele transkriptomiske neste generasjons sekvensering vil bli utført etter vellykket kvalitetssjekk, bibliotekforberedelse og amplifikasjon. Genekspresjonsdata innhentet fra sekvensering vil bli bioinformatisk analysert for å belyse differensielt genuttrykk mellom tumor og tilstøtende normalt vev i forhold til TME. De signifikant differensielt uttrykte genene mellom svulsten og normale områder vil bli annotert og identifisert ved bruk av bioinformatiske pakker for genannotering. Ved hjelp av statistisk analyse vil de differensielt uttrykte genene korreleres med pasientens kliniske egenskaper og utfall for å identifisere TME-gener med betydelig prognostisk verdi.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Forventet)

48

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Studer Kontakt Backup

Studiesteder

  • India
    • Uttar Pradesh
      • Lucknow, Uttar Pradesh, India, 226014
        • Rekruttering
        • Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences
        • Ta kontakt med:
        • Ta kontakt med:

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

18 år til 80 år (Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

N/A

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Personer diagnostisert med distalt gastrisk adenokarsinom ved SGPGIMS vil bli rekruttert til denne studien

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Pasienter med opphav til svulst i den distale delen av magen
  • Pasienter som gjennomgikk total eller delvis gastrectomy etter biopsiundersøkelse
  • Tilgjengelighet for oppfølging i Radioterapi eller Gastro avdeling
  • Tilgjengelighet av FFPE gastrektomiprøvevev fra utvalgte tilfeller i histopatologi

Ekskluderingskriterier:

  • Pasienter med opphav til svulst i den proksimale delen av magen
  • Pasienter med kun biopsi tilgjengelig
  • Pasienter hvis oppfølging ikke er tilgjengelig
  • Utilgjengelighet av FFPE-vevsblokker

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
Pasienter med gastrisk adenokarsinom
Pasienter med opphav til tumor i distale del av magen som gjennomgikk total eller partiell gastrectomy etter biopsiundersøkelse med tilgjengelighet av oppfølging og arkivert FFPE-vev vil bli vurdert for denne studien.
Diagnostisk test: Observasjonsstudie
Utforskning av transkriptomiske signaturer relatert til tumormikromiljø som har en betydelig rolle i prognosen for gastriske adenokarsinompasienter

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Transkriptomprofilering av gastrisk adenokarsinom
Tidsramme: Rekkevidde på 6 måneder til 5 år med pasientrekruttering
For å oppnå genekspresjonsdata for kreft og normalt vev gjennom RNA - sekvensering
Rekkevidde på 6 måneder til 5 år med pasientrekruttering
Differensiell genekspresjonsanalyse i gastrisk adenokarsinom
Tidsramme: Rekkevidde på 6 måneder til 5 år med pasientrekruttering
For å bestemme differensielt uttrykt gen mellom tumor og normalt vev gjennom bioinformatisk analyse av genuttrykksdata
Rekkevidde på 6 måneder til 5 år med pasientrekruttering
Påvirkning av tumormikromiljø på genekspresjonsprofil av gastrisk adenokarsinom
Tidsramme: Rekkevidde på 6 måneder til 5 år med pasientrekruttering
For å identifisere tumormikromiljørelaterte gener og deres funksjonelle merknader ved hjelp av bioinformatiske pakker
Rekkevidde på 6 måneder til 5 år med pasientrekruttering
Korrelasjon av tumormikromiljørelaterte gener med pasientens kliniske egenskaper
Tidsramme: Rekkevidde på 6 måneder til 5 år med pasientrekruttering
Å korrelere differensielt uttrykt tumormikromiljørelatert gen med utfall hos pasienter for å identifisere gener som er signifikant relatert til total overlevelse
Rekkevidde på 6 måneder til 5 år med pasientrekruttering

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Pasientrisikostratifisering basert på korrelasjon mellom genuttrykk og total overlevelse
Tidsramme: Rekkevidde på 6 måneder til 5 år med pasientrekruttering
Å stratifisere pasienter basert på gensignaturer relatert til total overlevelse hos gastriske adenokarsinompasienter
Rekkevidde på 6 måneder til 5 år med pasientrekruttering

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Raghavendra Lingaiah, SGPGIMS

Publikasjoner og nyttige lenker

Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.

Generelle publikasjoner

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

6. august 2021

Primær fullføring (Forventet)

6. april 2025

Studiet fullført (Forventet)

6. oktober 2025

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

31. mars 2022

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

31. mars 2022

Først lagt ut (Faktiske)

8. april 2022

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

15. april 2022

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

8. april 2022

Sist bekreftet

1. april 2022

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Nøkkelord

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

  • 2021-240-PhD-EXP-42

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

NEI

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere